GBM MIR4473 X17.AAG 0.751920009978775 0.0209748955405495 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 X17.AAG 0.581843832185209 0.0194610495506997 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 X17.AAG 0.49287802516744 0.0230312249527751 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 X17.AAG 0.125758465635901 0.0889269899786864 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 X17.AAG 0.152057133410226 0.0750358785878826 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 X17.AAG 0.212273393511887 0.0627089069602653 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 X17.AAG 0.174489267445731 0.0676684807340759 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 X17.AAG 0.174489267445731 0.0676684807340759 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 X17.AAG 0.174489267445731 0.0676684807340759 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 X17.AAG 0.174489267445731 0.0676684807340759 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 X17.AAG 0.0971614974666903 0.0917006254951098 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 X17.AAG 0.135827595410774 0.0838748881767883 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 X17.AAG 0.24217171766171 0.0672746676229288 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 X17.AAG 0.250395485401934 0.0630323129286512 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 X17.AAG 0.250395485401934 0.0630323129286512 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 X17.AAG 0.254140721126725 0.0612624243103412 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 X17.AAG 0.221714599010411 0.0613987792508954 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE X17.AAG 0.10474078449252 0.0830120160162169 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 X17.AAG 0.0965720778636061 0.0854057098037151 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG X17.AAG 0.0886112628794574 0.0832836207491936 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A X17.AAG 0.162491194756584 0.0488620693844273 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B X17.AAG 0.396240595195971 0.0152376257977243 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 X17.AAG 0.227387005548607 0.0663133107029998 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 X17.AAG 0.499105317510589 0.0457349619616165 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 X17.AAG 0.559009326210442 0.0193522289548596 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 X17.AAG 0.796886594624901 -0.0101274354884837 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD X17.AAG 0.153187957566283 0.0839978783419641 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 X17.AAG 0.181499393623086 0.065966784976681 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 X17.AAG 0.10474078449252 0.0830120160162169 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP X17.AAG 0.0688775763257293 0.0717577492047301 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 X17.AAG 0.0644153188913471 0.0767657821785486 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 X17.AAG 0.879260462246059 -0.0326466659085538 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN X17.AAG 0.785648904870873 0.0401748609233437 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX X17.AAG 0.183239108000179 -0.135284445014308 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 AEW541 0.522219831488326 0.0200059697909742 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 AEW541 0.759649714225226 0.011380027846539 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 AEW541 0.893040002234703 -0.00282174043589678 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 AEW541 0.731996903823044 -0.0166099923486747 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 AEW541 0.615669729059657 -0.0186902739880435 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 AEW541 0.641224913995922 -0.018590453188075 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 AEW541 0.619001307328766 -0.0195343238155266 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 AEW541 0.619001307328766 -0.0195343238155266 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 AEW541 0.619001307328766 -0.0195343238155266 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 AEW541 0.619001307328766 -0.0195343238155266 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 AEW541 0.389634345581679 -0.0292665957417722 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 AEW541 0.463186921001679 -0.0264859604442105 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 AEW541 0.435280975153811 -0.0267445181976793 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 AEW541 0.545458246709356 -0.0218676402440663 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 AEW541 0.545458246709356 -0.0218676402440663 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 AEW541 0.586462949320688 -0.0189511483400797 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 AEW541 0.462035626817203 -0.0240826361729105 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE AEW541 0.304047062794218 -0.0299697347869703 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 AEW541 0.36323067691348 -0.0269888852667002 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG AEW541 0.28415334778218 -0.029670442600664 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A AEW541 0.0501427068516425 -0.0427859440915568 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B AEW541 0.132239436271514 -0.0339473896134148 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 AEW541 0.790823810135821 -0.0123192230718661 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 AEW541 0.316062466474299 -0.0304371303314284 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 AEW541 0.594870720080031 -0.0151683487161771 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 AEW541 0.720478847748236 -0.0135992228517938 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD AEW541 0.659757298471099 -0.0192036098705175 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 AEW541 0.420629383628538 -0.0254487138775201 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 AEW541 0.304047062794218 -0.0299697347869703 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP AEW541 0.0662766695320838 -0.0413555374128975 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 AEW541 0.825420919521102 -0.0106134566414542 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 AEW541 0.256878536727776 0.037462672909905 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN AEW541 0.467204669816058 0.0151197307693163 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX AEW541 0.373028671422803 0.0557546696787707 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 AZD0530 0.64918973234506 0.0191471862960919 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 AZD0530 0.668420247959876 0.0156931104400008 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 AZD0530 0.757127850388403 0.0133695431067091 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 AZD0530 0.848227475481051 -0.00704164342673474 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 AZD0530 0.668425986539577 -0.012054866565909 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 AZD0530 0.759641983563004 -0.0100161993137473 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 AZD0530 0.660017230652872 -0.0136434831586755 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 AZD0530 0.660017230652872 -0.0136434831586755 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 AZD0530 0.660017230652872 -0.0136434831586755 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 AZD0530 0.660017230652872 -0.0136434831586755 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 AZD0530 0.665365843933541 -0.0147599477776642 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 AZD0530 0.730137900883744 -0.0136780383895569 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 AZD0530 0.595160695262052 -0.0176164122591194 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 AZD0530 0.426376449033419 -0.024872050825606 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 AZD0530 0.426376449033419 -0.024872050825606 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 AZD0530 0.513217128764563 -0.0212962182930754 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 AZD0530 0.536102989862465 -0.0200364117400793 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE AZD0530 0.437210839988085 -0.0219042325832851 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 AZD0530 0.49071467173596 -0.0201333928098146 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG AZD0530 0.62093474947366 -0.013466279933496 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A AZD0530 0.975824554482572 -0.00152493656958697 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B AZD0530 0.790511588037598 -0.00622437827598532 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 AZD0530 0.684756467959005 0.000842435308164302 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 AZD0530 0.701713130184248 0.000566361368853241 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 AZD0530 0.186958698399578 0.0365094137285688 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 AZD0530 0.777568884341775 0.0080972961182082 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD AZD0530 0.852536823388336 -0.00716138493196794 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 AZD0530 0.478742181584795 -0.021168741023692 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 AZD0530 0.437210839988085 -0.0219042325832851 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP AZD0530 0.972357358734105 -0.00233141701152006 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 AZD0530 0.832164289860191 -0.0083038588304456 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 AZD0530 0.208043941520856 0.0579923551479223 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN AZD0530 0.217360002734885 0.0556510977615104 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX AZD0530 0.571924440256652 -0.0360311535956387 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 AZD6244 0.799164190328256 -0.0333068078105647 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 AZD6244 0.62930407027141 -0.0171034388433003 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 AZD6244 0.476074616338122 0.00304079361743259 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 AZD6244 0.226770774883467 0.0645278213356784 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 AZD6244 0.0892399696726161 0.106364992921063 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 AZD6244 0.104398526320259 0.103689798672935 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 AZD6244 0.080119229517702 0.109576135699309 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 AZD6244 0.080119229517702 0.109576135699309 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 AZD6244 0.080119229517702 0.109576135699309 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 AZD6244 0.080119229517702 0.109576135699309 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 AZD6244 0.038684676414542 0.141128628724037 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 AZD6244 0.0574842256836234 0.120578935714888 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 AZD6244 0.144156581980897 0.0930177972584536 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 AZD6244 0.189330112310335 0.0805006170782882 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 AZD6244 0.189330112310335 0.0805006170782882 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 AZD6244 0.14595224155356 0.0892186849021716 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 AZD6244 0.12831458960371 0.0909338654349265 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE AZD6244 0.0546319517794164 0.117319750007864 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 AZD6244 0.0559247038790223 0.116612351488272 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG AZD6244 0.0460097447845947 0.124546069765789 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A AZD6244 0.0711577616679702 0.099135734234541 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B AZD6244 0.180356758702739 0.0441645184010562 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 AZD6244 0.296150195258121 0.0808193909970225 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 AZD6244 0.457186310566759 0.0416286234292478 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 AZD6244 0.426960323547055 0.0244521974883438 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 AZD6244 0.637773324360768 -0.0132036334691399 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD AZD6244 0.277502995699781 0.0595456943316971 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 AZD6244 0.0958219854922532 0.10201322382051 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 AZD6244 0.0546319517794164 0.117319750007864 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP AZD6244 0.0456888606430572 0.114468600552508 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 AZD6244 0.0505656269368967 0.116651960015261 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 AZD6244 0.562932558086684 -0.090334104361823 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN AZD6244 0.750986908874915 -0.037836519890789 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX AZD6244 0.044228473998295 -0.323215308111085 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Erlotinib 0.71707667568579 0.00623558297168492 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Erlotinib 0.822479843753599 0.00205368474800743 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Erlotinib 0.563148220049174 0.00756650161467243 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Erlotinib 0.975893210779549 -0.00148292738211492 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Erlotinib 0.959596264866171 -0.00100925735678953 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Erlotinib 0.951207740523592 -0.00226552101886307 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Erlotinib 0.954244983587792 -0.00246344496718004 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Erlotinib 0.954244983587792 -0.00246344496718004 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Erlotinib 0.954244983587792 -0.00246344496718004 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Erlotinib 0.954244983587792 -0.00246344496718004 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Erlotinib 0.943163787748827 9.07380336926389e-05 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Erlotinib 0.972870471577039 -0.00035355654575786 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Erlotinib 0.869890510499703 -0.00439234252307791 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Erlotinib 0.77163897963942 -0.0060348506375642 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Erlotinib 0.77163897963942 -0.0060348506375642 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Erlotinib 0.858575218960684 -0.00436078712613203 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Erlotinib 0.914368502063814 -0.003560181649024 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Erlotinib 0.900612419992274 -0.000654779088046287 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Erlotinib 0.919647457855766 -0.000778219768719113 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Erlotinib 0.764164430330125 0.00157701796980486 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Erlotinib 0.339094711188995 0.0113285840833459 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Erlotinib 0.432152622161632 0.00957946110119046 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Erlotinib 0.692728527788588 -0.00265761318913182 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Erlotinib 0.874685661899521 0.000647027844871306 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Erlotinib 0.550210804791216 0.0128930111629287 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Erlotinib 0.711103883621732 0.00445023084852197 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Erlotinib 1 -0.000951232124989487 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Erlotinib 0.88466373189209 -0.00400911238097207 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Erlotinib 0.900612419992274 -0.000654779088046287 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Erlotinib 0.408878402193805 0.00958600469639054 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Erlotinib 0.948276874694359 0.0011691183178793 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Erlotinib 0.975772376768473 0.00425589799688947 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Erlotinib 0.927792306854092 0.00429297912583676 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Erlotinib 0.808899358370351 -0.00608373333032081 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Irinotecan 0.883535062307315 -0.0439956765587524 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Irinotecan 0.279701181273271 -0.10265301571597 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Irinotecan 0.183143134322223 -0.119712776822494 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Irinotecan 0.0531192036104807 -0.138937263596223 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Irinotecan 0.0215542536503861 -0.152319134270961 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Irinotecan 0.0124409418802049 -0.164177818920954 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Irinotecan 0.0100997128748302 -0.170618517443928 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Irinotecan 0.0100997128748302 -0.170618517443928 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Irinotecan 0.0100997128748302 -0.170618517443928 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Irinotecan 0.0100997128748302 -0.170618517443928 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Irinotecan 0.00346617393518602 -0.197540347660989 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Irinotecan 0.00587498430192446 -0.188203768473444 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Irinotecan 0.00369166266916985 -0.201816795669077 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Irinotecan 0.00331600804585692 -0.200930559769348 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Irinotecan 0.00331600804585692 -0.200930559769348 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Irinotecan 0.00162263237364868 -0.207687399061759 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Irinotecan 0.00130165466686036 -0.207542595849628 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Irinotecan 0.00196179494839531 -0.205142839102387 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Irinotecan 0.00261499549162272 -0.197813510852867 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Irinotecan 0.00329854951899638 -0.195459707010797 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Irinotecan 0.0440260321478414 -0.139448369450431 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Irinotecan 0.0780006567270616 -0.127049223800972 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Irinotecan 0.0618299577216279 -0.133864058811199 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Irinotecan 0.0109001715195159 -0.167434189046081 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Irinotecan 0.066992441060669 -0.13478738191171 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Irinotecan 0.0323034147161567 -0.1692039838303 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Irinotecan 0.0658770322688123 -0.134202688280512 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Irinotecan 0.00136196842564178 -0.205182695000356 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Irinotecan 0.00196179494839531 -0.205142839102387 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Irinotecan 0.0559240706202959 -0.131592785245685 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Irinotecan 0.0269670006711483 -0.155593071948956 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Irinotecan 0.0665958082837878 0.24914754514199 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Irinotecan 0.169623173449395 0.167694641810716 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Irinotecan 0.535717234262126 0.0488782880243535 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 L.685458 0.409390561865408 -0.0181668311509666 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 L.685458 0.113172439223969 -0.0301072794028455 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 L.685458 0.236716003211229 -0.0235154286003758 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 L.685458 0.0506898763138097 -0.0318520148212196 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 L.685458 0.0674934575009212 -0.0296711469537287 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 L.685458 0.0590955137220089 -0.0304494852053375 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 L.685458 0.0595820116593226 -0.0308264498289488 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 L.685458 0.0595820116593226 -0.0308264498289488 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 L.685458 0.0595820116593226 -0.0308264498289488 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 L.685458 0.0595820116593226 -0.0308264498289488 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 L.685458 0.0762546279937533 -0.0295422567718212 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 L.685458 0.0845796594142221 -0.0293422659400893 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 L.685458 0.0386775302911542 -0.0343396107182602 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 L.685458 0.035166118966059 -0.0360131704191743 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 L.685458 0.035166118966059 -0.0360131704191743 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 L.685458 0.0285459908863979 -0.0369059363390937 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 L.685458 0.0345048897839516 -0.0359368313887917 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE L.685458 0.0523794024581931 -0.0338457296257278 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 L.685458 0.0606769048715116 -0.0328800228438968 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG L.685458 0.0779239849926968 -0.0302861069450204 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A L.685458 0.224397549383822 -0.0213151206739154 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B L.685458 0.159068517389867 -0.0231950906536638 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 L.685458 0.0987406342793186 -0.0282961923185089 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 L.685458 0.0697300847133922 -0.0339669842861883 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 L.685458 0.250584315111915 -0.0232154250208818 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 L.685458 0.0912857377976815 -0.0300614870464193 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD L.685458 0.0577014524399775 -0.0308354921140814 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 L.685458 0.0439313879561117 -0.0346878607119234 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 L.685458 0.0523794024581931 -0.0338457296257278 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP L.685458 0.22299987039602 -0.0211776979340154 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 L.685458 0.0781947249537621 -0.0289405917720019 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 L.685458 0.283929423652132 0.0360755152093766 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN L.685458 0.555099759201926 0.0276153863195207 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX L.685458 0.202176605195854 -0.0249904089771317 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Lapatinib 0.835096904850039 0.00837825305233775 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Lapatinib 0.572556225174018 -0.0186999080407887 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Lapatinib 0.871817559801561 -0.00830961474826147 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Lapatinib 0.694442303005786 -0.0110858197431655 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Lapatinib 0.778761004406487 -0.00972959954189295 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Lapatinib 0.621144831106602 -0.0148164204521697 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Lapatinib 0.619001307328766 -0.0151598042434903 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Lapatinib 0.619001307328766 -0.0151598042434903 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Lapatinib 0.619001307328766 -0.0151598042434903 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Lapatinib 0.619001307328766 -0.0151598042434903 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Lapatinib 0.70730231447448 -0.013231661341755 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Lapatinib 0.701120155205748 -0.0134949141112452 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Lapatinib 0.830982870285651 -0.00959573032578437 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Lapatinib 0.815665461137483 -0.0101863366965108 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Lapatinib 0.815665461137483 -0.0101863366965108 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Lapatinib 0.780453360171374 -0.0110329969214921 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Lapatinib 0.850731051221577 -0.0092955309394403 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Lapatinib 0.81657657704637 -0.00900434112925452 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Lapatinib 0.728920898095135 -0.0105522672611778 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Lapatinib 0.996629004361975 -0.00403815991245526 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Lapatinib 0.896977053475276 -0.000469008634184365 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Lapatinib 0.924901347319552 -0.000467005469465931 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Lapatinib 0.451799512121912 -0.0168922284265381 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Lapatinib 0.710083478015155 -0.0128213222615461 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Lapatinib 0.550210804791216 -0.0189997941702802 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Lapatinib 0.619947724656524 -0.0169508466071421 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Lapatinib 0.769140877958985 -0.00928132363870854 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Lapatinib 0.715170682600001 -0.0128066774937609 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Lapatinib 0.81657657704637 -0.00900434112925452 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Lapatinib 0.755141892381422 0.00280460530086413 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Lapatinib 0.276687717629012 -0.0258564246106956 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Lapatinib 0.483290299685508 0.0314453348350179 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Lapatinib 0.273709743241309 0.0334641834723342 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Lapatinib 0.72673531655225 -0.0207243553056346 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 LBW242 0.671530629239459 0.00953380315882524 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 LBW242 0.886469953380299 -0.000889408425050364 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 LBW242 0.572260267765388 0.0143702381485531 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 LBW242 0.959832884386933 -0.00340710585641102 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 LBW242 0.981628433498144 -0.000903122210526797 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 LBW242 0.913789791775773 0.000956306441550647 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 LBW242 0.825914232239866 0.00344536674535068 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 LBW242 0.825914232239866 0.00344536674535068 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 LBW242 0.825914232239866 0.00344536674535068 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 LBW242 0.825914232239866 0.00344536674535068 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 LBW242 0.55243420584915 0.0161286649542565 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 LBW242 0.505671601911248 0.0181806745459362 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 LBW242 0.52165848219378 0.0164921950352543 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 LBW242 0.545458246709356 0.0150861061439634 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 LBW242 0.545458246709356 0.0150861061439634 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 LBW242 0.561521871552539 0.0141257834086455 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 LBW242 0.462035626817203 0.0171710223696377 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE LBW242 0.343595888912455 0.0224543313518576 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 LBW242 0.39667839153828 0.0204888574979394 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG LBW242 0.367493999522406 0.0205678251429038 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A LBW242 0.0686070349434961 0.0322761261514806 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B LBW242 0.0590140636551366 0.0328472483371752 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 LBW242 0.413713966782549 0.017829877879153 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 LBW242 0.250544912922772 0.0287669664880085 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 LBW242 0.308856270978105 0.0306095468871057 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 LBW242 0.683244974271693 0.0105592585502935 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD LBW242 0.984389116016789 -0.00133740661330761 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 LBW242 0.451804730434941 0.0173667081362407 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 LBW242 0.343595888912455 0.0224543313518576 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP LBW242 0.189859499834064 0.0234054646022833 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 LBW242 0.649642428072707 0.00528821625985632 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 LBW242 0.283929423652132 0.0465320276689961 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN LBW242 0.217360002734885 0.0491497249987022 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX LBW242 1 -0.00125189112280633 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Nilotinib 0.775438199571385 0.0150616746305294 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Nilotinib 0.718600153946971 -0.0105228885511529 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Nilotinib 0.914339315441841 0.00795383077114642 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Nilotinib 0.871965377165439 -0.0060271278202878 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Nilotinib 0.807160949295597 -0.00475972878000241 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Nilotinib 0.752484661561243 -0.00702352886906144 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Nilotinib 0.737852579472311 -0.00731388828799784 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Nilotinib 0.737852579472311 -0.00731388828799784 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Nilotinib 0.737852579472311 -0.00731388828799784 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Nilotinib 0.737852579472311 -0.00731388828799784 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Nilotinib 0.897888488963156 -7.64409619493644e-05 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Nilotinib 0.941905515587345 0.000844005723227736 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Nilotinib 0.746936553938412 -0.00705937661998246 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Nilotinib 0.685857630659945 -0.00980260728763149 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Nilotinib 0.685857630659945 -0.00980260728763149 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Nilotinib 0.611899988954269 -0.0131270277615653 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Nilotinib 0.641116455558346 -0.0117338833571636 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Nilotinib 0.837429524255335 -0.00447276892078297 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Nilotinib 0.836671006940356 -0.0047200307649109 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Nilotinib 0.849204366868992 -0.0029763550180264 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Nilotinib 0.776597186565664 0.00901239680947563 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Nilotinib 0.965824147495641 0.00332593567349726 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Nilotinib 0.599535278385275 -0.0142799292069454 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Nilotinib 0.542982998791222 -0.0185527495994871 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Nilotinib 0.984285909676857 -0.000117841313335587 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Nilotinib 0.855544891216629 -0.00601749185786449 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Nilotinib 0.883329805152615 -0.00495446310182945 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Nilotinib 0.689073284527986 -0.00958350014973841 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Nilotinib 0.837429524255335 -0.00447276892078297 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Nilotinib 0.826290415652393 0.00694398325909651 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Nilotinib 0.662153499931557 -0.00851211778592575 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Nilotinib 0.784444254090236 0.0496114608907684 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Nilotinib 0.820727223002092 0.0390523537826598 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Nilotinib 0.0579512720419976 -0.0912380195599299 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Nutlin.3 0.182261386770207 0.017934972083855 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Nutlin.3 0.256215996466311 0.0133660039962324 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Nutlin.3 0.146459314100074 0.0179719108672832 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Nutlin.3 0.144142931160433 0.0141159803451633 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Nutlin.3 0.0608713682748289 0.0171328698763291 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Nutlin.3 0.0807633603862809 0.0159262600536461 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Nutlin.3 0.0608875370480356 0.0171060016664458 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Nutlin.3 0.0608875370480356 0.0171060016664458 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Nutlin.3 0.0608875370480356 0.0171060016664458 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Nutlin.3 0.0608875370480356 0.0171060016664458 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Nutlin.3 0.0298488850091492 0.0220450738717901 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Nutlin.3 0.0427722111173527 0.020394713927916 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Nutlin.3 0.120886674616336 0.0144328816920598 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Nutlin.3 0.147827391033686 0.0128861003141204 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Nutlin.3 0.147827391033686 0.0128861003141204 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Nutlin.3 0.135967760828216 0.0135869726862883 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Nutlin.3 0.0993551011071342 0.0154616657049886 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Nutlin.3 0.0395373586766907 0.0191872525467136 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Nutlin.3 0.0416432640466088 0.0189217313107783 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Nutlin.3 0.0252476534540317 0.0206248194643542 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Nutlin.3 0.00824269371526267 0.0242271134302791 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Nutlin.3 0.0276445543106979 0.0178034940422497 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Nutlin.3 0.0260962408071096 0.0221026597426096 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Nutlin.3 0.0614859204173984 0.0214008838531652 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Nutlin.3 0.066992441060669 0.0243154109941257 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Nutlin.3 0.245502831618119 0.0132572425459569 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Nutlin.3 0.144920230320846 0.0140545553220128 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Nutlin.3 0.0777785091938329 0.0164656838461209 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Nutlin.3 0.0395373586766907 0.0191872525467136 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Nutlin.3 0.0103403017194034 0.0239541258251615 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Nutlin.3 0.0160432583287759 0.0219189381442463 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Nutlin.3 0.648161906743142 0.0164344660073029 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Nutlin.3 0.650117354340668 0.0261038772738006 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Nutlin.3 0.244076816081124 -0.0323651210200027 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Paclitaxel 0.49259509399583 -0.0333458178223403 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Paclitaxel 0.854355126534943 0.00309912644851629 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Paclitaxel 0.871817559801561 0.00411356393854678 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Paclitaxel 0.785651390886108 0.0170642706285422 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Paclitaxel 0.354601578560796 0.0415065024747223 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Paclitaxel 0.252712437972797 0.0517812959203612 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Paclitaxel 0.23950460093743 0.0530057270705839 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Paclitaxel 0.23950460093743 0.0530057270705839 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Paclitaxel 0.23950460093743 0.0530057270705839 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Paclitaxel 0.23950460093743 0.0530057270705839 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Paclitaxel 0.160880937082144 0.0682334698262759 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Paclitaxel 0.201339964647991 0.0650441481114488 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Paclitaxel 0.250324780806002 0.0629327378701614 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Paclitaxel 0.357770856371657 0.0488248245224359 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Paclitaxel 0.357770856371657 0.0488248245224359 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Paclitaxel 0.290257983131718 0.0532581865550643 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Paclitaxel 0.232132956871306 0.0586634721996768 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Paclitaxel 0.275441281970545 0.0538414884546059 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Paclitaxel 0.251206874651354 0.0546711606623926 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Paclitaxel 0.168315614833005 0.0607746188869838 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Paclitaxel 0.385504798392016 0.0249582689397831 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Paclitaxel 0.662088803459463 0.00490299845392084 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Paclitaxel 0.142390980374094 0.0595734440006073 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Paclitaxel 0.321530680330807 0.0474422674917498 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Paclitaxel 0.178337692140103 0.0783580842825371 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Paclitaxel 0.974960412055736 0.00851810905351247 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Paclitaxel 0.821966994148532 0.0147876516019974 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Paclitaxel 0.239375645054327 0.0569965266650865 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Paclitaxel 0.275441281970545 0.0538414884546059 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Paclitaxel 0.277586135272118 0.0369594688663932 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Paclitaxel 0.131869366552042 0.062718175900045 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Paclitaxel 0.831546431761804 0.108525544223905 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Paclitaxel 0.495646351599373 0.154766638258207 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Paclitaxel 0.373028671422803 -0.0612774744578175 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Panobinostat 0.319937716444721 -0.0462505133227555 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Panobinostat 0.267781670980657 -0.0464501663748482 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Panobinostat 0.306835417387555 -0.0434219998241625 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Panobinostat 0.186995873304766 -0.0454196700546401 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Panobinostat 0.134450607955057 -0.0440779744651625 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Panobinostat 0.117018815630535 -0.0459885543831531 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Panobinostat 0.128388575336017 -0.0459907203258378 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Panobinostat 0.128388575336017 -0.0459907203258378 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Panobinostat 0.128388575336017 -0.0459907203258378 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Panobinostat 0.128388575336017 -0.0459907203258378 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Panobinostat 0.194441874537306 -0.0390941391343391 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Panobinostat 0.226383852553915 -0.0369483647854789 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Panobinostat 0.218826242974816 -0.0385117062063207 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Panobinostat 0.164683775063857 -0.050529399653203 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Panobinostat 0.164683775063857 -0.050529399653203 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Panobinostat 0.294471993734053 -0.0401561693424162 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Panobinostat 0.332339157801101 -0.0373901139401358 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Panobinostat 0.453214862520359 -0.032955415012168 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Panobinostat 0.437073509861354 -0.0328479123852743 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Panobinostat 0.399903356988027 -0.0347267704283816 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Panobinostat 0.625819055851137 -0.0220701468625144 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Panobinostat 0.389910264489897 -0.0355418749836511 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Panobinostat 0.188382610006698 -0.0550594107495996 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Panobinostat 0.457186310566759 -0.0384427437771766 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Panobinostat 0.49059752098347 -0.0223893195480196 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Panobinostat 0.127149772978332 -0.0589464518882901 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Panobinostat 0.225080663716382 -0.0411324938480471 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Panobinostat 0.362166250462638 -0.0357025623343743 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Panobinostat 0.453214862520359 -0.032955415012168 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Panobinostat 0.529016175892858 -0.0251494359749014 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Panobinostat 0.188701564047314 -0.0463165873381222 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Panobinostat 0.409951873405905 0.0569434105237621 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Panobinostat 0.495646351599373 0.0408826071424278 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Panobinostat 0.0659797191187688 -0.144496180848929 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 PD.0325901 0.445292348615443 -0.00268581946294466 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 PD.0325901 0.285794188512892 0.0239510318358864 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 PD.0325901 0.206262269855664 0.0408367874781656 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 PD.0325901 0.0439537232919507 0.156725970380622 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 PD.0325901 0.0156114477289902 0.199512765745334 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 PD.0325901 0.0213525128353632 0.190929953517046 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 PD.0325901 0.0147476570598607 0.204831305711031 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 PD.0325901 0.0147476570598607 0.204831305711031 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 PD.0325901 0.0147476570598607 0.204831305711031 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 PD.0325901 0.0147476570598607 0.204831305711031 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 PD.0325901 0.00609842756039405 0.246973314274319 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 PD.0325901 0.00934381603603713 0.222903262366764 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 PD.0325901 0.0285181930405881 0.186734480483661 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 PD.0325901 0.0296401422308594 0.178844466814433 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 PD.0325901 0.0296401422308594 0.178844466814433 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 PD.0325901 0.0197630334456929 0.187287819499734 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 PD.0325901 0.016396509730164 0.188386652180991 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE PD.0325901 0.00474083541470465 0.232360935565685 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 PD.0325901 0.00458400764970132 0.232987780137378 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG PD.0325901 0.00425151524997677 0.232023948826196 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A PD.0325901 0.0318666922812317 0.176874862979589 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B PD.0325901 0.0924860960053571 0.0803570435031537 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 PD.0325901 0.105552426765703 0.164473501001597 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 PD.0325901 0.219491408464147 0.0878766770063342 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 PD.0325901 0.296538070842609 0.0102130551312689 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 PD.0325901 0.330545201312812 0.0090401509176149 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD PD.0325901 0.0590023349002297 0.148983815128631 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 PD.0325901 0.0116922501254475 0.205166845867839 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 PD.0325901 0.00474083541470465 0.232360935565685 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP PD.0325901 0.0152818727017845 0.206240960964221 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 PD.0325901 0.0068544023625419 0.222306790134504 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 PD.0325901 0.604912653640612 -0.216290126213728 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN PD.0325901 0.683161815450818 -0.111685696959839 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX PD.0325901 0.0579512720419976 -0.4749725918014 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 PD.0332991 0.350868432966597 0.0201702859031204 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 PD.0332991 0.688330014844647 0.00787809169897347 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 PD.0332991 0.647556766238047 0.00731814287984833 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 PD.0332991 0.456043971907627 0.00568154694229761 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 PD.0332991 0.430967952379413 0.00325986724664551 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 PD.0332991 0.549985997106091 -0.00102657654758742 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 PD.0332991 0.572613986308143 -0.00145838999295911 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 PD.0332991 0.572613986308143 -0.00145838999295911 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 PD.0332991 0.572613986308143 -0.00145838999295911 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 PD.0332991 0.572613986308143 -0.00145838999295911 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 PD.0332991 0.644773930569449 -0.00343077122419977 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 PD.0332991 0.715577660932029 -0.00465573790442264 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 PD.0332991 0.980201319402583 -0.00865971591297621 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 PD.0332991 0.973435385630423 -0.00836885659056186 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 PD.0332991 0.973435385630423 -0.00836885659056186 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 PD.0332991 0.837098910549049 -0.0112505981616378 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 PD.0332991 0.857762261354081 -0.0112300817062587 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE PD.0332991 0.872429796185887 -0.0094442239905197 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 PD.0332991 0.919647457855766 -0.00869928341544657 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG PD.0332991 0.895793751574258 -0.00502007870416898 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A PD.0332991 0.649425113236667 -0.000848623774015844 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B PD.0332991 0.839287234382957 -0.0050857534675055 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 PD.0332991 0.716846576596383 0.000261998529775043 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 PD.0332991 0.628106511080215 -0.0126218502151019 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 PD.0332991 0.797914125752088 -0.0135983944634017 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 PD.0332991 0.974960412055736 -0.00400535407631342 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD PD.0332991 0.475115550745248 0.00571780337118011 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 PD.0332991 0.82945431011023 -0.0116869261117708 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 PD.0332991 0.872429796185887 -0.0094442239905197 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP PD.0332991 0.422108969274256 0.00274832766577005 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 PD.0332991 0.606636364470038 -0.00179690579133851 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 PD.0332991 0.692606895056754 0.0132721745612983 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN PD.0332991 0.750986908874915 0.00926014384103091 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX PD.0332991 0.267086193745233 -0.0354049108440911 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 PF2341066 0.0588995767038693 0.0460378539142517 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 PF2341066 0.0448976643340198 0.042166182962591 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 PF2341066 0.0325256223313937 0.0441610648172991 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 PF2341066 0.00963464141864217 0.0500508415429712 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 PF2341066 0.00448907900971772 0.0525902879307729 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 PF2341066 0.00624312914840155 0.0504108364546656 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 PF2341066 0.00343107508976427 0.0547643752620056 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 PF2341066 0.00343107508976427 0.0547643752620056 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 PF2341066 0.00343107508976427 0.0547643752620056 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 PF2341066 0.00343107508976427 0.0547643752620056 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 PF2341066 0.00129207186713502 0.0628334544452399 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 PF2341066 0.00190614533230677 0.0598554437550737 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 PF2341066 0.00873525256013116 0.0494694166307389 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 PF2341066 0.0065838451850296 0.0496967294579073 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 PF2341066 0.0065838451850296 0.0496967294579073 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 PF2341066 0.0050253674259738 0.050343191875461 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 PF2341066 0.00428194729634588 0.0505827877598817 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE PF2341066 0.000921429936874877 0.0612241490953164 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 PF2341066 0.00094428930844893 0.061124745813382 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG PF2341066 0.00261791354899029 0.0550174191972511 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A PF2341066 0.0555351200035267 0.0311176355496768 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B PF2341066 0.12789191462144 0.018720055604965 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 PF2341066 0.0164850818311685 0.0516346964839169 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 PF2341066 0.0663295681846657 0.0378533140993509 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 PF2341066 0.051187976206342 0.0445202005441648 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 PF2341066 0.0388940974138989 0.0397873593656353 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD PF2341066 0.0112809476664331 0.048297661908998 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 PF2341066 0.00279763505643436 0.054941564117529 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 PF2341066 0.000921429936874877 0.0612241490953164 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP PF2341066 0.0335604829959484 0.0352625234998071 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 PF2341066 0.00492194853039678 0.0564711023171864 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 PF2341066 0.130553656869446 0.0802611328551143 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN PF2341066 0.0977211784790194 0.0843385143927419 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX PF2341066 0.50066855117333 -0.052802146058576 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 PHA.665752 0.350868432966597 0.0272760415544299 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 PHA.665752 0.500902899749936 0.0167074277725084 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 PHA.665752 0.288134742258557 0.0291472586823432 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 PHA.665752 0.255032594748256 0.0252635800076926 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 PHA.665752 0.162877420853094 0.030792862514238 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 PHA.665752 0.176730297806405 0.0301063370159508 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 PHA.665752 0.140839195406978 0.0325059902411923 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 PHA.665752 0.140839195406978 0.0325059902411923 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 PHA.665752 0.140839195406978 0.0325059902411923 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 PHA.665752 0.140839195406978 0.0325059902411923 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 PHA.665752 0.0716459702944643 0.0421567046618144 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 PHA.665752 0.0845796594142221 0.0409910048799884 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 PHA.665752 0.186876197007447 0.0306764221749193 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 PHA.665752 0.195891360522846 0.0287178759110027 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 PHA.665752 0.195891360522846 0.0287178759110027 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 PHA.665752 0.194636821055756 0.0281030768186639 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 PHA.665752 0.152691198403802 0.0305923487692569 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE PHA.665752 0.0657782390835545 0.0407101660316929 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 PHA.665752 0.0697867637155798 0.0395797203435819 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG PHA.665752 0.056250998614891 0.0411015826816558 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A PHA.665752 0.0702990177004569 0.0364018079271053 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B PHA.665752 0.157384187878723 0.0281943491511228 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 PHA.665752 0.157710326519486 0.028408399481181 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 PHA.665752 0.236879799361176 0.0252163442294732 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 PHA.665752 0.278685015727536 0.027722742587637 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 PHA.665752 0.318218071234395 0.0261885207816438 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD PHA.665752 0.2483244084433 0.0259524703754606 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 PHA.665752 0.114962545944995 0.0340594252348518 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 PHA.665752 0.0657782390835545 0.0407101660316929 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP PHA.665752 0.0605215174659963 0.0383014147551092 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 PHA.665752 0.10889821563465 0.0330326283062256 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 PHA.665752 0.409951873405905 0.0520907473947726 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN PHA.665752 0.439662455371164 0.0567380142418317 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX PHA.665752 0.291477542962265 -0.0562180591249083 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 PLX4720 0.871377255701212 -0.00183371070570404 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 PLX4720 0.983727431743366 -0.000373328898268355 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 PLX4720 0.946399188082638 0.000228094215812935 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 PLX4720 0.512646207683942 0.0154717053910539 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 PLX4720 0.409723580848998 0.0191220694551363 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 PLX4720 0.531300028360576 0.0149311894599374 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 PLX4720 0.438583259826619 0.0177026512853701 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 PLX4720 0.438583259826619 0.0177026512853701 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 PLX4720 0.438583259826619 0.0177026512853701 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 PLX4720 0.438583259826619 0.0177026512853701 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 PLX4720 0.259977269629147 0.0257958878925613 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 PLX4720 0.319269785006144 0.0238794448531026 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 PLX4720 0.271529198601807 0.0244448903910132 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 PLX4720 0.216559787833531 0.0254403370621636 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 PLX4720 0.216559787833531 0.0254403370621636 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 PLX4720 0.246554094366273 0.02325623383982 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 PLX4720 0.228622664903147 0.0235708339465823 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE PLX4720 0.10474078449252 0.0317631547096354 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 PLX4720 0.107768427810635 0.0316394749948692 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG PLX4720 0.0750690707137275 0.0335082491257253 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A PLX4720 0.00676734087343464 0.0473368440985589 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B PLX4720 0.027243803905894 0.0364905937079221 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 PLX4720 0.271831063455268 0.028041709273163 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 PLX4720 0.804266469371253 0.011632966144979 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 PLX4720 0.931983793070821 -0.000149279825647386 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 PLX4720 0.637773324360768 -0.013569296747755 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD PLX4720 0.512158265909711 0.0150900731837286 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 PLX4720 0.181499393623086 0.0261897287130085 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 PLX4720 0.10474078449252 0.0317631547096354 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP PLX4720 0.00500363636845055 0.0494104144199199 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 PLX4720 0.0308713598312937 0.0398380582865787 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 PLX4720 0.784444254090236 0.0179365792462026 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN PLX4720 0.650117354340668 0.0175842585478744 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX PLX4720 0.267086193745233 -0.0403759666611852 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 RAF265 0.728629961441752 0.0167218656936159 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 RAF265 0.698367563081123 0.0141873952478855 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 RAF265 0.459590140406898 0.025080787567775 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 RAF265 0.158488812130526 0.0463441602789767 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 RAF265 0.0481831993832699 0.0631227886359105 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 RAF265 0.0685179854878151 0.0590078630441346 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 RAF265 0.0595820116593226 0.0604156398077553 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 RAF265 0.0595820116593226 0.0604156398077553 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 RAF265 0.0595820116593226 0.0604156398077553 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 RAF265 0.0595820116593226 0.0604156398077553 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 RAF265 0.0277638250271598 0.0714506064315275 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 RAF265 0.0408192915049865 0.067012815278543 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 RAF265 0.049318167942921 0.0638458898899723 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 RAF265 0.0511192384631164 0.0610510845447121 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 RAF265 0.0511192384631164 0.0610510845447121 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 RAF265 0.0423179647952567 0.0617659159148871 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 RAF265 0.0293699866933553 0.0683780906651148 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE RAF265 0.00811182667998662 0.0815364543875252 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 RAF265 0.00867458002602321 0.0803504621927766 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG RAF265 0.00622897689281103 0.082079142710044 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A RAF265 0.0395976675632659 0.0528445646231908 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B RAF265 0.111604699406394 0.0326736114292545 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 RAF265 0.110297119013065 0.0610221163109139 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 RAF265 0.162456830155321 0.0582893699461977 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 RAF265 0.219553918247874 0.0490344521503328 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 RAF265 0.787211372643887 0.00541080895504198 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD RAF265 0.193197452596603 0.0442295958329508 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 RAF265 0.0212568215561796 0.0713761472021495 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 RAF265 0.00811182667998662 0.0815364543875252 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP RAF265 0.0165410824652955 0.0680769914306116 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 RAF265 0.0344820551250969 0.0629240024948907 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 RAF265 0.648161906743142 -0.0196013224328559 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN RAF265 0.927792306854092 0.0234563781720862 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX RAF265 0.00621662852784134 -0.176505462436009 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Sorafenib 0.85924976419915 0.000571596323182266 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Sorafenib 0.972882395249344 -0.00358635046443617 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Sorafenib 0.696588505942674 0.0043096334783389 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Sorafenib 0.793406911065888 0.000679970223158965 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Sorafenib 0.534113350456084 0.00591730208207081 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Sorafenib 0.627807864960066 0.00358214622566883 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Sorafenib 0.54686985184645 0.00464250389977966 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Sorafenib 0.54686985184645 0.00464250389977966 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Sorafenib 0.54686985184645 0.00464250389977966 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Sorafenib 0.54686985184645 0.00464250389977966 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Sorafenib 0.410930521666949 0.00978350812706996 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Sorafenib 0.475118421282343 0.00808190134666481 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Sorafenib 0.754471532293914 0.00149645224100203 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Sorafenib 0.749885956332975 0.00140484183876932 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Sorafenib 0.749885956332975 0.00140484183876932 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Sorafenib 0.787477895473184 -0.000209408627500074 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Sorafenib 0.66049760935042 0.00275435500549831 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Sorafenib 0.416381261300954 0.00864248640398763 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Sorafenib 0.386939301257852 0.00946162416261215 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Sorafenib 0.315833627784 0.0120037383352273 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Sorafenib 0.429142067268738 0.00693384683551945 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Sorafenib 0.695554443098617 0.00111370406692451 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Sorafenib 0.413713966782549 0.0123887625788286 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Sorafenib 0.856964546126205 0.00167888288729706 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Sorafenib 0.737752269718789 0.00576140606094783 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Sorafenib 0.994991293008532 -0.00454262861874133 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Sorafenib 0.821966994148532 0.000518006606120225 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Sorafenib 0.546782996750739 0.00538898871774701 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Sorafenib 0.416381261300954 0.00864248640398763 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Sorafenib 0.275038346269459 0.0117230862243966 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Sorafenib 0.347250197034127 0.011939157722219 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Sorafenib 0.648161906743142 0.0216318004402438 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Sorafenib 0.650117354340668 0.0304406996879389 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Sorafenib 0.0210589132678243 -0.0649339613863626 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 TAE684 0.694165586610244 -0.0371551989989631 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 TAE684 0.668420247959876 -0.0340763817669496 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 TAE684 0.736760528217066 -0.0311311256089373 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 TAE684 0.919767500541803 -0.00629341799516703 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 TAE684 0.498402819469605 0.0122753973693686 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 TAE684 0.581831301932183 0.00993750126457082 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 TAE684 0.509360320571261 0.0124148678961762 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 TAE684 0.509360320571261 0.0124148678961762 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 TAE684 0.509360320571261 0.0124148678961762 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 TAE684 0.509360320571261 0.0124148678961762 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 TAE684 0.571666480132899 0.00945664548382363 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 TAE684 0.55662689208296 0.0106248902151473 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 TAE684 0.574657359985582 0.00676705942083622 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 TAE684 0.577584988201166 0.0058120934845951 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 TAE684 0.577584988201166 0.0058120934845951 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 TAE684 0.495671142648421 0.00767152308175723 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 TAE684 0.489835383540465 0.00769935421662926 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE TAE684 0.299845203410277 0.0156659153356367 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 TAE684 0.327215275569885 0.0149954016499247 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG TAE684 0.280348513189635 0.0145451376316927 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A TAE684 0.945090809442816 -0.00482820844666665 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B TAE684 0.755535362955762 -0.0235049630287609 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 TAE684 0.577153473761649 0.0166232848622114 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 TAE684 0.910308288562431 -0.0029602307776857 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 TAE684 0.550210804791216 -0.0261133208403181 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 TAE684 0.396735536824416 -0.0426415232094828 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD TAE684 0.914300110025266 -0.00568808342401295 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 TAE684 0.400558954730209 0.0125429990115122 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 TAE684 0.299845203410277 0.0156659153356367 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP TAE684 0.720291616864214 0.00394712503456152 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 TAE684 0.3517261616152 0.0117499176054228 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 TAE684 0.375819227212416 0.0241553513589441 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN TAE684 0.467204669816058 0.0145638023565957 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX TAE684 0.434242383452237 -0.113133318293834 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 TKI258 0.383630551511647 0.0155782605464703 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 TKI258 0.536126989678343 0.0100028772314957 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 TKI258 0.253081151795808 0.0239770173821654 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 TKI258 0.133400510882527 0.0225781076128941 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 TKI258 0.0596137418641998 0.0285609706445833 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 TKI258 0.0857907199578128 0.0247963174695063 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 TKI258 0.0784828619749588 0.0256899380694726 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 TKI258 0.0784828619749588 0.0256899380694726 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 TKI258 0.0784828619749588 0.0256899380694726 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 TKI258 0.0784828619749588 0.0256899380694726 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 TKI258 0.0566598482959261 0.0301223328338036 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 TKI258 0.0794544085940948 0.0271911667288522 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 TKI258 0.218826242974816 0.0157792623038291 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 TKI258 0.209504745272717 0.0167992505368757 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 TKI258 0.209504745272717 0.0167992505368757 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 TKI258 0.201059704817194 0.0169588992169951 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 TKI258 0.163362773572086 0.0187148848426122 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE TKI258 0.0756738555879765 0.0262662474102262 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 TKI258 0.0670773204329613 0.0271147215884879 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG TKI258 0.0499025952382885 0.0291017189748415 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A TKI258 0.167521249411473 0.0163754473598374 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B TKI258 0.305149950321709 0.0102863899571235 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 TKI258 0.170840015155021 0.0183933879381988 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 TKI258 0.332651306040525 0.0115000141443817 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 TKI258 0.284552953760641 0.0150606176975501 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 TKI258 0.501777806945868 0.0098495445611495 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD TKI258 0.158895947079305 0.0207161359029981 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 TKI258 0.123404073706556 0.0221077171479473 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 TKI258 0.0756738555879765 0.0262662474102262 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP TKI258 0.0842005308872257 0.0226596975695268 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 TKI258 0.0401314359802491 0.0288992083384216 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 TKI258 0.648161906743142 0.0245532156973569 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN TKI258 0.555099759201926 0.0374737642673053 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX TKI258 0.0507161125319693 -0.0694602866018237 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 Topotecan 0.542466456782245 0.0158955853687899 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 Topotecan 0.619679960251538 0.0104003289027981 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 Topotecan 0.527416225805842 0.020346764380228 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 Topotecan 0.506181292305252 0.025324129377382 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 Topotecan 0.345107034008903 0.043472581285712 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 Topotecan 0.454217040605946 0.0267323372097601 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 Topotecan 0.432951731641135 0.0281836427850819 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 Topotecan 0.432951731641135 0.0281836427850819 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 Topotecan 0.432951731641135 0.0281836427850819 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 Topotecan 0.432951731641135 0.0281836427850819 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 Topotecan 0.565220450693071 0.0164704178588635 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 Topotecan 0.637455845523658 0.0117324103406378 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 Topotecan 0.846502368687622 -0.0063697346162499 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 Topotecan 0.692872481157628 0.00553279333553558 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 Topotecan 0.692872481157628 0.00553279333553558 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 Topotecan 0.72493768631902 0.00387114942481404 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 Topotecan 0.628327789067217 0.0123422767379964 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE Topotecan 0.526211111944312 0.0251966255847247 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 Topotecan 0.447526493562957 0.0302632659594964 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG Topotecan 0.381180437005738 0.0372357274536372 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A Topotecan 0.583535297265062 0.023466600092787 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B Topotecan 0.721053220898552 0.0108799733605904 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 Topotecan 0.188382610006698 0.0672285439556841 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 Topotecan 0.786883881679075 0.0160244373138236 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 Topotecan 0.631747642672837 0.030845259884579 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 Topotecan 0.777568884341775 -0.0130032463364032 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD Topotecan 0.512158265909711 0.0229036720997837 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 Topotecan 0.564503827375818 0.0161703947706355 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 Topotecan 0.526211111944312 0.0251966255847247 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP Topotecan 0.380026874369 0.0455392446861476 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 Topotecan 0.171678318299407 0.0623837839430847 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 Topotecan 0.147519461289821 0.204715256960025 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN Topotecan 0.0799110948727317 0.209480718475713 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX Topotecan 0.72673531655225 -0.0649145838387617 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX GBM MIR4473 ZD.6474 0.305162340977445 0.0342909235639255 11 0.0714285714285714 740 NR_039684 chr9 - 20411145 20411236 20411236 20411236 1 MIR4473 GBM MIR4474 ZD.6474 0.563339606984492 0.016183259465564 14 0.0909090909090909 741 NR_039685 chr9 - 20502262 20502340 20502340 20502340 1 MIR4474 GBM MLLT3 ZD.6474 0.396945664553881 0.0235985852762424 15 0.0974025974025974 92 NM_001286691 chr9 - 20341662 20621986 20346440 20621774 11 MLLT3 GBM IFNB1 ZD.6474 0.437988291528245 0.0197450493071953 25 0.162337662337662 745 NM_002176 chr9 - 21077103 21077962 21077304 21077868 1 IFNB1 GBM IFNW1 ZD.6474 0.287389902447127 0.02791843566879 32 0.207792207792208 746 NM_002177 chr9 - 21140630 21141900 21140981 21141569 1 IFNW1 GBM IFNA21 ZD.6474 0.32523844192212 0.0253860748622012 31 0.201298701298701 746 NM_002175 chr9 - 21165635 21166659 21166041 21166611 1 IFNA21 GBM IFNA4 ZD.6474 0.263204535328206 0.0278727194164656 31 0.201298701298701 746 NM_021068 chr9 - 21186617 21187598 21186960 21187530 1 IFNA4 GBM IFNA7 ZD.6474 0.263204535328206 0.0278727194164656 31 0.201298701298701 746 NM_021057 chr9 - 21201467 21202204 21201594 21202164 1 IFNA7 GBM IFNA10 ZD.6474 0.263204535328206 0.0278727194164656 31 0.201298701298701 746 NM_002171 chr9 - 21206179 21207142 21206526 21207096 1 IFNA10 GBM IFNA16 ZD.6474 0.263204535328206 0.0278727194164656 31 0.201298701298701 746 NM_002173 chr9 - 21216371 21217310 21216734 21217304 1 IFNA16 GBM IFNA17 ZD.6474 0.141926130845855 0.0371737501097111 32 0.207792207792208 746 NM_021268 chr9 - 21227241 21228221 21227602 21228172 1 IFNA17 GBM IFNA14 ZD.6474 0.191248951292687 0.0336801629544143 31 0.201298701298701 747 NM_002172 chr9 - 21239200 21239978 21239364 21239934 1 IFNA14 GBM IFNA5 ZD.6474 0.293916738982092 0.0254272052663957 32 0.207792207792208 747 NM_002169 chr9 - 21304612 21305312 21304685 21305255 1 IFNA5 GBM KLHL9 ZD.6474 0.333325077166778 0.0225976718916143 34 0.220779220779221 747 NM_018847 chr9 - 21331017 21335429 21333004 21334858 1 KLHL9 GBM IFNA6 ZD.6474 0.333325077166778 0.0225976718916143 34 0.220779220779221 747 NM_021002 chr9 - 21350316 21350886 21350316 21350886 1 IFNA6 GBM IFNA13 ZD.6474 0.348189386939103 0.0211187562932156 36 0.233766233766234 748 NM_006900 chr9 - 21367370 21368075 21367436 21368009 1 IFNA13 GBM IFNA2 ZD.6474 0.37433434149055 0.0195891721321355 37 0.24025974025974 748 NM_000605 chr9 - 21384253 21385396 21384761 21385328 1 IFNA2 GBM IFNE ZD.6474 0.227271298043775 0.027277205542459 39 0.253246753246753 748 NM_176891 chr9 - 21480838 21482312 21481066 21481693 1 IFNE GBM MIR31 ZD.6474 0.226552629975999 0.0268067651811215 39 0.253246753246753 749 NR_029505 chr9 - 21512113 21512184 21512184 21512184 1 MIR31 GBM MIR31HG ZD.6474 0.134335227921617 0.0340383240086686 42 0.272727272727273 93 NR_027054 chr9 - 21454266 21559697 21559697 21559697 4 MIR31HG GBM CDKN2A ZD.6474 0.0694487951269297 0.0403932316356017 81 0.525974025974026 752 NM_001195132 chr9 - 21967750 21975132 21968723 21974826 4 CDKN2A GBM CDKN2B ZD.6474 0.184101563952804 0.0266468181815647 76 0.493506493506494 752 NM_078487 chr9 - 22002901 22009312 22008715 22008952 2 CDKN2B GBM ELAVL2 ZD.6474 0.199526986769094 0.0313985686535752 24 0.155844155844156 95 NM_001171195 chr9 - 23690102 23821843 23692554 23762232 6 ELAVL2 GBM IZUMO3 ZD.6474 0.636121362604084 0.0112746474739351 21 0.136363636363636 772 NM_001271706 chr9 - 24543212 24545674 24543226 24545647 6 IZUMO3 GBM TUSC1 ZD.6474 0.559009326210442 0.0186931070051886 16 0.103896103896104 780 NM_001004125 chr9 - 25676386 25678856 25677680 25678319 1 TUSC1 GBM MIR491 ZD.6474 0.584966521767824 0.0132868250105047 16 0.103896103896104 743 NR_030166 chr9 + 20716103 20716187 20716187 20716187 1 MIR491 GBM FOCAD ZD.6474 0.475115550745248 0.0180454436510484 25 0.162337662337662 11 NM_017794 chr9 + 20658307 20995954 20715352 20995628 46 FOCAD GBM IFNA8 ZD.6474 0.339371168104492 0.0213172754361064 38 0.246753246753247 748 NM_002170 chr9 + 21409145 21410184 21409175 21409745 1 IFNA8 GBM IFNA1 ZD.6474 0.227271298043775 0.027277205542459 39 0.253246753246753 748 NM_024013 chr9 + 21440452 21441315 21440506 21441076 1 IFNA1 GBM MTAP ZD.6474 0.0581850757315634 0.0421290802784098 75 0.487012987012987 751 NM_002451 chr9 + 21802634 21865969 21802747 21862013 8 MTAP GBM DMRTA1 ZD.6474 0.0724223180800976 0.0441783149457373 38 0.246753246753247 756 NM_022160 chr9 + 22446839 22452472 22447064 22451910 2 DMRTA1 GBM CFL1P1 ZD.6474 0.186209536862384 0.0710945463220505 10 0.0649350649350649 1268 NR_028492 chr10 + 89578069 89605369 89605369 89605369 4 CFL1P1 GBM PTEN ZD.6474 0.294462872868446 0.0675826097063594 15 0.0974025974025974 158 NM_000314 chr10 + 89623194 89731687 89624226 89725229 9 PTEN GBM PAOX ZD.6474 0.267086193745233 -0.0693997261922379 11 0.0714285714285714 1616 NM_152911 chr10 + 135192740 135205200 135192820 135204959 7 PAOX