Fusion event
HBV-TAFA5 integration
Disease
Hepatocellular carcinoma (HCC)
Quality evaluation
Normal
Region type
precore/core protein|Core and e antigen|
Integrated sequence
GCAACTTTTTCACCTCTGCCTAATCATCTCTTGTTCATGTCCTACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCTTTGGGGCATGGACATCGACCCT| |TATAAAGAATTTGGAGCTACTGTGGAGTTACTCTCGTTTTTGCCTTCTGACTTCTTTCCTTCAGTACGAGATCTTCTAGATACCGCCTCAGCTCTGTATC
End
49082817/48687005 (Hg38)
Nearest miRNA
hsa-let-7a-3/Upstream/412590; hsa-mir-12114/Downstream/93290;
Upstream sequence
ggatggatggatggatggatggatggatggatggattggtggagggtgggtgatgaatgagtgaattgatggatgggaggatagatgatggatggttgga
Downstream sequence
tggtggacaagtggatggatggatggattgatggaggatggatagatggatgaatggattgatgaatgggtggatggatggatggatagatggtgatggt
Yang, L., et al. Molecular Characterization of HBV DNA Integration in Patients with Hepatitis and Hepatocellular Carcinoma. J Cancer ,2018,9(18): 3225-3235.