gene,0,0 GSM1657885,0,43 GSM1657932,0,42 GSM1657938,0,71 GSM1657965,0,233 GSM1657969,0,8 GSM1657975,0,14 GSM1657979,0,420 GSM1657981,0,207 GSM1657992,0,4 GSM1657998,0,47 GSM1658000,0,124 GSM1658006,0,306 GSM1658007,0,620 GSM1658010,0,90 GSM1658016,0,195 GSM1658017,0,482 GSM1658020,0,221 GSM1658021,0,74 GSM1658026,0,111 GSM1658027,0,10 GSM1658029,0,64 GSM1658031,0,234 GSM1658043,0,2356 GSM1658045,0,530 GSM1658048,0,22 GSM1658049,0,33 GSM1658050,0,820 GSM1658051,0,463 GSM1658053,0,541 GSM1658054,0,40 GSM1658055,0,78 GSM1658056,0,712 GSM1658059,0,389 GSM1658060,0,171 GSM1658061,0,115 GSM1658062,0,475 GSM1658064,0,93 GSM1658065,0,291 GSM1658066,0,1500 GSM1658067,0,150 GSM1658068,0,7 GSM1658069,0,479 GSM1658071,0,83 GSM1658072,0,158 GSM1658073,0,728 GSM1658078,0,304 GSM1658079,0,267 GSM1658081,0,96 GSM1658082,0,63 GSM1658142,0,158 GSM1658168,0,83 GSM1658174,0,30 GSM1658184,0,13 GSM1658185,0,164 GSM1658186,0,85 GSM1658187,0,10 GSM1658190,0,142 GSM1658191,0,26 GSM1658193,0,7 GSM1658199,0,2 GSM1658201,0,130 GSM1658202,0,77 GSM1657972,0,222 GSM1657993,0,75 GSM1657995,0,56 GSM1658004,0,26 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,10 GSM1658086,0,1 GSM1658089,0,3 GSM1658092,0,25 GSM1658094,0,242 GSM1658096,0,43 GSM1658098,0,109 GSM1658099,0,39 GSM1658100,0,185 GSM1658102,0,12 GSM1658109,0,6 GSM1658112,0,184 GSM1658003,0,91 GSM1658221,0,239 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,138 GSM1658226,0,48 GSM1658227,0,348 GSM1658229,0,495 GSM1658230,0,99 GSM1658231,0,366 GSM1658232,0,28 GSM1658233,0,68 GSM1658234,0,355 GSM1658235,0,28 GSM1658236,0,998 GSM1658237,0,218 GSM1658238,0,364 GSM1658239,0,179 GSM1658240,0,102 GSM1658241,0,579 GSM1658243,0,219 GSM1658244,0,303 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,42 GSM1658247,0,155 GSM1658248,0,630 GSM1658249,0,347 GSM1658251,0,25 GSM1658253,0,281 GSM1658255,0,178 GSM1658257,0,482 GSM1658259,0,166 GSM1658262,0,9 GSM1658264,0,6 GSM1658266,0,115 GSM1658268,0,305 GSM1658270,0,253 GSM1658272,0,289 GSM1658275,0,55 GSM1658277,0,46 GSM1658279,0,260 GSM1658281,0,214 GSM1658284,0,135 GSM1658286,0,878 GSM1658288,0,90 GSM1658290,0,121 GSM1658292,0,310 GSM1658294,0,268 GSM1658297,0,558 GSM1658299,0,248 GSM1658301,0,1220 GSM1658305,0,16 GSM1658306,0,6 GSM1658307,0,324 GSM1658308,0,144 GSM1658309,0,6 GSM1658310,0,784 GSM1658311,0,1 GSM1658312,0,270 GSM1658313,0,279 GSM1658314,0,50 GSM1658315,0,208 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,119 GSM1658318,0,85 GSM1658319,0,173 GSM1658320,0,10 GSM1658321,0,34 GSM1658322,0,240 GSM1658323,0,175 GSM1658324,0,36 GSM1658325,0,37 GSM1658326,0,7 GSM1658327,0,130 GSM1658328,0,312 GSM1658329,0,911 GSM1658330,0,22 GSM1658331,0,97 GSM1658332,0,829 GSM1658333,0,20 GSM1658334,0,25 GSM1658335,0,7 GSM1658336,0,236 GSM1658337,0,851 GSM1658338,0,48 GSM1658339,0,140 GSM1658340,0,253 GSM1658341,0,197 GSM1658342,0,196 GSM1658343,0,87 GSM1658344,0,71 GSM1658345,0,464 GSM1658346,0,367 GSM1658348,0,69 GSM1658349,0,198 GSM1658350,0,156 GSM1658351,0,29 GSM1658352,0,115 GSM1658353,0,35 GSM1658354,0,35 GSM1658356,0,48 GSM1658357,0,52 GSM1658358,0,50 GSM1658359,0,21 GSM1658360,0,150 GSM1658361,0,63 GSM1658362,0,299 GSM1658363,0,20 GSM1658364,0,31 GSM1658365,0,230 GSM1658366,0,598 GSM1658203,0,396 GSM1658204,0,1158 GSM1658205,0,48 GSM1658206,0,1042 GSM1658207,0,439 GSM1658208,0,90 GSM1658209,0,139 GSM1658210,0,1517 GSM1658211,0,144 GSM1658212,0,75 GSM1658213,0,421 GSM1658214,0,128 GSM1658215,0,1777 GSM1658216,0,552 GSM1658217,0,26 GSM1658218,0,617 GSM1658219,0,1039 GSM1658220,0,97 GSM1658222,0,298 GSM1658224,0,1284 GSM1658228,0,75 GSM1658242,0,483 GSM1658304,0,277 GSM1658347,0,316 GSM1658355,0,165 GSM1657872,0,96 GSM1657874,0,32 GSM1657875,0,40 GSM1657878,0,2 GSM1657879,0,311 GSM1657880,0,196 GSM1657882,0,18 GSM1657883,0,47 GSM1657884,0,58 GSM1657886,0,100 GSM1657887,0,104 GSM1657888,0,8 GSM1657895,0,26 GSM1657896,0,51 GSM1657897,0,257 GSM1657929,0,280 GSM1657936,0,263 GSM1657947,0,37 GSM1658008,0,101 GSM1658011,0,945 GSM1658013,0,484 GSM1658015,0,56 GSM1658019,0,556 GSM1658022,0,191 GSM1658023,0,5 GSM1658024,0,96 GSM1658028,0,328 GSM1658030,0,1745 GSM1658036,0,5 GSM1658044,0,245 GSM1658047,0,243 GSM1658057,0,606 GSM1658070,0,221 GSM1658074,0,1193 GSM1658075,0,749 GSM1658076,0,472 GSM1658077,0,216 GSM1658132,0,246 GSM1658144,0,24 GSM1658154,0,97 GSM1658161,0,39 GSM1658165,0,59 GSM1658178,0,123 GSM1658183,0,152 GSM1657934,0,45 GSM1657994,0,577 GSM1657996,0,42 GSM1657997,0,73 GSM1657999,0,96 GSM1658188,0,248 GSM1658189,0,58 GSM1658196,0,21 GSM1657930,0,53 GSM1657931,0,9 GSM1657933,0,7 GSM1657935,0,47 GSM1657937,0,134 GSM1657939,0,1 GSM1657940,0,61 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,24 GSM1657943,0,13 GSM1657945,0,9 GSM1657946,0,166 GSM1657948,0,14 GSM1657949,0,67 GSM1657950,0,56 GSM1657951,0,0 GSM1657952,0,63 GSM1657953,0,1 GSM1657954,0,13 GSM1657955,0,201 GSM1657956,0,64 GSM1657957,0,85 GSM1657958,0,119 GSM1657959,0,56 GSM1657960,0,137 GSM1657961,0,34 GSM1657962,0,137 GSM1657963,0,170 GSM1657964,0,136 GSM1657966,0,336 GSM1657967,0,31 GSM1657968,0,37 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,296 GSM1657973,0,67 GSM1657974,0,481 GSM1657976,0,3 GSM1657977,0,90 GSM1657978,0,1 GSM1657980,0,13 GSM1657982,0,222 GSM1657983,0,32 GSM1657984,0,4 GSM1657985,0,122 GSM1657986,0,223 GSM1657987,0,122 GSM1657988,0,106 GSM1657989,0,11 GSM1657990,0,187 GSM1657991,0,42 GSM1658001,0,1 GSM1658002,0,75 GSM1658005,0,19 GSM1658009,0,199 GSM1658012,0,44 GSM1658014,0,1672 GSM1658025,0,66 GSM1658032,0,311 GSM1658033,0,343 GSM1658034,0,351 GSM1658035,0,49 GSM1658037,0,321 GSM1658038,0,54 GSM1658039,0,26 GSM1658040,0,348 GSM1658041,0,935 GSM1658042,0,2 GSM1658046,0,109 GSM1658052,0,180 GSM1658058,0,143 GSM1658063,0,513 GSM1658080,0,82 GSM1658084,0,67 GSM1658087,0,22 GSM1658090,0,263 GSM1658091,0,67 GSM1658095,0,97 GSM1658101,0,103 GSM1658103,0,284 GSM1658104,0,11 GSM1658105,0,232 GSM1658106,0,110 GSM1658107,0,109 GSM1658108,0,77 GSM1658110,0,53 GSM1658111,0,87 GSM1658113,0,127 GSM1658114,0,371 GSM1658115,0,434 GSM1658127,0,174 GSM1658128,0,73 GSM1658129,0,72 GSM1658131,0,74 GSM1658134,0,45 GSM1658135,0,32 GSM1658136,0,51 GSM1658137,0,194 GSM1658138,0,49 GSM1658139,0,10 GSM1658141,0,179 GSM1658143,0,139 GSM1658145,0,80 GSM1658146,0,60 GSM1658147,0,146 GSM1658148,0,133 GSM1658149,0,101 GSM1658150,0,82 GSM1658151,0,15 GSM1658152,0,8 GSM1658153,0,68 GSM1658156,0,53 GSM1658158,0,67 GSM1658160,0,65 GSM1658163,0,329 GSM1658166,0,278 GSM1658169,0,35 GSM1658170,0,45 GSM1658171,0,927 GSM1658172,0,42 GSM1658175,0,153 GSM1658176,0,16 GSM1658177,0,59 GSM1658181,0,52 GSM1658182,0,495 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,236 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,248 GSM1657871,0,253 GSM1657873,0,73 GSM1657876,0,989 GSM1657877,0,62 GSM1657881,0,256 GSM1657889,0,210 GSM1657890,0,13 GSM1657891,0,67 GSM1657892,0,135 GSM1657894,0,20 GSM1657898,0,31 GSM1657899,0,59 GSM1657900,0,36 GSM1657901,0,19 GSM1657902,0,280 GSM1657944,0,3 GSM1658018,0,1835 GSM1658088,0,256 GSM1658093,0,5 GSM1658097,0,74 GSM1658130,0,420 GSM1658133,0,127 GSM1658140,0,90 GSM1658155,0,92 GSM1658157,0,216 GSM1658159,0,83 GSM1658162,0,81 GSM1658164,0,93 GSM1658167,0,342 GSM1658173,0,88 GSM1658179,0,339 GSM1658180,0,206 GSM1657893,0,37 GSM1657903,0,20 GSM1658117,0,25 GSM1658122,0,12 GSM1658126,0,92 GSM1657905,0,25 GSM1657912,0,46 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,16 GSM1657919,0,0 GSM1657923,0,403 GSM1657925,0,41 GSM1657926,0,110 GSM1657927,0,14 GSM1658116,0,42 GSM1658121,0,9 GSM1658118,0,12 GSM1658119,0,59 GSM1658120,0,103 GSM1658123,0,45 GSM1658124,0,53 GSM1658125,0,8 GSM1657904,0,46 GSM1657906,0,33 GSM1657907,0,307 GSM1657908,0,9 GSM1657909,0,1 GSM1657911,0,66 GSM1657913,0,93 GSM1657914,0,139 GSM1657915,0,15 GSM1657916,0,586 GSM1657917,0,66 GSM1657920,0,60 GSM1657921,0,54 GSM1657922,0,190 GSM1657924,0,0 GSM1657928,0,44
| Synonyms | HMG-1;HMG1;HMG3;SBP-1 |
| Description | high mobility group box 1 |
|---|---|
| Chromosome | 13q12 |
| Database Reference | MIM:163905 HGNC:4983 HPRD:01228 Vega:OTTHUMG00000016670 |
| See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
| Dataset | GSE67835 |
| HMGB1 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
|---|---|---|---|
| cortex astrocytes | 2 | 119.5 | 2,356 |
| cortex endothelial | 0 | 39 | 242 |
| cortex fetal-quiescent | 0 | 142 | 1,220 |
| cortex fetal-replicating | 26 | 316 | 1,777 |
| cortex hybrid | 2 | 113.5 | 1,745 |
| cortex microglia | 21 | 65.5 | 577 |
| cortex neurons | 0 | 67.5 | 1,672 |
| cortex oligodendrocytes | 3 | 91 | 1,835 |
| cortex OPC | 20 | 28.5 | 37 |
| hippocampus endothelial | 12 | 25 | 92 |
| hippocampus hybrid | 25 | 35.5 | 46 |
| hippocampus microglia | 0 | 28.5 | 403 |
| hippocampus neurons | 9 | 9 | 9 |
| hippocampus oligodendrocytes | 8 | 49 | 103 |
| hippocampus OPC | 0 | 57 | 586 |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]
