gene,0,0 GSM1657885,0,0 GSM1657932,0,67 GSM1657938,0,2 GSM1657965,0,0 GSM1657969,0,0 GSM1657975,0,0 GSM1657979,0,0 GSM1657981,0,904 GSM1657992,0,0 GSM1657998,0,0 GSM1658000,0,318 GSM1658006,0,16 GSM1658007,0,97 GSM1658010,0,0 GSM1658016,0,0 GSM1658017,0,0 GSM1658020,0,0 GSM1658021,0,22 GSM1658026,0,0 GSM1658027,0,0 GSM1658029,0,0 GSM1658031,0,1 GSM1658043,0,0 GSM1658045,0,0 GSM1658048,0,0 GSM1658049,0,0 GSM1658050,0,1 GSM1658051,0,0 GSM1658053,0,0 GSM1658054,0,128 GSM1658055,0,0 GSM1658056,0,0 GSM1658059,0,0 GSM1658060,0,23 GSM1658061,0,0 GSM1658062,0,564 GSM1658064,0,27 GSM1658065,0,0 GSM1658066,0,293 GSM1658067,0,0 GSM1658068,0,32 GSM1658069,0,73 GSM1658071,0,0 GSM1658072,0,0 GSM1658073,0,0 GSM1658078,0,0 GSM1658079,0,30 GSM1658081,0,0 GSM1658082,0,704 GSM1658142,0,0 GSM1658168,0,0 GSM1658174,0,0 GSM1658184,0,0 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,1 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,0 GSM1658201,0,351 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,0 GSM1657993,0,0 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,0 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,16 GSM1658086,0,0 GSM1658089,0,5 GSM1658092,0,32 GSM1658094,0,0 GSM1658096,0,5 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,0 GSM1658100,0,4 GSM1658102,0,13 GSM1658109,0,6 GSM1658112,0,0 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,58 GSM1658231,0,0 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,72 GSM1658234,0,0 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,27 GSM1658240,0,4 GSM1658241,0,0 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,0 GSM1658245,0,7 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,6 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,2 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,0 GSM1658257,0,1 GSM1658259,0,0 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,0 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,266 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,0 GSM1658292,0,0 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,0 GSM1658301,0,0 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,0 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,2 GSM1658310,0,0 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,2 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,0 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,0 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,3 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,0 GSM1658330,0,0 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,0 GSM1658340,0,0 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,0 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,1 GSM1658346,0,378 GSM1658348,0,3 GSM1658349,0,0 GSM1658350,0,0 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,0 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,30 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,1 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,0 GSM1658204,0,0 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,0 GSM1658207,0,0 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,0 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,0 GSM1658212,0,0 GSM1658213,0,0 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,0 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,0 GSM1658220,0,0 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,0 GSM1658355,0,0 GSM1657872,0,1553 GSM1657874,0,8 GSM1657875,0,0 GSM1657878,0,0 GSM1657879,0,0 GSM1657880,0,1 GSM1657882,0,0 GSM1657883,0,52 GSM1657884,0,0 GSM1657886,0,0 GSM1657887,0,2 GSM1657888,0,106 GSM1657895,0,24 GSM1657896,0,0 GSM1657897,0,0 GSM1657929,0,0 GSM1657936,0,0 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,0 GSM1658011,0,0 GSM1658013,0,0 GSM1658015,0,0 GSM1658019,0,5 GSM1658022,0,2 GSM1658023,0,0 GSM1658024,0,97 GSM1658028,0,147 GSM1658030,0,1946 GSM1658036,0,0 GSM1658044,0,0 GSM1658047,0,3 GSM1658057,0,1 GSM1658070,0,0 GSM1658074,0,1 GSM1658075,0,0 GSM1658076,0,42 GSM1658077,0,0 GSM1658132,0,1 GSM1658144,0,4 GSM1658154,0,0 GSM1658161,0,0 GSM1658165,0,12 GSM1658178,0,0 GSM1658183,0,0 GSM1657934,0,0 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,132 GSM1657930,0,0 GSM1657931,0,0 GSM1657933,0,0 GSM1657935,0,2 GSM1657937,0,0 GSM1657939,0,0 GSM1657940,0,0 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,0 GSM1657943,0,0 GSM1657945,0,0 GSM1657946,0,0 GSM1657948,0,4 GSM1657949,0,0 GSM1657950,0,0 GSM1657951,0,0 GSM1657952,0,0 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,0 GSM1657955,0,2 GSM1657956,0,8 GSM1657957,0,3 GSM1657958,0,7 GSM1657959,0,0 GSM1657960,0,72 GSM1657961,0,0 GSM1657962,0,0 GSM1657963,0,0 GSM1657964,0,0 GSM1657966,0,0 GSM1657967,0,1 GSM1657968,0,0 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,4 GSM1657973,0,46 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,0 GSM1657977,0,0 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,0 GSM1657982,0,0 GSM1657983,0,0 GSM1657984,0,0 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,0 GSM1657987,0,0 GSM1657988,0,0 GSM1657989,0,0 GSM1657990,0,43 GSM1657991,0,0 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,118 GSM1658005,0,0 GSM1658009,0,0 GSM1658012,0,0 GSM1658014,0,30 GSM1658025,0,0 GSM1658032,0,0 GSM1658033,0,17 GSM1658034,0,23 GSM1658035,0,0 GSM1658037,0,0 GSM1658038,0,2 GSM1658039,0,0 GSM1658040,0,75 GSM1658041,0,0 GSM1658042,0,0 GSM1658046,0,0 GSM1658052,0,8 GSM1658058,0,0 GSM1658063,0,141 GSM1658080,0,0 GSM1658084,0,33 GSM1658087,0,0 GSM1658090,0,0 GSM1658091,0,4 GSM1658095,0,0 GSM1658101,0,0 GSM1658103,0,0 GSM1658104,0,0 GSM1658105,0,0 GSM1658106,0,0 GSM1658107,0,0 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,0 GSM1658111,0,0 GSM1658113,0,3 GSM1658114,0,1 GSM1658115,0,0 GSM1658127,0,0 GSM1658128,0,0 GSM1658129,0,105 GSM1658131,0,0 GSM1658134,0,8 GSM1658135,0,58 GSM1658136,0,0 GSM1658137,0,0 GSM1658138,0,0 GSM1658139,0,0 GSM1658141,0,5 GSM1658143,0,2 GSM1658145,0,9 GSM1658146,0,15 GSM1658147,0,18 GSM1658148,0,6 GSM1658149,0,0 GSM1658150,0,16 GSM1658151,0,1 GSM1658152,0,19 GSM1658153,0,0 GSM1658156,0,0 GSM1658158,0,2 GSM1658160,0,0 GSM1658163,0,195 GSM1658166,0,0 GSM1658169,0,4 GSM1658170,0,67 GSM1658171,0,1 GSM1658172,0,0 GSM1658175,0,2 GSM1658176,0,1 GSM1658177,0,0 GSM1658181,0,0 GSM1658182,0,14 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,0 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,11 GSM1657873,0,0 GSM1657876,0,1 GSM1657877,0,0 GSM1657881,0,0 GSM1657889,0,0 GSM1657890,0,0 GSM1657891,0,0 GSM1657892,0,2 GSM1657894,0,0 GSM1657898,0,0 GSM1657899,0,0 GSM1657900,0,0 GSM1657901,0,11 GSM1657902,0,0 GSM1657944,0,0 GSM1658018,0,0 GSM1658088,0,28 GSM1658093,0,0 GSM1658097,0,0 GSM1658130,0,0 GSM1658133,0,552 GSM1658140,0,10 GSM1658155,0,0 GSM1658157,0,36 GSM1658159,0,0 GSM1658162,0,2 GSM1658164,0,0 GSM1658167,0,1 GSM1658173,0,0 GSM1658179,0,0 GSM1658180,0,0 GSM1657893,0,0 GSM1657903,0,0 GSM1658117,0,0 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,0 GSM1657912,0,1 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,7 GSM1657919,0,2 GSM1657923,0,5 GSM1657925,0,0 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,0 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,32 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,0 GSM1658120,0,0 GSM1658123,0,6 GSM1658124,0,0 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,0 GSM1657906,0,0 GSM1657907,0,0 GSM1657908,0,7 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,0 GSM1657913,0,133 GSM1657914,0,0 GSM1657915,0,0 GSM1657916,0,65 GSM1657917,0,0 GSM1657920,0,4 GSM1657921,0,4 GSM1657922,0,1 GSM1657924,0,1 GSM1657928,0,0
Synonyms | - |
Description | LysM domain containing 3 |
---|---|
Chromosome | 5q14.3 |
Database Reference | HGNC:26969 Vega:OTTHUMG00000162667 |
See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
Dataset | GSE67835 |
LYSMD3 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
---|---|---|---|
cortex astrocytes | 0 | 0 | 904 |
cortex endothelial | 0 | 0 | 32 |
cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 378 |
cortex fetal-replicating | 0 | 0 | 0 |
cortex hybrid | 0 | 0 | 1,946 |
cortex microglia | 0 | 0 | 132 |
cortex neurons | 0 | 0 | 195 |
cortex oligodendrocytes | 0 | 0 | 552 |
cortex OPC | 0 | 0 | 0 |
hippocampus endothelial | 0 | 0 | 0 |
hippocampus hybrid | 0 | 0.5 | 1 |
hippocampus microglia | 0 | 0 | 7 |
hippocampus neurons | 32 | 32 | 32 |
hippocampus oligodendrocytes | 0 | 0 | 6 |
hippocampus OPC | 0 | 0 | 133 |
Comparing LYSMD3 expression between groups | FDR |
---|---|
hippocampus microglia VS hippocampus neurons | NS |
hippocampus microglia VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
hippocampus neurons VS hippocampu | NS |
hippocampus neurons VS hippocampus oligodendro | NS |
hippocampus oligodendrocytes VS hippocampus OPC | NS |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]