gene,0,0 GSM1657885,0,6 GSM1657932,0,402 GSM1657938,0,59 GSM1657965,0,762 GSM1657969,0,0 GSM1657975,0,0 GSM1657979,0,51 GSM1657981,0,262 GSM1657992,0,3 GSM1657998,0,0 GSM1658000,0,82 GSM1658006,0,723 GSM1658007,0,304 GSM1658010,0,209 GSM1658016,0,357 GSM1658017,0,14 GSM1658020,0,403 GSM1658021,0,272 GSM1658026,0,162 GSM1658027,0,7 GSM1658029,0,267 GSM1658031,0,476 GSM1658043,0,601 GSM1658045,0,1127 GSM1658048,0,9 GSM1658049,0,24 GSM1658050,0,6 GSM1658051,0,178 GSM1658053,0,34 GSM1658054,0,0 GSM1658055,0,3 GSM1658056,0,85 GSM1658059,0,2 GSM1658060,0,72 GSM1658061,0,310 GSM1658062,0,5 GSM1658064,0,296 GSM1658065,0,315 GSM1658066,0,374 GSM1658067,0,323 GSM1658068,0,23 GSM1658069,0,262 GSM1658071,0,101 GSM1658072,0,115 GSM1658073,0,24 GSM1658078,0,616 GSM1658079,0,435 GSM1658081,0,471 GSM1658082,0,1920 GSM1658142,0,1 GSM1658168,0,531 GSM1658174,0,238 GSM1658184,0,24 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,5 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,43 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,0 GSM1658201,0,403 GSM1658202,0,96 GSM1657972,0,308 GSM1657993,0,471 GSM1657995,0,1 GSM1658004,0,0 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,2 GSM1658086,0,0 GSM1658089,0,0 GSM1658092,0,160 GSM1658094,0,0 GSM1658096,0,0 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,188 GSM1658100,0,0 GSM1658102,0,84 GSM1658109,0,0 GSM1658112,0,0 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,1 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,0 GSM1658231,0,0 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,0 GSM1658234,0,0 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,0 GSM1658240,0,0 GSM1658241,0,0 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,0 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,0 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,0 GSM1658257,0,0 GSM1658259,0,337 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,0 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,2 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,0 GSM1658292,0,1 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,0 GSM1658301,0,0 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,0 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,0 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,0 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,24 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,0 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,0 GSM1658330,0,0 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,0 GSM1658340,0,0 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,0 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,0 GSM1658348,0,0 GSM1658349,0,0 GSM1658350,0,149 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,0 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,0 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,63 GSM1658204,0,116 GSM1658205,0,1 GSM1658206,0,1 GSM1658207,0,51 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,1 GSM1658210,0,1 GSM1658211,0,2 GSM1658212,0,9 GSM1658213,0,9 GSM1658214,0,397 GSM1658215,0,8 GSM1658216,0,3 GSM1658217,0,6 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,249 GSM1658220,0,0 GSM1658222,0,497 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,107 GSM1658304,0,1 GSM1658347,0,132 GSM1658355,0,179 GSM1657872,0,0 GSM1657874,0,0 GSM1657875,0,13 GSM1657878,0,0 GSM1657879,0,0 GSM1657880,0,0 GSM1657882,0,0 GSM1657883,0,0 GSM1657884,0,0 GSM1657886,0,0 GSM1657887,0,100 GSM1657888,0,0 GSM1657895,0,830 GSM1657896,0,0 GSM1657897,0,0 GSM1657929,0,0 GSM1657936,0,395 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,59 GSM1658011,0,30 GSM1658013,0,3 GSM1658015,0,89 GSM1658019,0,21 GSM1658022,0,43 GSM1658023,0,0 GSM1658024,0,265 GSM1658028,0,24 GSM1658030,0,0 GSM1658036,0,1 GSM1658044,0,9 GSM1658047,0,295 GSM1658057,0,2 GSM1658070,0,343 GSM1658074,0,14 GSM1658075,0,517 GSM1658076,0,7 GSM1658077,0,4 GSM1658132,0,193 GSM1658144,0,5 GSM1658154,0,74 GSM1658161,0,0 GSM1658165,0,237 GSM1658178,0,55 GSM1658183,0,328 GSM1657934,0,0 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,3 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,0 GSM1657930,0,0 GSM1657931,0,0 GSM1657933,0,157 GSM1657935,0,22 GSM1657937,0,0 GSM1657939,0,0 GSM1657940,0,0 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,0 GSM1657943,0,493 GSM1657945,0,0 GSM1657946,0,0 GSM1657948,0,0 GSM1657949,0,0 GSM1657950,0,1 GSM1657951,0,2 GSM1657952,0,3 GSM1657953,0,22 GSM1657954,0,65 GSM1657955,0,1 GSM1657956,0,3 GSM1657957,0,7 GSM1657958,0,55 GSM1657959,0,0 GSM1657960,0,0 GSM1657961,0,0 GSM1657962,0,0 GSM1657963,0,0 GSM1657964,0,20 GSM1657966,0,2 GSM1657967,0,239 GSM1657968,0,0 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,28 GSM1657973,0,20 GSM1657974,0,113 GSM1657976,0,62 GSM1657977,0,0 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,221 GSM1657982,0,0 GSM1657983,0,0 GSM1657984,0,148 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,0 GSM1657987,0,62 GSM1657988,0,0 GSM1657989,0,0 GSM1657990,0,164 GSM1657991,0,0 GSM1658001,0,16 GSM1658002,0,0 GSM1658005,0,0 GSM1658009,0,2 GSM1658012,0,7 GSM1658014,0,37 GSM1658025,0,144 GSM1658032,0,0 GSM1658033,0,93 GSM1658034,0,357 GSM1658035,0,0 GSM1658037,0,0 GSM1658038,0,0 GSM1658039,0,3 GSM1658040,0,1 GSM1658041,0,2 GSM1658042,0,1 GSM1658046,0,37 GSM1658052,0,204 GSM1658058,0,1 GSM1658063,0,103 GSM1658080,0,21 GSM1658084,0,0 GSM1658087,0,0 GSM1658090,0,0 GSM1658091,0,0 GSM1658095,0,0 GSM1658101,0,0 GSM1658103,0,0 GSM1658104,0,0 GSM1658105,0,229 GSM1658106,0,0 GSM1658107,0,13 GSM1658108,0,93 GSM1658110,0,0 GSM1658111,0,306 GSM1658113,0,0 GSM1658114,0,0 GSM1658115,0,0 GSM1658127,0,0 GSM1658128,0,0 GSM1658129,0,57 GSM1658131,0,101 GSM1658134,0,0 GSM1658135,0,27 GSM1658136,0,0 GSM1658137,0,0 GSM1658138,0,88 GSM1658139,0,0 GSM1658141,0,31 GSM1658143,0,101 GSM1658145,0,0 GSM1658146,0,0 GSM1658147,0,95 GSM1658148,0,0 GSM1658149,0,1 GSM1658150,0,16 GSM1658151,0,0 GSM1658152,0,0 GSM1658153,0,0 GSM1658156,0,118 GSM1658158,0,0 GSM1658160,0,0 GSM1658163,0,57 GSM1658166,0,0 GSM1658169,0,0 GSM1658170,0,7 GSM1658171,0,1 GSM1658172,0,0 GSM1658175,0,1 GSM1658176,0,1 GSM1658177,0,2 GSM1658181,0,16 GSM1658182,0,344 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,73 GSM1658197,0,1 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,1 GSM1657873,0,1 GSM1657876,0,26 GSM1657877,0,256 GSM1657881,0,0 GSM1657889,0,0 GSM1657890,0,0 GSM1657891,0,0 GSM1657892,0,0 GSM1657894,0,22 GSM1657898,0,1 GSM1657899,0,0 GSM1657900,0,20 GSM1657901,0,122 GSM1657902,0,4 GSM1657944,0,0 GSM1658018,0,1 GSM1658088,0,1 GSM1658093,0,0 GSM1658097,0,432 GSM1658130,0,1 GSM1658133,0,38 GSM1658140,0,0 GSM1658155,0,93 GSM1658157,0,386 GSM1658159,0,0 GSM1658162,0,0 GSM1658164,0,0 GSM1658167,0,0 GSM1658173,0,0 GSM1658179,0,523 GSM1658180,0,127 GSM1657893,0,1070 GSM1657903,0,55 GSM1658117,0,1 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,5 GSM1657912,0,55 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,10 GSM1657919,0,0 GSM1657923,0,177 GSM1657925,0,6 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,234 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,0 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,0 GSM1658120,0,0 GSM1658123,0,0 GSM1658124,0,11 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,0 GSM1657906,0,3 GSM1657907,0,939 GSM1657908,0,62 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,148 GSM1657913,0,32 GSM1657914,0,983 GSM1657915,0,74 GSM1657916,0,224 GSM1657917,0,222 GSM1657920,0,1 GSM1657921,0,610 GSM1657922,0,16 GSM1657924,0,2 GSM1657928,0,80
Synonyms | ENH;ENH1;L9;LIM |
Description | PDZ and LIM domain 5 |
---|---|
Chromosome | 4q22 |
Database Reference | MIM:605904 HGNC:17468 HPRD:05799 Vega:OTTHUMG00000130973 |
See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
Dataset | GSE67835 |
PDLIM5 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
---|---|---|---|
cortex astrocytes | 0 | 90.5 | 1,920 |
cortex endothelial | 0 | 0 | 471 |
cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 337 |
cortex fetal-replicating | 0 | 6 | 497 |
cortex hybrid | 0 | 6 | 830 |
cortex microglia | 0 | 0 | 3 |
cortex neurons | 0 | 0 | 493 |
cortex oligodendrocytes | 0 | 1 | 523 |
cortex OPC | 55 | 562.5 | 1,070 |
hippocampus endothelial | 0 | 0 | 1 |
hippocampus hybrid | 5 | 30 | 55 |
hippocampus microglia | 0 | 3 | 234 |
hippocampus neurons | 0 | 0 | 0 |
hippocampus oligodendrocytes | 0 | 0 | 11 |
hippocampus OPC | 0 | 68 | 983 |
Comparing PDLIM5 expression between groups | FDR |
---|---|
hippocampus microglia VS hippocampus neurons | NS |
hippocampus microglia VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
hippocampus neurons VS hippocampu | NS |
hippocampus neurons VS hippocampus oligodendro | NS |
hippocampus oligodendrocytes VS hippocampus OPC | NS |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]