gene,0,0 GSM1657885,0,0 GSM1657932,0,0 GSM1657938,0,0 GSM1657965,0,0 GSM1657969,0,0 GSM1657975,0,0 GSM1657979,0,1707 GSM1657981,0,0 GSM1657992,0,0 GSM1657998,0,0 GSM1658000,0,3 GSM1658006,0,0 GSM1658007,0,4 GSM1658010,0,146 GSM1658016,0,62 GSM1658017,0,0 GSM1658020,0,43 GSM1658021,0,0 GSM1658026,0,0 GSM1658027,0,0 GSM1658029,0,0 GSM1658031,0,0 GSM1658043,0,856 GSM1658045,0,61 GSM1658048,0,7 GSM1658049,0,16 GSM1658050,0,100 GSM1658051,0,3 GSM1658053,0,13 GSM1658054,0,5 GSM1658055,0,36 GSM1658056,0,13 GSM1658059,0,1801 GSM1658060,0,722 GSM1658061,0,5 GSM1658062,0,21 GSM1658064,0,153 GSM1658065,0,85 GSM1658066,0,9 GSM1658067,0,203 GSM1658068,0,19 GSM1658069,0,34 GSM1658071,0,51 GSM1658072,0,39 GSM1658073,0,64 GSM1658078,0,7 GSM1658079,0,12 GSM1658081,0,2 GSM1658082,0,16 GSM1658142,0,32 GSM1658168,0,0 GSM1658174,0,0 GSM1658184,0,0 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,0 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,21 GSM1658201,0,114 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,0 GSM1657993,0,0 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,1 GSM1658083,0,37 GSM1658085,0,3 GSM1658086,0,0 GSM1658089,0,0 GSM1658092,0,18 GSM1658094,0,6 GSM1658096,0,2 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,0 GSM1658100,0,0 GSM1658102,0,0 GSM1658109,0,0 GSM1658112,0,30 GSM1658003,0,106 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,3 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,709 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,0 GSM1658231,0,0 GSM1658232,0,6 GSM1658233,0,0 GSM1658234,0,37 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,340 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,49 GSM1658239,0,42 GSM1658240,0,1 GSM1658241,0,342 GSM1658243,0,1 GSM1658244,0,70 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,0 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,18 GSM1658253,0,55 GSM1658255,0,26 GSM1658257,0,0 GSM1658259,0,21 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,102 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,0 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,39 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,0 GSM1658292,0,37 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,154 GSM1658301,0,15 GSM1658305,0,69 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,43 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,134 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,0 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,0 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,0 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,60 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,469 GSM1658330,0,0 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,248 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,43 GSM1658340,0,0 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,12 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,0 GSM1658348,0,0 GSM1658349,0,0 GSM1658350,0,84 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,20 GSM1658354,0,23 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,0 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,3 GSM1658204,0,0 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,0 GSM1658207,0,83 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,0 GSM1658210,0,161 GSM1658211,0,0 GSM1658212,0,0 GSM1658213,0,64 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,2 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,146 GSM1658220,0,0 GSM1658222,0,82 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,0 GSM1658355,0,0 GSM1657872,0,10 GSM1657874,0,1 GSM1657875,0,25 GSM1657878,0,76 GSM1657879,0,28 GSM1657880,0,13 GSM1657882,0,66 GSM1657883,0,244 GSM1657884,0,215 GSM1657886,0,7 GSM1657887,0,2 GSM1657888,0,0 GSM1657895,0,6 GSM1657896,0,185 GSM1657897,0,225 GSM1657929,0,1 GSM1657936,0,0 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,5 GSM1658011,0,0 GSM1658013,0,239 GSM1658015,0,0 GSM1658019,0,198 GSM1658022,0,0 GSM1658023,0,63 GSM1658024,0,0 GSM1658028,0,161 GSM1658030,0,1472 GSM1658036,0,0 GSM1658044,0,199 GSM1658047,0,9 GSM1658057,0,3 GSM1658070,0,11 GSM1658074,0,4 GSM1658075,0,9 GSM1658076,0,25 GSM1658077,0,72 GSM1658132,0,0 GSM1658144,0,0 GSM1658154,0,0 GSM1658161,0,6 GSM1658165,0,0 GSM1658178,0,52 GSM1658183,0,0 GSM1657934,0,0 GSM1657994,0,337 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,121 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,67 GSM1657930,0,10 GSM1657931,0,362 GSM1657933,0,6 GSM1657935,0,0 GSM1657937,0,3 GSM1657939,0,1 GSM1657940,0,62 GSM1657941,0,16 GSM1657942,0,1 GSM1657943,0,114 GSM1657945,0,89 GSM1657946,0,0 GSM1657948,0,126 GSM1657949,0,62 GSM1657950,0,15 GSM1657951,0,349 GSM1657952,0,6 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,0 GSM1657955,0,13 GSM1657956,0,0 GSM1657957,0,0 GSM1657958,0,76 GSM1657959,0,331 GSM1657960,0,0 GSM1657961,0,118 GSM1657962,0,0 GSM1657963,0,13 GSM1657964,0,0 GSM1657966,0,387 GSM1657967,0,7 GSM1657968,0,205 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,286 GSM1657973,0,18 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,4 GSM1657977,0,2 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,0 GSM1657982,0,89 GSM1657983,0,1 GSM1657984,0,1 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,0 GSM1657987,0,0 GSM1657988,0,8 GSM1657989,0,115 GSM1657990,0,350 GSM1657991,0,42 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,4 GSM1658005,0,0 GSM1658009,0,0 GSM1658012,0,0 GSM1658014,0,0 GSM1658025,0,42 GSM1658032,0,152 GSM1658033,0,8 GSM1658034,0,0 GSM1658035,0,0 GSM1658037,0,0 GSM1658038,0,58 GSM1658039,0,0 GSM1658040,0,297 GSM1658041,0,0 GSM1658042,0,23 GSM1658046,0,3 GSM1658052,0,177 GSM1658058,0,125 GSM1658063,0,259 GSM1658080,0,79 GSM1658084,0,23 GSM1658087,0,81 GSM1658090,0,3 GSM1658091,0,2 GSM1658095,0,14 GSM1658101,0,20 GSM1658103,0,0 GSM1658104,0,0 GSM1658105,0,0 GSM1658106,0,213 GSM1658107,0,0 GSM1658108,0,8 GSM1658110,0,331 GSM1658111,0,0 GSM1658113,0,0 GSM1658114,0,0 GSM1658115,0,78 GSM1658127,0,6 GSM1658128,0,0 GSM1658129,0,0 GSM1658131,0,33 GSM1658134,0,35 GSM1658135,0,19 GSM1658136,0,33 GSM1658137,0,3 GSM1658138,0,1 GSM1658139,0,2 GSM1658141,0,74 GSM1658143,0,0 GSM1658145,0,46 GSM1658146,0,0 GSM1658147,0,0 GSM1658148,0,16 GSM1658149,0,0 GSM1658150,0,17 GSM1658151,0,5 GSM1658152,0,42 GSM1658153,0,3 GSM1658156,0,0 GSM1658158,0,0 GSM1658160,0,5 GSM1658163,0,84 GSM1658166,0,0 GSM1658169,0,399 GSM1658170,0,24 GSM1658171,0,0 GSM1658172,0,0 GSM1658175,0,1 GSM1658176,0,49 GSM1658177,0,0 GSM1658181,0,0 GSM1658182,0,1 GSM1658192,0,1 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,35 GSM1658197,0,169 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,75 GSM1657873,0,0 GSM1657876,0,1 GSM1657877,0,1 GSM1657881,0,17 GSM1657889,0,4 GSM1657890,0,0 GSM1657891,0,71 GSM1657892,0,62 GSM1657894,0,0 GSM1657898,0,1574 GSM1657899,0,90 GSM1657900,0,37 GSM1657901,0,134 GSM1657902,0,436 GSM1657944,0,6 GSM1658018,0,399 GSM1658088,0,29 GSM1658093,0,0 GSM1658097,0,0 GSM1658130,0,0 GSM1658133,0,155 GSM1658140,0,56 GSM1658155,0,0 GSM1658157,0,1 GSM1658159,0,65 GSM1658162,0,95 GSM1658164,0,1 GSM1658167,0,0 GSM1658173,0,6 GSM1658179,0,0 GSM1658180,0,0 GSM1657893,0,133 GSM1657903,0,1387 GSM1658117,0,0 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,2 GSM1657912,0,1 GSM1657910,0,37 GSM1657918,0,5 GSM1657919,0,869 GSM1657923,0,98 GSM1657925,0,0 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,0 GSM1658116,0,9 GSM1658121,0,0 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,87 GSM1658120,0,419 GSM1658123,0,121 GSM1658124,0,72 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,0 GSM1657906,0,112 GSM1657907,0,0 GSM1657908,0,888 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,50 GSM1657913,0,35 GSM1657914,0,1 GSM1657915,0,1 GSM1657916,0,98 GSM1657917,0,0 GSM1657920,0,565 GSM1657921,0,6 GSM1657922,0,290 GSM1657924,0,104 GSM1657928,0,0
Synonyms | KIA001LB;PDZ-GEF2;PDZGEF2;RA-GEF-2;RAGEF2 |
Description | Rap guanine nucleotide exchange factor 6 |
---|---|
Chromosome | 5q31.1 |
Database Reference | MIM:610499 HGNC:20655 HPRD:11483 Vega:OTTHUMG00000162683 Vega:OTTHUMG00000162686 |
See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
Dataset | GSE67835 |
RAPGEF6 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
---|---|---|---|
cortex astrocytes | 0 | 5 | 1,801 |
cortex endothelial | 0 | 0 | 37 |
cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 709 |
cortex fetal-replicating | 0 | 0 | 161 |
cortex hybrid | 0 | 8 | 1,472 |
cortex microglia | 0 | 0 | 337 |
cortex neurons | 0 | 3.5 | 399 |
cortex oligodendrocytes | 0 | 6 | 1,574 |
cortex OPC | 133 | 760 | 1,387 |
hippocampus endothelial | 0 | 0 | 0 |
hippocampus hybrid | 1 | 1.5 | 2 |
hippocampus microglia | 0 | 7 | 869 |
hippocampus neurons | 0 | 0 | 0 |
hippocampus oligodendrocytes | 0 | 79.5 | 419 |
hippocampus OPC | 0 | 20.5 | 888 |
Comparing RAPGEF6 expression between groups | FDR |
---|---|
hippocampus microglia VS hippocampus neurons | NS |
hippocampus microglia VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
hippocampus neurons VS hippocampu | NS |
hippocampus neurons VS hippocampus oligodendro | NS |
hippocampus oligodendrocytes VS hippocampus OPC | NS |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]