gene,0,0 GSM1657885,0,0 GSM1657932,0,0 GSM1657938,0,7 GSM1657965,0,2 GSM1657969,0,1 GSM1657975,0,191 GSM1657979,0,614 GSM1657981,0,1 GSM1657992,0,0 GSM1657998,0,1 GSM1658000,0,0 GSM1658006,0,4 GSM1658007,0,454 GSM1658010,0,131 GSM1658016,0,195 GSM1658017,0,0 GSM1658020,0,0 GSM1658021,0,0 GSM1658026,0,25 GSM1658027,0,1 GSM1658029,0,0 GSM1658031,0,1 GSM1658043,0,3 GSM1658045,0,6 GSM1658048,0,257 GSM1658049,0,24 GSM1658050,0,254 GSM1658051,0,9 GSM1658053,0,13 GSM1658054,0,3 GSM1658055,0,48 GSM1658056,0,19 GSM1658059,0,158 GSM1658060,0,36 GSM1658061,0,88 GSM1658062,0,17 GSM1658064,0,5 GSM1658065,0,26 GSM1658066,0,17 GSM1658067,0,9 GSM1658068,0,239 GSM1658069,0,38 GSM1658071,0,31 GSM1658072,0,72 GSM1658073,0,19 GSM1658078,0,10 GSM1658079,0,585 GSM1658081,0,3 GSM1658082,0,2 GSM1658142,0,24 GSM1658168,0,3 GSM1658174,0,9 GSM1658184,0,0 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,0 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,0 GSM1658201,0,0 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,2 GSM1657993,0,0 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,1 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,0 GSM1658086,0,0 GSM1658089,0,1 GSM1658092,0,51 GSM1658094,0,0 GSM1658096,0,1 GSM1658098,0,2 GSM1658099,0,79 GSM1658100,0,348 GSM1658102,0,0 GSM1658109,0,0 GSM1658112,0,0 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,0 GSM1658231,0,223 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,0 GSM1658234,0,0 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,0 GSM1658240,0,0 GSM1658241,0,0 GSM1658243,0,62 GSM1658244,0,38 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,0 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,58 GSM1658257,0,0 GSM1658259,0,0 GSM1658262,0,156 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,11 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,0 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,1 GSM1658292,0,0 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,1 GSM1658299,0,0 GSM1658301,0,64 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,0 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,501 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,0 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,96 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,266 GSM1658318,0,0 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,18 GSM1658322,0,52 GSM1658323,0,0 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,0 GSM1658330,0,151 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,13 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,187 GSM1658337,0,144 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,84 GSM1658340,0,38 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,58 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,86 GSM1658345,0,1 GSM1658346,0,0 GSM1658348,0,4 GSM1658349,0,427 GSM1658350,0,0 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,0 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,151 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,263 GSM1658363,0,57 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,350 GSM1658366,0,5 GSM1658203,0,0 GSM1658204,0,0 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,0 GSM1658207,0,0 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,0 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,0 GSM1658212,0,2496 GSM1658213,0,0 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,0 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,1 GSM1658220,0,0 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,0 GSM1658355,0,0 GSM1657872,0,1706 GSM1657874,0,207 GSM1657875,0,95 GSM1657878,0,804 GSM1657879,0,474 GSM1657880,0,885 GSM1657882,0,568 GSM1657883,0,3519 GSM1657884,0,684 GSM1657886,0,1020 GSM1657887,0,604 GSM1657888,0,679 GSM1657895,0,1715 GSM1657896,0,1008 GSM1657897,0,1 GSM1657929,0,2 GSM1657936,0,33 GSM1657947,0,71 GSM1658008,0,1438 GSM1658011,0,239 GSM1658013,0,209 GSM1658015,0,1303 GSM1658019,0,2210 GSM1658022,0,313 GSM1658023,0,110 GSM1658024,0,601 GSM1658028,0,2066 GSM1658030,0,2550 GSM1658036,0,214 GSM1658044,0,1022 GSM1658047,0,887 GSM1658057,0,3869 GSM1658070,0,1546 GSM1658074,0,8357 GSM1658075,0,1265 GSM1658076,0,644 GSM1658077,0,382 GSM1658132,0,24 GSM1658144,0,36 GSM1658154,0,609 GSM1658161,0,38 GSM1658165,0,1672 GSM1658178,0,91 GSM1658183,0,1 GSM1657934,0,0 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,0 GSM1657930,0,181 GSM1657931,0,1444 GSM1657933,0,105 GSM1657935,0,2542 GSM1657937,0,14 GSM1657939,0,105 GSM1657940,0,640 GSM1657941,0,14 GSM1657942,0,326 GSM1657943,0,56 GSM1657945,0,79 GSM1657946,0,3211 GSM1657948,0,150 GSM1657949,0,420 GSM1657950,0,140 GSM1657951,0,19 GSM1657952,0,428 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,84 GSM1657955,0,361 GSM1657956,0,443 GSM1657957,0,293 GSM1657958,0,590 GSM1657959,0,731 GSM1657960,0,632 GSM1657961,0,56 GSM1657962,0,23 GSM1657963,0,2359 GSM1657964,0,410 GSM1657966,0,1880 GSM1657967,0,1428 GSM1657968,0,335 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,1563 GSM1657973,0,920 GSM1657974,0,587 GSM1657976,0,196 GSM1657977,0,1029 GSM1657978,0,36 GSM1657980,0,363 GSM1657982,0,1326 GSM1657983,0,759 GSM1657984,0,65 GSM1657985,0,38 GSM1657986,0,3719 GSM1657987,0,6280 GSM1657988,0,786 GSM1657989,0,84 GSM1657990,0,1210 GSM1657991,0,212 GSM1658001,0,1135 GSM1658002,0,723 GSM1658005,0,828 GSM1658009,0,3513 GSM1658012,0,1197 GSM1658014,0,7447 GSM1658025,0,47 GSM1658032,0,31 GSM1658033,0,4365 GSM1658034,0,3221 GSM1658035,0,267 GSM1658037,0,2645 GSM1658038,0,161 GSM1658039,0,4058 GSM1658040,0,1082 GSM1658041,0,1005 GSM1658042,0,76 GSM1658046,0,1247 GSM1658052,0,322 GSM1658058,0,617 GSM1658063,0,179 GSM1658080,0,1684 GSM1658084,0,502 GSM1658087,0,710 GSM1658090,0,0 GSM1658091,0,167 GSM1658095,0,676 GSM1658101,0,574 GSM1658103,0,744 GSM1658104,0,76 GSM1658105,0,427 GSM1658106,0,1959 GSM1658107,0,162 GSM1658108,0,2292 GSM1658110,0,360 GSM1658111,0,3920 GSM1658113,0,1617 GSM1658114,0,316 GSM1658115,0,589 GSM1658127,0,976 GSM1658128,0,221 GSM1658129,0,602 GSM1658131,0,739 GSM1658134,0,170 GSM1658135,0,237 GSM1658136,0,2024 GSM1658137,0,1380 GSM1658138,0,288 GSM1658139,0,129 GSM1658141,0,1841 GSM1658143,0,1041 GSM1658145,0,1077 GSM1658146,0,356 GSM1658147,0,406 GSM1658148,0,518 GSM1658149,0,257 GSM1658150,0,76 GSM1658151,0,418 GSM1658152,0,443 GSM1658153,0,872 GSM1658156,0,208 GSM1658158,0,385 GSM1658160,0,1947 GSM1658163,0,1403 GSM1658166,0,432 GSM1658169,0,58 GSM1658170,0,972 GSM1658171,0,904 GSM1658172,0,1903 GSM1658175,0,2079 GSM1658176,0,189 GSM1658177,0,10 GSM1658181,0,920 GSM1658182,0,50 GSM1658192,0,267 GSM1658194,0,872 GSM1658195,0,170 GSM1658197,0,1 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,786 GSM1657871,0,69 GSM1657873,0,0 GSM1657876,0,5 GSM1657877,0,0 GSM1657881,0,0 GSM1657889,0,0 GSM1657890,0,0 GSM1657891,0,41 GSM1657892,0,0 GSM1657894,0,0 GSM1657898,0,888 GSM1657899,0,0 GSM1657900,0,0 GSM1657901,0,0 GSM1657902,0,0 GSM1657944,0,8 GSM1658018,0,2 GSM1658088,0,1 GSM1658093,0,0 GSM1658097,0,1 GSM1658130,0,614 GSM1658133,0,18 GSM1658140,0,275 GSM1658155,0,0 GSM1658157,0,1200 GSM1658159,0,102 GSM1658162,0,0 GSM1658164,0,5 GSM1658167,0,1 GSM1658173,0,29 GSM1658179,0,284 GSM1658180,0,4 GSM1657893,0,0 GSM1657903,0,0 GSM1658117,0,0 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,61 GSM1657912,0,753 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,0 GSM1657919,0,0 GSM1657923,0,0 GSM1657925,0,0 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,0 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,279 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,0 GSM1658120,0,0 GSM1658123,0,0 GSM1658124,0,0 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,16 GSM1657906,0,43 GSM1657907,0,4 GSM1657908,0,334 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,0 GSM1657913,0,774 GSM1657914,0,0 GSM1657915,0,0 GSM1657916,0,693 GSM1657917,0,485 GSM1657920,0,0 GSM1657921,0,846 GSM1657922,0,0 GSM1657924,0,18 GSM1657928,0,0
| Synonyms | CHGC;EM66;SN;SgII |
| Description | secretogranin II |
|---|---|
| Chromosome | 2q35-q36 |
| Database Reference | MIM:118930 HGNC:10575 HPRD:06762 Vega:OTTHUMG00000133166 |
| See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
| Dataset | GSE67835 |
| SCG2 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
|---|---|---|---|
| cortex astrocytes | 0 | 5.5 | 614 |
| cortex endothelial | 0 | 0 | 348 |
| cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 501 |
| cortex fetal-replicating | 0 | 0 | 2,496 |
| cortex hybrid | 1 | 626.5 | 8,357 |
| cortex microglia | 0 | 0 | 0 |
| cortex neurons | 0 | 443 | 7,447 |
| cortex oligodendrocytes | 0 | 1 | 1,200 |
| cortex OPC | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus endothelial | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus hybrid | 61 | 407 | 753 |
| hippocampus microglia | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus neurons | 279 | 279 | 279 |
| hippocampus oligodendrocytes | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus OPC | 0 | 10 | 846 |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]
