gene,0,0 GSM1657885,0,0 GSM1657932,0,172 GSM1657938,0,0 GSM1657965,0,74 GSM1657969,0,0 GSM1657975,0,159 GSM1657979,0,302 GSM1657981,0,145 GSM1657992,0,0 GSM1657998,0,0 GSM1658000,0,428 GSM1658006,0,136 GSM1658007,0,114 GSM1658010,0,24 GSM1658016,0,405 GSM1658017,0,44 GSM1658020,0,152 GSM1658021,0,178 GSM1658026,0,157 GSM1658027,0,66 GSM1658029,0,76 GSM1658031,0,0 GSM1658043,0,105 GSM1658045,0,0 GSM1658048,0,5 GSM1658049,0,27 GSM1658050,0,65 GSM1658051,0,346 GSM1658053,0,4 GSM1658054,0,326 GSM1658055,0,8 GSM1658056,0,3 GSM1658059,0,8 GSM1658060,0,25 GSM1658061,0,41 GSM1658062,0,5 GSM1658064,0,42 GSM1658065,0,250 GSM1658066,0,378 GSM1658067,0,45 GSM1658068,0,2 GSM1658069,0,7 GSM1658071,0,6 GSM1658072,0,0 GSM1658073,0,62 GSM1658078,0,179 GSM1658079,0,256 GSM1658081,0,120 GSM1658082,0,249 GSM1658142,0,134 GSM1658168,0,312 GSM1658174,0,94 GSM1658184,0,0 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,168 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,86 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,177 GSM1658201,0,209 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,5 GSM1657993,0,635 GSM1657995,0,12 GSM1658004,0,343 GSM1658083,0,295 GSM1658085,0,0 GSM1658086,0,233 GSM1658089,0,0 GSM1658092,0,1 GSM1658094,0,74 GSM1658096,0,1 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,0 GSM1658100,0,91 GSM1658102,0,317 GSM1658109,0,198 GSM1658112,0,223 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,1 GSM1658223,0,83 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,1 GSM1658227,0,103 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,267 GSM1658231,0,15 GSM1658232,0,575 GSM1658233,0,95 GSM1658234,0,550 GSM1658235,0,21 GSM1658236,0,437 GSM1658237,0,261 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,0 GSM1658240,0,361 GSM1658241,0,83 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,58 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,69 GSM1658247,0,110 GSM1658248,0,162 GSM1658249,0,62 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,122 GSM1658255,0,170 GSM1658257,0,310 GSM1658259,0,134 GSM1658262,0,122 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,303 GSM1658268,0,102 GSM1658270,0,23 GSM1658272,0,103 GSM1658275,0,598 GSM1658277,0,0 GSM1658279,0,121 GSM1658281,0,88 GSM1658284,0,76 GSM1658286,0,676 GSM1658288,0,254 GSM1658290,0,40 GSM1658292,0,62 GSM1658294,0,221 GSM1658297,0,58 GSM1658299,0,143 GSM1658301,0,1 GSM1658305,0,280 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,8 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,167 GSM1658311,0,53 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,135 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,118 GSM1658316,0,2 GSM1658317,0,496 GSM1658318,0,14 GSM1658319,0,19 GSM1658320,0,2 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,186 GSM1658323,0,296 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,2 GSM1658326,0,120 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,0 GSM1658330,0,97 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,9 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,1 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,203 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,23 GSM1658339,0,125 GSM1658340,0,70 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,0 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,0 GSM1658348,0,132 GSM1658349,0,57 GSM1658350,0,1 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,176 GSM1658353,0,318 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,195 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,52 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,91 GSM1658361,0,176 GSM1658362,0,2 GSM1658363,0,0 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,85 GSM1658366,0,579 GSM1658203,0,101 GSM1658204,0,1 GSM1658205,0,371 GSM1658206,0,165 GSM1658207,0,512 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,25 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,171 GSM1658212,0,202 GSM1658213,0,212 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,275 GSM1658216,0,2 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,225 GSM1658219,0,3 GSM1658220,0,7 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,262 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,303 GSM1658355,0,4 GSM1657872,0,313 GSM1657874,0,148 GSM1657875,0,3 GSM1657878,0,0 GSM1657879,0,92 GSM1657880,0,7 GSM1657882,0,183 GSM1657883,0,201 GSM1657884,0,116 GSM1657886,0,180 GSM1657887,0,228 GSM1657888,0,119 GSM1657895,0,800 GSM1657896,0,1 GSM1657897,0,0 GSM1657929,0,0 GSM1657936,0,50 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,352 GSM1658011,0,98 GSM1658013,0,166 GSM1658015,0,104 GSM1658019,0,295 GSM1658022,0,72 GSM1658023,0,0 GSM1658024,0,0 GSM1658028,0,134 GSM1658030,0,614 GSM1658036,0,0 GSM1658044,0,333 GSM1658047,0,0 GSM1658057,0,94 GSM1658070,0,209 GSM1658074,0,365 GSM1658075,0,312 GSM1658076,0,0 GSM1658077,0,0 GSM1658132,0,226 GSM1658144,0,2 GSM1658154,0,120 GSM1658161,0,779 GSM1658165,0,282 GSM1658178,0,418 GSM1658183,0,387 GSM1657934,0,185 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,33 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,420 GSM1657930,0,256 GSM1657931,0,0 GSM1657933,0,115 GSM1657935,0,60 GSM1657937,0,136 GSM1657939,0,0 GSM1657940,0,52 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,4 GSM1657943,0,37 GSM1657945,0,27 GSM1657946,0,116 GSM1657948,0,30 GSM1657949,0,35 GSM1657950,0,19 GSM1657951,0,1 GSM1657952,0,137 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,243 GSM1657955,0,0 GSM1657956,0,175 GSM1657957,0,112 GSM1657958,0,41 GSM1657959,0,0 GSM1657960,0,367 GSM1657961,0,20 GSM1657962,0,210 GSM1657963,0,102 GSM1657964,0,361 GSM1657966,0,116 GSM1657967,0,338 GSM1657968,0,1 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,145 GSM1657973,0,105 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,14 GSM1657977,0,382 GSM1657978,0,25 GSM1657980,0,31 GSM1657982,0,226 GSM1657983,0,1 GSM1657984,0,25 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,262 GSM1657987,0,188 GSM1657988,0,0 GSM1657989,0,0 GSM1657990,0,139 GSM1657991,0,0 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,386 GSM1658005,0,118 GSM1658009,0,134 GSM1658012,0,107 GSM1658014,0,720 GSM1658025,0,17 GSM1658032,0,173 GSM1658033,0,320 GSM1658034,0,286 GSM1658035,0,50 GSM1658037,0,347 GSM1658038,0,0 GSM1658039,0,395 GSM1658040,0,250 GSM1658041,0,440 GSM1658042,0,1 GSM1658046,0,56 GSM1658052,0,158 GSM1658058,0,1 GSM1658063,0,207 GSM1658080,0,0 GSM1658084,0,101 GSM1658087,0,85 GSM1658090,0,30 GSM1658091,0,103 GSM1658095,0,0 GSM1658101,0,181 GSM1658103,0,9 GSM1658104,0,0 GSM1658105,0,0 GSM1658106,0,33 GSM1658107,0,11 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,64 GSM1658111,0,35 GSM1658113,0,663 GSM1658114,0,132 GSM1658115,0,0 GSM1658127,0,20 GSM1658128,0,1 GSM1658129,0,136 GSM1658131,0,75 GSM1658134,0,97 GSM1658135,0,0 GSM1658136,0,46 GSM1658137,0,266 GSM1658138,0,0 GSM1658139,0,17 GSM1658141,0,70 GSM1658143,0,9 GSM1658145,0,103 GSM1658146,0,16 GSM1658147,0,163 GSM1658148,0,238 GSM1658149,0,61 GSM1658150,0,162 GSM1658151,0,150 GSM1658152,0,71 GSM1658153,0,0 GSM1658156,0,171 GSM1658158,0,28 GSM1658160,0,48 GSM1658163,0,95 GSM1658166,0,111 GSM1658169,0,56 GSM1658170,0,180 GSM1658171,0,0 GSM1658172,0,47 GSM1658175,0,0 GSM1658176,0,219 GSM1658177,0,355 GSM1658181,0,0 GSM1658182,0,358 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,54 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,23 GSM1658200,0,10 GSM1657871,0,71 GSM1657873,0,0 GSM1657876,0,245 GSM1657877,0,114 GSM1657881,0,175 GSM1657889,0,437 GSM1657890,0,245 GSM1657891,0,425 GSM1657892,0,0 GSM1657894,0,283 GSM1657898,0,218 GSM1657899,0,226 GSM1657900,0,485 GSM1657901,0,648 GSM1657902,0,146 GSM1657944,0,6 GSM1658018,0,140 GSM1658088,0,61 GSM1658093,0,0 GSM1658097,0,0 GSM1658130,0,0 GSM1658133,0,266 GSM1658140,0,316 GSM1658155,0,29 GSM1658157,0,11 GSM1658159,0,155 GSM1658162,0,10 GSM1658164,0,240 GSM1658167,0,44 GSM1658173,0,235 GSM1658179,0,0 GSM1658180,0,458 GSM1657893,0,244 GSM1657903,0,13 GSM1658117,0,30 GSM1658122,0,74 GSM1658126,0,32 GSM1657905,0,17 GSM1657912,0,215 GSM1657910,0,23 GSM1657918,0,152 GSM1657919,0,390 GSM1657923,0,59 GSM1657925,0,0 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,13 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,115 GSM1658118,0,15 GSM1658119,0,0 GSM1658120,0,14 GSM1658123,0,38 GSM1658124,0,5 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,0 GSM1657906,0,0 GSM1657907,0,2 GSM1657908,0,7 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,0 GSM1657913,0,116 GSM1657914,0,579 GSM1657915,0,18 GSM1657916,0,290 GSM1657917,0,5 GSM1657920,0,0 GSM1657921,0,72 GSM1657922,0,238 GSM1657924,0,0 GSM1657928,0,179
Synonyms | ERS-24;SEC22L1 |
Description | SEC22 homolog B, vesicle trafficking protein (gene/pseudogene) |
---|---|
Chromosome | 1q21.1 |
Database Reference | MIM:604029 HGNC:10700 HPRD:04939 Vega:OTTHUMG00000185008 |
See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
Dataset | GSE67835 |
SEC22B expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
---|---|---|---|
cortex astrocytes | 0 | 63.5 | 428 |
cortex endothelial | 0 | 74 | 635 |
cortex fetal-quiescent | 0 | 52.5 | 676 |
cortex fetal-replicating | 0 | 7 | 512 |
cortex hybrid | 0 | 119.5 | 800 |
cortex microglia | 0 | 0 | 420 |
cortex neurons | 0 | 53 | 720 |
cortex oligodendrocytes | 0 | 150.5 | 648 |
cortex OPC | 13 | 128.5 | 244 |
hippocampus endothelial | 30 | 32 | 74 |
hippocampus hybrid | 17 | 116 | 215 |
hippocampus microglia | 0 | 18 | 390 |
hippocampus neurons | 115 | 115 | 115 |
hippocampus oligodendrocytes | 0 | 9.5 | 38 |
hippocampus OPC | 0 | 6 | 579 |
Comparing SEC22B expression between groups | FDR |
---|---|
hippocampus microglia VS hippocampus neurons | NS |
hippocampus microglia VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
hippocampus neurons VS hippocampu | NS |
hippocampus neurons VS hippocampus oligodendro | NS |
hippocampus oligodendrocytes VS hippocampus OPC | NS |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]