gene,0,0 GSM1657885,0,0 GSM1657932,0,0 GSM1657938,0,0 GSM1657965,0,0 GSM1657969,0,0 GSM1657975,0,0 GSM1657979,0,0 GSM1657981,0,0 GSM1657992,0,0 GSM1657998,0,0 GSM1658000,0,0 GSM1658006,0,0 GSM1658007,0,0 GSM1658010,0,0 GSM1658016,0,0 GSM1658017,0,0 GSM1658020,0,0 GSM1658021,0,0 GSM1658026,0,0 GSM1658027,0,0 GSM1658029,0,0 GSM1658031,0,0 GSM1658043,0,0 GSM1658045,0,0 GSM1658048,0,0 GSM1658049,0,0 GSM1658050,0,0 GSM1658051,0,0 GSM1658053,0,0 GSM1658054,0,0 GSM1658055,0,0 GSM1658056,0,0 GSM1658059,0,0 GSM1658060,0,0 GSM1658061,0,0 GSM1658062,0,0 GSM1658064,0,0 GSM1658065,0,0 GSM1658066,0,0 GSM1658067,0,0 GSM1658068,0,0 GSM1658069,0,0 GSM1658071,0,0 GSM1658072,0,0 GSM1658073,0,0 GSM1658078,0,0 GSM1658079,0,0 GSM1658081,0,0 GSM1658082,0,0 GSM1658142,0,0 GSM1658168,0,0 GSM1658174,0,0 GSM1658184,0,0 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,0 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,0 GSM1658201,0,0 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,0 GSM1657993,0,11 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,0 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,198 GSM1658086,0,0 GSM1658089,0,0 GSM1658092,0,0 GSM1658094,0,0 GSM1658096,0,0 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,0 GSM1658100,0,0 GSM1658102,0,0 GSM1658109,0,0 GSM1658112,0,62 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,1 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,1 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,0 GSM1658231,0,0 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,0 GSM1658234,0,0 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,0 GSM1658240,0,0 GSM1658241,0,0 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,0 GSM1658245,0,1 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,0 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,0 GSM1658257,0,0 GSM1658259,0,0 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,0 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,0 GSM1658292,0,0 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,0 GSM1658301,0,0 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,0 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,0 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,0 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,0 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,0 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,0 GSM1658330,0,0 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,0 GSM1658340,0,0 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,0 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,0 GSM1658348,0,0 GSM1658349,0,0 GSM1658350,0,0 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,0 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,0 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,0 GSM1658204,0,0 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,0 GSM1658207,0,0 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,0 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,0 GSM1658212,0,0 GSM1658213,0,0 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,0 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,0 GSM1658220,0,0 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,0 GSM1658355,0,0 GSM1657872,0,0 GSM1657874,0,0 GSM1657875,0,0 GSM1657878,0,1 GSM1657879,0,82 GSM1657880,0,0 GSM1657882,0,0 GSM1657883,0,0 GSM1657884,0,0 GSM1657886,0,2 GSM1657887,0,99 GSM1657888,0,1 GSM1657895,0,51 GSM1657896,0,27 GSM1657897,0,614 GSM1657929,0,0 GSM1657936,0,37 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,0 GSM1658011,0,0 GSM1658013,0,0 GSM1658015,0,0 GSM1658019,0,0 GSM1658022,0,0 GSM1658023,0,1 GSM1658024,0,0 GSM1658028,0,0 GSM1658030,0,0 GSM1658036,0,0 GSM1658044,0,0 GSM1658047,0,0 GSM1658057,0,0 GSM1658070,0,0 GSM1658074,0,0 GSM1658075,0,0 GSM1658076,0,0 GSM1658077,0,0 GSM1658132,0,0 GSM1658144,0,0 GSM1658154,0,0 GSM1658161,0,0 GSM1658165,0,0 GSM1658178,0,0 GSM1658183,0,0 GSM1657934,0,0 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,0 GSM1657930,0,0 GSM1657931,0,0 GSM1657933,0,0 GSM1657935,0,0 GSM1657937,0,0 GSM1657939,0,0 GSM1657940,0,0 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,0 GSM1657943,0,0 GSM1657945,0,0 GSM1657946,0,0 GSM1657948,0,0 GSM1657949,0,0 GSM1657950,0,0 GSM1657951,0,0 GSM1657952,0,0 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,0 GSM1657955,0,0 GSM1657956,0,0 GSM1657957,0,0 GSM1657958,0,0 GSM1657959,0,0 GSM1657960,0,0 GSM1657961,0,0 GSM1657962,0,0 GSM1657963,0,0 GSM1657964,0,0 GSM1657966,0,0 GSM1657967,0,0 GSM1657968,0,0 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,0 GSM1657973,0,0 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,12 GSM1657977,0,0 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,0 GSM1657982,0,0 GSM1657983,0,0 GSM1657984,0,0 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,0 GSM1657987,0,0 GSM1657988,0,0 GSM1657989,0,0 GSM1657990,0,0 GSM1657991,0,0 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,0 GSM1658005,0,0 GSM1658009,0,0 GSM1658012,0,0 GSM1658014,0,0 GSM1658025,0,0 GSM1658032,0,0 GSM1658033,0,0 GSM1658034,0,0 GSM1658035,0,0 GSM1658037,0,0 GSM1658038,0,0 GSM1658039,0,0 GSM1658040,0,0 GSM1658041,0,1 GSM1658042,0,0 GSM1658046,0,0 GSM1658052,0,0 GSM1658058,0,0 GSM1658063,0,0 GSM1658080,0,0 GSM1658084,0,0 GSM1658087,0,0 GSM1658090,0,0 GSM1658091,0,240 GSM1658095,0,2 GSM1658101,0,0 GSM1658103,0,0 GSM1658104,0,0 GSM1658105,0,0 GSM1658106,0,0 GSM1658107,0,0 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,0 GSM1658111,0,0 GSM1658113,0,0 GSM1658114,0,0 GSM1658115,0,0 GSM1658127,0,0 GSM1658128,0,1 GSM1658129,0,0 GSM1658131,0,2 GSM1658134,0,0 GSM1658135,0,90 GSM1658136,0,0 GSM1658137,0,0 GSM1658138,0,0 GSM1658139,0,6 GSM1658141,0,0 GSM1658143,0,1 GSM1658145,0,0 GSM1658146,0,0 GSM1658147,0,0 GSM1658148,0,0 GSM1658149,0,0 GSM1658150,0,0 GSM1658151,0,13 GSM1658152,0,0 GSM1658153,0,165 GSM1658156,0,0 GSM1658158,0,0 GSM1658160,0,0 GSM1658163,0,0 GSM1658166,0,0 GSM1658169,0,0 GSM1658170,0,0 GSM1658171,0,1 GSM1658172,0,0 GSM1658175,0,0 GSM1658176,0,0 GSM1658177,0,0 GSM1658181,0,0 GSM1658182,0,0 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,0 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,0 GSM1657873,0,1910 GSM1657876,0,8 GSM1657877,0,175 GSM1657881,0,3209 GSM1657889,0,1783 GSM1657890,0,2328 GSM1657891,0,425 GSM1657892,0,0 GSM1657894,0,1017 GSM1657898,0,0 GSM1657899,0,1208 GSM1657900,0,9 GSM1657901,0,180 GSM1657902,0,0 GSM1657944,0,0 GSM1658018,0,0 GSM1658088,0,25 GSM1658093,0,1244 GSM1658097,0,472 GSM1658130,0,22 GSM1658133,0,1081 GSM1658140,0,4 GSM1658155,0,73 GSM1658157,0,518 GSM1658159,0,2234 GSM1658162,0,418 GSM1658164,0,2612 GSM1658167,0,891 GSM1658173,0,610 GSM1658179,0,36 GSM1658180,0,0 GSM1657893,0,1 GSM1657903,0,1 GSM1658117,0,0 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,0 GSM1657912,0,0 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,0 GSM1657919,0,0 GSM1657923,0,0 GSM1657925,0,0 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,0 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,0 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,0 GSM1658120,0,76 GSM1658123,0,8 GSM1658124,0,0 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,0 GSM1657906,0,0 GSM1657907,0,0 GSM1657908,0,0 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,0 GSM1657913,0,0 GSM1657914,0,0 GSM1657915,0,1 GSM1657916,0,0 GSM1657917,0,1 GSM1657920,0,0 GSM1657921,0,0 GSM1657922,0,0 GSM1657924,0,0 GSM1657928,0,0
Synonyms | CMT4C;MNMN |
Description | SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2 |
---|---|
Chromosome | 5q32 |
Database Reference | MIM:608206 HGNC:29427 HPRD:10496 Vega:OTTHUMG00000129930 |
See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
Dataset | GSE67835 |
SH3TC2 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
---|---|---|---|
cortex astrocytes | 0 | 0 | 0 |
cortex endothelial | 0 | 0 | 198 |
cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 1 |
cortex fetal-replicating | 0 | 0 | 0 |
cortex hybrid | 0 | 0 | 614 |
cortex microglia | 0 | 0 | 0 |
cortex neurons | 0 | 0 | 240 |
cortex oligodendrocytes | 0 | 299 | 3,209 |
cortex OPC | 1 | 1 | 1 |
hippocampus endothelial | 0 | 0 | 0 |
hippocampus hybrid | 0 | 0 | 0 |
hippocampus microglia | 0 | 0 | 0 |
hippocampus neurons | 0 | 0 | 0 |
hippocampus oligodendrocytes | 0 | 0 | 76 |
hippocampus OPC | 0 | 0 | 1 |
Comparing SH3TC2 expression between groups | FDR |
---|---|
hippocampus microglia VS hippocampus neurons | NS |
hippocampus microglia VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
hippocampus neurons VS hippocampu | NS |
hippocampus neurons VS hippocampus oligodendro | NS |
hippocampus oligodendrocytes VS hippocampus OPC | NS |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]