gene,0,0 GSM1657885,0,1 GSM1657932,0,21 GSM1657938,0,0 GSM1657965,0,3 GSM1657969,0,0 GSM1657975,0,0 GSM1657979,0,45 GSM1657981,0,205 GSM1657992,0,1 GSM1657998,0,0 GSM1658000,0,0 GSM1658006,0,7 GSM1658007,0,0 GSM1658010,0,2 GSM1658016,0,0 GSM1658017,0,0 GSM1658020,0,0 GSM1658021,0,0 GSM1658026,0,0 GSM1658027,0,0 GSM1658029,0,97 GSM1658031,0,0 GSM1658043,0,59 GSM1658045,0,213 GSM1658048,0,1 GSM1658049,0,2 GSM1658050,0,6 GSM1658051,0,2 GSM1658053,0,130 GSM1658054,0,2 GSM1658055,0,4 GSM1658056,0,4 GSM1658059,0,0 GSM1658060,0,53 GSM1658061,0,3 GSM1658062,0,18 GSM1658064,0,24 GSM1658065,0,5 GSM1658066,0,2 GSM1658067,0,235 GSM1658068,0,6 GSM1658069,0,6 GSM1658071,0,11 GSM1658072,0,6 GSM1658073,0,4 GSM1658078,0,2 GSM1658079,0,180 GSM1658081,0,4 GSM1658082,0,1 GSM1658142,0,14 GSM1658168,0,0 GSM1658174,0,0 GSM1658184,0,10 GSM1658185,0,2 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,0 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,143 GSM1658199,0,0 GSM1658201,0,0 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,0 GSM1657993,0,0 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,0 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,0 GSM1658086,0,2 GSM1658089,0,0 GSM1658092,0,0 GSM1658094,0,0 GSM1658096,0,32 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,1 GSM1658100,0,1 GSM1658102,0,0 GSM1658109,0,0 GSM1658112,0,24 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,3 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,45 GSM1658231,0,3 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,36 GSM1658234,0,0 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,41 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,0 GSM1658240,0,0 GSM1658241,0,209 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,71 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,4 GSM1658249,0,51 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,0 GSM1658257,0,133 GSM1658259,0,170 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,1 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,5 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,0 GSM1658279,0,117 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,63 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,140 GSM1658292,0,19 GSM1658294,0,2 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,30 GSM1658301,0,103 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,65 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,0 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,14 GSM1658314,0,31 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,7 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,9 GSM1658324,0,31 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,39 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,0 GSM1658330,0,89 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,25 GSM1658340,0,0 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,8 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,1 GSM1658348,0,2 GSM1658349,0,40 GSM1658350,0,1 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,7 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,0 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,20 GSM1658204,0,66 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,0 GSM1658207,0,0 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,269 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,0 GSM1658212,0,0 GSM1658213,0,29 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,287 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,0 GSM1658220,0,264 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,0 GSM1658355,0,8 GSM1657872,0,0 GSM1657874,0,0 GSM1657875,0,1 GSM1657878,0,28 GSM1657879,0,24 GSM1657880,0,0 GSM1657882,0,92 GSM1657883,0,0 GSM1657884,0,0 GSM1657886,0,28 GSM1657887,0,16 GSM1657888,0,0 GSM1657895,0,205 GSM1657896,0,0 GSM1657897,0,0 GSM1657929,0,107 GSM1657936,0,13 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,0 GSM1658011,0,116 GSM1658013,0,314 GSM1658015,0,65 GSM1658019,0,0 GSM1658022,0,7 GSM1658023,0,0 GSM1658024,0,0 GSM1658028,0,34 GSM1658030,0,0 GSM1658036,0,0 GSM1658044,0,0 GSM1658047,0,1 GSM1658057,0,0 GSM1658070,0,241 GSM1658074,0,160 GSM1658075,0,0 GSM1658076,0,1 GSM1658077,0,7 GSM1658132,0,0 GSM1658144,0,19 GSM1658154,0,0 GSM1658161,0,7 GSM1658165,0,13 GSM1658178,0,18 GSM1658183,0,0 GSM1657934,0,0 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,0 GSM1657930,0,1 GSM1657931,0,0 GSM1657933,0,21 GSM1657935,0,0 GSM1657937,0,84 GSM1657939,0,7 GSM1657940,0,84 GSM1657941,0,62 GSM1657942,0,134 GSM1657943,0,17 GSM1657945,0,49 GSM1657946,0,111 GSM1657948,0,66 GSM1657949,0,32 GSM1657950,0,0 GSM1657951,0,0 GSM1657952,0,4 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,68 GSM1657955,0,0 GSM1657956,0,0 GSM1657957,0,205 GSM1657958,0,83 GSM1657959,0,180 GSM1657960,0,52 GSM1657961,0,6 GSM1657962,0,66 GSM1657963,0,0 GSM1657964,0,126 GSM1657966,0,220 GSM1657967,0,0 GSM1657968,0,171 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,0 GSM1657973,0,49 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,36 GSM1657977,0,252 GSM1657978,0,10 GSM1657980,0,0 GSM1657982,0,18 GSM1657983,0,46 GSM1657984,0,90 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,0 GSM1657987,0,175 GSM1657988,0,3 GSM1657989,0,26 GSM1657990,0,0 GSM1657991,0,0 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,31 GSM1658005,0,0 GSM1658009,0,0 GSM1658012,0,1 GSM1658014,0,7 GSM1658025,0,354 GSM1658032,0,141 GSM1658033,0,0 GSM1658034,0,268 GSM1658035,0,1 GSM1658037,0,217 GSM1658038,0,0 GSM1658039,0,1 GSM1658040,0,28 GSM1658041,0,7 GSM1658042,0,151 GSM1658046,0,21 GSM1658052,0,1 GSM1658058,0,3 GSM1658063,0,0 GSM1658080,0,2 GSM1658084,0,52 GSM1658087,0,0 GSM1658090,0,0 GSM1658091,0,0 GSM1658095,0,101 GSM1658101,0,1146 GSM1658103,0,0 GSM1658104,0,0 GSM1658105,0,0 GSM1658106,0,0 GSM1658107,0,0 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,0 GSM1658111,0,0 GSM1658113,0,33 GSM1658114,0,0 GSM1658115,0,0 GSM1658127,0,29 GSM1658128,0,26 GSM1658129,0,11 GSM1658131,0,13 GSM1658134,0,32 GSM1658135,0,22 GSM1658136,0,0 GSM1658137,0,1 GSM1658138,0,30 GSM1658139,0,0 GSM1658141,0,39 GSM1658143,0,0 GSM1658145,0,14 GSM1658146,0,0 GSM1658147,0,0 GSM1658148,0,0 GSM1658149,0,0 GSM1658150,0,1 GSM1658151,0,0 GSM1658152,0,7 GSM1658153,0,11 GSM1658156,0,0 GSM1658158,0,8 GSM1658160,0,33 GSM1658163,0,0 GSM1658166,0,46 GSM1658169,0,0 GSM1658170,0,9 GSM1658171,0,67 GSM1658172,0,3 GSM1658175,0,0 GSM1658176,0,67 GSM1658177,0,8 GSM1658181,0,48 GSM1658182,0,31 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,22 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,4 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,0 GSM1657873,0,450 GSM1657876,0,0 GSM1657877,0,0 GSM1657881,0,0 GSM1657889,0,1 GSM1657890,0,10 GSM1657891,0,0 GSM1657892,0,313 GSM1657894,0,125 GSM1657898,0,0 GSM1657899,0,154 GSM1657900,0,0 GSM1657901,0,24 GSM1657902,0,7 GSM1657944,0,0 GSM1658018,0,0 GSM1658088,0,0 GSM1658093,0,0 GSM1658097,0,31 GSM1658130,0,1 GSM1658133,0,0 GSM1658140,0,0 GSM1658155,0,0 GSM1658157,0,35 GSM1658159,0,0 GSM1658162,0,0 GSM1658164,0,79 GSM1658167,0,340 GSM1658173,0,0 GSM1658179,0,41 GSM1658180,0,0 GSM1657893,0,53 GSM1657903,0,1 GSM1658117,0,247 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,0 GSM1657912,0,3 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,6 GSM1657919,0,0 GSM1657923,0,241 GSM1657925,0,52 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,2 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,0 GSM1658118,0,107 GSM1658119,0,0 GSM1658120,0,23 GSM1658123,0,0 GSM1658124,0,0 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,4 GSM1657906,0,107 GSM1657907,0,0 GSM1657908,0,4 GSM1657909,0,186 GSM1657911,0,283 GSM1657913,0,67 GSM1657914,0,0 GSM1657915,0,0 GSM1657916,0,0 GSM1657917,0,0 GSM1657920,0,0 GSM1657921,0,0 GSM1657922,0,0 GSM1657924,0,4 GSM1657928,0,0
| Synonyms | EST1B;LPTS-RP1;LPTSRP1;SMG-5 |
| Description | SMG5, nonsense mediated mRNA decay factor |
|---|---|
| Chromosome | 1q21.2 |
| Database Reference | MIM:610962 HGNC:24644 HPRD:16869 Vega:OTTHUMG00000017491 |
| See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
| Dataset | GSE67835 |
| SMG5 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
|---|---|---|---|
| cortex astrocytes | 0 | 2 | 235 |
| cortex endothelial | 0 | 0 | 32 |
| cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 209 |
| cortex fetal-replicating | 0 | 0 | 287 |
| cortex hybrid | 0 | 1 | 314 |
| cortex microglia | 0 | 0 | 0 |
| cortex neurons | 0 | 5 | 1,146 |
| cortex oligodendrocytes | 0 | 0 | 450 |
| cortex OPC | 1 | 27 | 53 |
| hippocampus endothelial | 0 | 0 | 247 |
| hippocampus hybrid | 0 | 1.5 | 3 |
| hippocampus microglia | 0 | 1 | 241 |
| hippocampus neurons | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus oligodendrocytes | 0 | 0 | 107 |
| hippocampus OPC | 0 | 0 | 283 |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]
