gene,0,0 GSM1657885,0,2 GSM1657932,0,296 GSM1657938,0,65 GSM1657965,0,2 GSM1657969,0,97 GSM1657975,0,16 GSM1657979,0,208 GSM1657981,0,28 GSM1657992,0,47 GSM1657998,0,48 GSM1658000,0,19 GSM1658006,0,21 GSM1658007,0,174 GSM1658010,0,79 GSM1658016,0,108 GSM1658017,0,220 GSM1658020,0,10 GSM1658021,0,128 GSM1658026,0,53 GSM1658027,0,1 GSM1658029,0,200 GSM1658031,0,135 GSM1658043,0,164 GSM1658045,0,51 GSM1658048,0,76 GSM1658049,0,40 GSM1658050,0,173 GSM1658051,0,46 GSM1658053,0,23 GSM1658054,0,123 GSM1658055,0,0 GSM1658056,0,104 GSM1658059,0,116 GSM1658060,0,101 GSM1658061,0,90 GSM1658062,0,0 GSM1658064,0,30 GSM1658065,0,149 GSM1658066,0,10 GSM1658067,0,1 GSM1658068,0,5 GSM1658069,0,21 GSM1658071,0,83 GSM1658072,0,3 GSM1658073,0,68 GSM1658078,0,28 GSM1658079,0,111 GSM1658081,0,12 GSM1658082,0,31 GSM1658142,0,2 GSM1658168,0,29 GSM1658174,0,147 GSM1658184,0,277 GSM1658185,0,48 GSM1658186,0,1 GSM1658187,0,81 GSM1658190,0,104 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,3 GSM1658199,0,4 GSM1658201,0,21 GSM1658202,0,9 GSM1657972,0,0 GSM1657993,0,0 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,1 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,0 GSM1658086,0,1 GSM1658089,0,2 GSM1658092,0,1 GSM1658094,0,0 GSM1658096,0,0 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,11 GSM1658100,0,19 GSM1658102,0,0 GSM1658109,0,0 GSM1658112,0,1 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,0 GSM1658231,0,0 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,0 GSM1658234,0,22 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,17 GSM1658240,0,0 GSM1658241,0,0 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,0 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,0 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,0 GSM1658257,0,0 GSM1658259,0,27 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,1 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,0 GSM1658292,0,3 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,0 GSM1658301,0,0 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,2 GSM1658307,0,0 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,0 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,0 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,0 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,0 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,1 GSM1658330,0,0 GSM1658331,0,16 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,0 GSM1658340,0,0 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,2 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,1 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,0 GSM1658348,0,0 GSM1658349,0,0 GSM1658350,0,0 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,0 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,1 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,0 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,74 GSM1658204,0,147 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,38 GSM1658207,0,0 GSM1658208,0,9 GSM1658209,0,126 GSM1658210,0,44 GSM1658211,0,5 GSM1658212,0,0 GSM1658213,0,106 GSM1658214,0,353 GSM1658215,0,235 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,7 GSM1658219,0,6 GSM1658220,0,23 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,91 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,15 GSM1658304,0,68 GSM1658347,0,296 GSM1658355,0,0 GSM1657872,0,0 GSM1657874,0,1 GSM1657875,0,0 GSM1657878,0,0 GSM1657879,0,60 GSM1657880,0,0 GSM1657882,0,42 GSM1657883,0,24 GSM1657884,0,1 GSM1657886,0,3 GSM1657887,0,0 GSM1657888,0,60 GSM1657895,0,0 GSM1657896,0,0 GSM1657897,0,0 GSM1657929,0,3 GSM1657936,0,79 GSM1657947,0,15 GSM1658008,0,28 GSM1658011,0,25 GSM1658013,0,20 GSM1658015,0,14 GSM1658019,0,65 GSM1658022,0,18 GSM1658023,0,6 GSM1658024,0,13 GSM1658028,0,92 GSM1658030,0,4 GSM1658036,0,1 GSM1658044,0,2 GSM1658047,0,168 GSM1658057,0,99 GSM1658070,0,52 GSM1658074,0,130 GSM1658075,0,27 GSM1658076,0,61 GSM1658077,0,2 GSM1658132,0,91 GSM1658144,0,3 GSM1658154,0,9 GSM1658161,0,34 GSM1658165,0,10 GSM1658178,0,44 GSM1658183,0,5 GSM1657934,0,1 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,0 GSM1657930,0,0 GSM1657931,0,0 GSM1657933,0,0 GSM1657935,0,37 GSM1657937,0,0 GSM1657939,0,0 GSM1657940,0,1 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,4 GSM1657943,0,7 GSM1657945,0,35 GSM1657946,0,0 GSM1657948,0,0 GSM1657949,0,10 GSM1657950,0,0 GSM1657951,0,21 GSM1657952,0,0 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,21 GSM1657955,0,4 GSM1657956,0,0 GSM1657957,0,0 GSM1657958,0,4 GSM1657959,0,6 GSM1657960,0,0 GSM1657961,0,0 GSM1657962,0,0 GSM1657963,0,0 GSM1657964,0,0 GSM1657966,0,62 GSM1657967,0,29 GSM1657968,0,2 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,0 GSM1657973,0,3 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,2 GSM1657977,0,22 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,9 GSM1657982,0,1 GSM1657983,0,0 GSM1657984,0,1 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,0 GSM1657987,0,26 GSM1657988,0,0 GSM1657989,0,1 GSM1657990,0,2 GSM1657991,0,9 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,80 GSM1658005,0,16 GSM1658009,0,63 GSM1658012,0,16 GSM1658014,0,1 GSM1658025,0,23 GSM1658032,0,0 GSM1658033,0,0 GSM1658034,0,88 GSM1658035,0,10 GSM1658037,0,0 GSM1658038,0,0 GSM1658039,0,2 GSM1658040,0,52 GSM1658041,0,0 GSM1658042,0,0 GSM1658046,0,8 GSM1658052,0,4 GSM1658058,0,62 GSM1658063,0,31 GSM1658080,0,182 GSM1658084,0,0 GSM1658087,0,0 GSM1658090,0,14 GSM1658091,0,10 GSM1658095,0,165 GSM1658101,0,0 GSM1658103,0,31 GSM1658104,0,25 GSM1658105,0,9 GSM1658106,0,0 GSM1658107,0,1 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,0 GSM1658111,0,1 GSM1658113,0,2 GSM1658114,0,2 GSM1658115,0,5 GSM1658127,0,61 GSM1658128,0,0 GSM1658129,0,3 GSM1658131,0,2 GSM1658134,0,16 GSM1658135,0,8 GSM1658136,0,202 GSM1658137,0,1 GSM1658138,0,6 GSM1658139,0,8 GSM1658141,0,1 GSM1658143,0,33 GSM1658145,0,3 GSM1658146,0,0 GSM1658147,0,10 GSM1658148,0,0 GSM1658149,0,0 GSM1658150,0,48 GSM1658151,0,1 GSM1658152,0,0 GSM1658153,0,26 GSM1658156,0,0 GSM1658158,0,0 GSM1658160,0,53 GSM1658163,0,8 GSM1658166,0,0 GSM1658169,0,0 GSM1658170,0,3 GSM1658171,0,91 GSM1658172,0,3 GSM1658175,0,32 GSM1658176,0,19 GSM1658177,0,0 GSM1658181,0,18 GSM1658182,0,5 GSM1658192,0,16 GSM1658194,0,2 GSM1658195,0,0 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,5 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,2 GSM1657873,0,0 GSM1657876,0,39 GSM1657877,0,6 GSM1657881,0,1 GSM1657889,0,0 GSM1657890,0,0 GSM1657891,0,15 GSM1657892,0,0 GSM1657894,0,5 GSM1657898,0,1 GSM1657899,0,11 GSM1657900,0,3 GSM1657901,0,0 GSM1657902,0,1 GSM1657944,0,4 GSM1658018,0,452 GSM1658088,0,15 GSM1658093,0,1 GSM1658097,0,0 GSM1658130,0,11 GSM1658133,0,25 GSM1658140,0,14 GSM1658155,0,77 GSM1658157,0,33 GSM1658159,0,6 GSM1658162,0,454 GSM1658164,0,0 GSM1658167,0,11 GSM1658173,0,62 GSM1658179,0,167 GSM1658180,0,3 GSM1657893,0,0 GSM1657903,0,0 GSM1658117,0,1 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,1 GSM1657912,0,24 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,0 GSM1657919,0,0 GSM1657923,0,0 GSM1657925,0,0 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,0 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,0 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,0 GSM1658120,0,29 GSM1658123,0,0 GSM1658124,0,1 GSM1658125,0,0 GSM1657904,0,0 GSM1657906,0,0 GSM1657907,0,86 GSM1657908,0,3 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,1 GSM1657913,0,50 GSM1657914,0,104 GSM1657915,0,14 GSM1657916,0,4 GSM1657917,0,48 GSM1657920,0,0 GSM1657921,0,0 GSM1657922,0,0 GSM1657924,0,0 GSM1657928,0,61
| Synonyms | ANOP3;MCOPS3 |
| Description | SRY-box 2 |
|---|---|
| Chromosome | 3q26.33 |
| Database Reference | MIM:184429 HGNC:11195 HPRD:08921 Vega:OTTHUMG00000158222 |
| See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
| Dataset | GSE67835 |
| SOX2 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
|---|---|---|---|
| cortex astrocytes | 0 | 47.5 | 296 |
| cortex endothelial | 0 | 0 | 19 |
| cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 27 |
| cortex fetal-replicating | 0 | 15 | 353 |
| cortex hybrid | 0 | 13.5 | 168 |
| cortex microglia | 0 | 0 | 1 |
| cortex neurons | 0 | 2 | 202 |
| cortex oligodendrocytes | 0 | 5.5 | 454 |
| cortex OPC | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus endothelial | 0 | 0 | 1 |
| hippocampus hybrid | 1 | 12.5 | 24 |
| hippocampus microglia | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus neurons | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus oligodendrocytes | 0 | 0 | 29 |
| hippocampus OPC | 0 | 2 | 104 |
| Comparing SOX2 expression between groups | FDR |
|---|---|
| cortex OPC VS hippocampus OPC | NS |
| cortex OPC VS hippocampus endothelial | NS |
| cortex OPC VS hippocampus hybrid | NS |
| cortex OPC VS hippocampus microglia | NS |
| cortex OPC VS hippocampus neurons | NS |
| cortex OPC VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
| cortex astrocytes VS cortex OPC | NS |
| cortex astrocytes VS cortex endothelial | 1.42368278057961e-10 |
| cortex astrocytes VS cortex fetal-quiescent | 2.15078437821473e-13 |
| cortex astrocytes VS cortex fetal-replicating | NS |
| cortex astrocytes VS cortex hybrid | 0.00467768612163572 |
| cortex astrocytes VS cortex microglia | 2.39820551428627e-06 |
| cortex astrocytes VS cortex neurons | 3.52888520373376e-06 |
| cortex astrocytes VS cortex oligodendrocytes | NS |
| cortex astrocytes VS hippocampus OPC | 0.00921537029435582 |
| cortex astrocytes VS hippocampus endothelial | 0.00131269405072178 |
| cortex astrocytes VS hippocampus hybrid | NS |
| cortex astrocytes VS hippocampus microglia | NS |
| cortex astrocytes VS hippocampus neurons | NS |
| cortex astrocytes VS hippocampus oligodendrocytes | 0.00053620989305411 |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]
