gene,0,0 GSM1657885,0,0 GSM1657932,0,1 GSM1657938,0,0 GSM1657965,0,832 GSM1657969,0,0 GSM1657975,0,0 GSM1657979,0,0 GSM1657981,0,24 GSM1657992,0,1 GSM1657998,0,55 GSM1658000,0,9 GSM1658006,0,0 GSM1658007,0,0 GSM1658010,0,0 GSM1658016,0,4 GSM1658017,0,0 GSM1658020,0,0 GSM1658021,0,0 GSM1658026,0,23 GSM1658027,0,0 GSM1658029,0,0 GSM1658031,0,1 GSM1658043,0,13 GSM1658045,0,0 GSM1658048,0,3 GSM1658049,0,1 GSM1658050,0,4 GSM1658051,0,0 GSM1658053,0,36 GSM1658054,0,446 GSM1658055,0,5 GSM1658056,0,2 GSM1658059,0,0 GSM1658060,0,8 GSM1658061,0,3 GSM1658062,0,4 GSM1658064,0,2 GSM1658065,0,1 GSM1658066,0,3 GSM1658067,0,3 GSM1658068,0,6 GSM1658069,0,36 GSM1658071,0,24 GSM1658072,0,28 GSM1658073,0,6 GSM1658078,0,0 GSM1658079,0,16 GSM1658081,0,8 GSM1658082,0,42 GSM1658142,0,13 GSM1658168,0,0 GSM1658174,0,0 GSM1658184,0,0 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,0 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,0 GSM1658201,0,3 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,0 GSM1657993,0,0 GSM1657995,0,2 GSM1658004,0,0 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,0 GSM1658086,0,0 GSM1658089,0,25 GSM1658092,0,0 GSM1658094,0,0 GSM1658096,0,0 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,0 GSM1658100,0,0 GSM1658102,0,0 GSM1658109,0,0 GSM1658112,0,71 GSM1658003,0,2 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,0 GSM1658231,0,0 GSM1658232,0,10 GSM1658233,0,290 GSM1658234,0,1 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,157 GSM1658239,0,0 GSM1658240,0,0 GSM1658241,0,0 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,17 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,0 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,2 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,0 GSM1658257,0,36 GSM1658259,0,26 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,0 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,1 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,0 GSM1658290,0,0 GSM1658292,0,0 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,65 GSM1658301,0,404 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,0 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,0 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,0 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,0 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,0 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,0 GSM1658329,0,57 GSM1658330,0,0 GSM1658331,0,0 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,0 GSM1658340,0,19 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,0 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,0 GSM1658348,0,48 GSM1658349,0,0 GSM1658350,0,0 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,0 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,0 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,0 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,3 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,0 GSM1658204,0,0 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,0 GSM1658207,0,207 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,133 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,0 GSM1658212,0,0 GSM1658213,0,0 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,5 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,1 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,0 GSM1658220,0,0 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,64 GSM1658355,0,0 GSM1657872,0,49 GSM1657874,0,0 GSM1657875,0,8 GSM1657878,0,2 GSM1657879,0,203 GSM1657880,0,135 GSM1657882,0,0 GSM1657883,0,0 GSM1657884,0,3 GSM1657886,0,2 GSM1657887,0,39 GSM1657888,0,9 GSM1657895,0,0 GSM1657896,0,0 GSM1657897,0,0 GSM1657929,0,0 GSM1657936,0,0 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,0 GSM1658011,0,53 GSM1658013,0,851 GSM1658015,0,0 GSM1658019,0,6 GSM1658022,0,16 GSM1658023,0,101 GSM1658024,0,67 GSM1658028,0,0 GSM1658030,0,0 GSM1658036,0,0 GSM1658044,0,0 GSM1658047,0,1 GSM1658057,0,1 GSM1658070,0,0 GSM1658074,0,1 GSM1658075,0,438 GSM1658076,0,5 GSM1658077,0,24 GSM1658132,0,171 GSM1658144,0,14 GSM1658154,0,0 GSM1658161,0,660 GSM1658165,0,0 GSM1658178,0,3 GSM1658183,0,44 GSM1657934,0,0 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,957 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,133 GSM1658188,0,7 GSM1658189,0,411 GSM1658196,0,44 GSM1657930,0,5 GSM1657931,0,0 GSM1657933,0,0 GSM1657935,0,0 GSM1657937,0,4 GSM1657939,0,19 GSM1657940,0,0 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,3 GSM1657943,0,0 GSM1657945,0,1 GSM1657946,0,3 GSM1657948,0,0 GSM1657949,0,0 GSM1657950,0,1 GSM1657951,0,0 GSM1657952,0,95 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,0 GSM1657955,0,0 GSM1657956,0,0 GSM1657957,0,1 GSM1657958,0,0 GSM1657959,0,0 GSM1657960,0,29 GSM1657961,0,0 GSM1657962,0,65 GSM1657963,0,305 GSM1657964,0,12 GSM1657966,0,0 GSM1657967,0,0 GSM1657968,0,0 GSM1657970,0,24 GSM1657971,0,7 GSM1657973,0,121 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,4 GSM1657977,0,0 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,0 GSM1657982,0,126 GSM1657983,0,0 GSM1657984,0,0 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,0 GSM1657987,0,0 GSM1657988,0,11 GSM1657989,0,0 GSM1657990,0,19 GSM1657991,0,0 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,4 GSM1658005,0,0 GSM1658009,0,0 GSM1658012,0,19 GSM1658014,0,7 GSM1658025,0,10 GSM1658032,0,12 GSM1658033,0,1 GSM1658034,0,0 GSM1658035,0,4 GSM1658037,0,0 GSM1658038,0,0 GSM1658039,0,0 GSM1658040,0,100 GSM1658041,0,0 GSM1658042,0,2 GSM1658046,0,0 GSM1658052,0,0 GSM1658058,0,63 GSM1658063,0,107 GSM1658080,0,3 GSM1658084,0,30 GSM1658087,0,112 GSM1658090,0,0 GSM1658091,0,242 GSM1658095,0,0 GSM1658101,0,0 GSM1658103,0,0 GSM1658104,0,0 GSM1658105,0,0 GSM1658106,0,2 GSM1658107,0,0 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,0 GSM1658111,0,139 GSM1658113,0,0 GSM1658114,0,0 GSM1658115,0,0 GSM1658127,0,2 GSM1658128,0,0 GSM1658129,0,0 GSM1658131,0,0 GSM1658134,0,1 GSM1658135,0,64 GSM1658136,0,0 GSM1658137,0,0 GSM1658138,0,3 GSM1658139,0,1 GSM1658141,0,0 GSM1658143,0,138 GSM1658145,0,2 GSM1658146,0,14 GSM1658147,0,27 GSM1658148,0,0 GSM1658149,0,0 GSM1658150,0,0 GSM1658151,0,0 GSM1658152,0,0 GSM1658153,0,0 GSM1658156,0,0 GSM1658158,0,30 GSM1658160,0,0 GSM1658163,0,0 GSM1658166,0,0 GSM1658169,0,0 GSM1658170,0,7 GSM1658171,0,0 GSM1658172,0,0 GSM1658175,0,0 GSM1658176,0,0 GSM1658177,0,15 GSM1658181,0,0 GSM1658182,0,0 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,0 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,2 GSM1657873,0,1 GSM1657876,0,1 GSM1657877,0,212 GSM1657881,0,325 GSM1657889,0,115 GSM1657890,0,133 GSM1657891,0,501 GSM1657892,0,86 GSM1657894,0,0 GSM1657898,0,0 GSM1657899,0,20 GSM1657900,0,835 GSM1657901,0,28 GSM1657902,0,47 GSM1657944,0,25 GSM1658018,0,35 GSM1658088,0,58 GSM1658093,0,1 GSM1658097,0,1 GSM1658130,0,83 GSM1658133,0,124 GSM1658140,0,346 GSM1658155,0,132 GSM1658157,0,17 GSM1658159,0,0 GSM1658162,0,10 GSM1658164,0,308 GSM1658167,0,63 GSM1658173,0,98 GSM1658179,0,607 GSM1658180,0,1 GSM1657893,0,11 GSM1657903,0,1704 GSM1658117,0,0 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,0 GSM1657912,0,0 GSM1657910,0,955 GSM1657918,0,3 GSM1657919,0,224 GSM1657923,0,22 GSM1657925,0,253 GSM1657926,0,288 GSM1657927,0,384 GSM1658116,0,62 GSM1658121,0,25 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,1281 GSM1658120,0,21 GSM1658123,0,515 GSM1658124,0,264 GSM1658125,0,1 GSM1657904,0,1 GSM1657906,0,4 GSM1657907,0,34 GSM1657908,0,21 GSM1657909,0,19 GSM1657911,0,0 GSM1657913,0,359 GSM1657914,0,0 GSM1657915,0,0 GSM1657916,0,26 GSM1657917,0,0 GSM1657920,0,43 GSM1657921,0,8 GSM1657922,0,0 GSM1657924,0,908 GSM1657928,0,5
Synonyms | HSN1C;LCB2;LCB2A;NSAN1C;SPT2;hLCB2a |
Description | serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2 |
---|---|
Chromosome | 14q24.3 |
Database Reference | MIM:605713 HGNC:11278 HPRD:05755 Vega:OTTHUMG00000171540 |
See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
Dataset | GSE67835 |
SPTLC2 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
---|---|---|---|
cortex astrocytes | 0 | 1 | 832 |
cortex endothelial | 0 | 0 | 71 |
cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 404 |
cortex fetal-replicating | 0 | 0 | 207 |
cortex hybrid | 0 | 2 | 851 |
cortex microglia | 0 | 25.5 | 957 |
cortex neurons | 0 | 0 | 305 |
cortex oligodendrocytes | 0 | 52.5 | 835 |
cortex OPC | 11 | 857.5 | 1,704 |
hippocampus endothelial | 0 | 0 | 0 |
hippocampus hybrid | 0 | 0 | 0 |
hippocampus microglia | 3 | 238.5 | 955 |
hippocampus neurons | 25 | 25 | 25 |
hippocampus oligodendrocytes | 0 | 142.5 | 1,281 |
hippocampus OPC | 0 | 6.5 | 908 |
Comparing SPTLC2 expression between groups | FDR |
---|---|
hippocampus microglia VS hippocampus neurons | NS |
hippocampus microglia VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
hippocampus neurons VS hippocampu | NS |
hippocampus neurons VS hippocampus oligodendro | NS |
hippocampus oligodendrocytes VS hippocampus OPC | NS |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]