gene,0,0 GSM1657885,0,0 GSM1657932,0,2 GSM1657938,0,142 GSM1657965,0,1915 GSM1657969,0,1559 GSM1657975,0,177 GSM1657979,0,253 GSM1657981,0,728 GSM1657992,0,0 GSM1657998,0,5 GSM1658000,0,0 GSM1658006,0,363 GSM1658007,0,18 GSM1658010,0,14 GSM1658016,0,102 GSM1658017,0,248 GSM1658020,0,75 GSM1658021,0,83 GSM1658026,0,1131 GSM1658027,0,12 GSM1658029,0,25 GSM1658031,0,167 GSM1658043,0,245 GSM1658045,0,132 GSM1658048,0,139 GSM1658049,0,6 GSM1658050,0,88 GSM1658051,0,13 GSM1658053,0,276 GSM1658054,0,2 GSM1658055,0,13 GSM1658056,0,50 GSM1658059,0,979 GSM1658060,0,313 GSM1658061,0,392 GSM1658062,0,16 GSM1658064,0,102 GSM1658065,0,151 GSM1658066,0,6 GSM1658067,0,10 GSM1658068,0,82 GSM1658069,0,272 GSM1658071,0,43 GSM1658072,0,13 GSM1658073,0,367 GSM1658078,0,449 GSM1658079,0,331 GSM1658081,0,38 GSM1658082,0,1238 GSM1658142,0,74 GSM1658168,0,5 GSM1658174,0,0 GSM1658184,0,11 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,1 GSM1658187,0,11 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,10 GSM1658199,0,15 GSM1658201,0,0 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,240 GSM1657993,0,23 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,0 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,143 GSM1658086,0,2 GSM1658089,0,0 GSM1658092,0,0 GSM1658094,0,154 GSM1658096,0,41 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,170 GSM1658100,0,57 GSM1658102,0,298 GSM1658109,0,46 GSM1658112,0,189 GSM1658003,0,1 GSM1658221,0,145 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,115 GSM1658226,0,3 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,1 GSM1658230,0,38 GSM1658231,0,51 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,8 GSM1658234,0,0 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,53 GSM1658238,0,59 GSM1658239,0,230 GSM1658240,0,0 GSM1658241,0,244 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,0 GSM1658245,0,41 GSM1658246,0,11 GSM1658247,0,68 GSM1658248,0,9 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,390 GSM1658255,0,8 GSM1658257,0,121 GSM1658259,0,30 GSM1658262,0,63 GSM1658264,0,66 GSM1658266,0,25 GSM1658268,0,93 GSM1658270,0,8 GSM1658272,0,89 GSM1658275,0,420 GSM1658277,0,40 GSM1658279,0,104 GSM1658281,0,171 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,1043 GSM1658288,0,3 GSM1658290,0,42 GSM1658292,0,133 GSM1658294,0,4 GSM1658297,0,0 GSM1658299,0,225 GSM1658301,0,0 GSM1658305,0,1415 GSM1658306,0,0 GSM1658307,0,465 GSM1658308,0,4 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,53 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,111 GSM1658313,0,4 GSM1658314,0,442 GSM1658315,0,1 GSM1658316,0,15 GSM1658317,0,6 GSM1658318,0,326 GSM1658319,0,905 GSM1658320,0,42 GSM1658321,0,43 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,707 GSM1658324,0,26 GSM1658325,0,87 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,590 GSM1658328,0,123 GSM1658329,0,59 GSM1658330,0,78 GSM1658331,0,111 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,228 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,41 GSM1658336,0,57 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,3 GSM1658339,0,18 GSM1658340,0,75 GSM1658341,0,284 GSM1658342,0,0 GSM1658343,0,47 GSM1658344,0,274 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,124 GSM1658348,0,39 GSM1658349,0,351 GSM1658350,0,0 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,80 GSM1658353,0,10 GSM1658354,0,58 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,90 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,33 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,33 GSM1658363,0,166 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,137 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,47 GSM1658204,0,1 GSM1658205,0,0 GSM1658206,0,278 GSM1658207,0,206 GSM1658208,0,411 GSM1658209,0,8 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,618 GSM1658212,0,7 GSM1658213,0,803 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,480 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,0 GSM1658219,0,4 GSM1658220,0,95 GSM1658222,0,0 GSM1658224,0,64 GSM1658228,0,704 GSM1658242,0,30 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,2 GSM1658355,0,394 GSM1657872,0,259 GSM1657874,0,52 GSM1657875,0,93 GSM1657878,0,322 GSM1657879,0,6 GSM1657880,0,113 GSM1657882,0,0 GSM1657883,0,17 GSM1657884,0,0 GSM1657886,0,51 GSM1657887,0,504 GSM1657888,0,235 GSM1657895,0,691 GSM1657896,0,33 GSM1657897,0,726 GSM1657929,0,66 GSM1657936,0,47 GSM1657947,0,5 GSM1658008,0,524 GSM1658011,0,315 GSM1658013,0,0 GSM1658015,0,121 GSM1658019,0,467 GSM1658022,0,109 GSM1658023,0,16 GSM1658024,0,254 GSM1658028,0,376 GSM1658030,0,1045 GSM1658036,0,3 GSM1658044,0,0 GSM1658047,0,726 GSM1658057,0,394 GSM1658070,0,632 GSM1658074,0,376 GSM1658075,0,445 GSM1658076,0,121 GSM1658077,0,13 GSM1658132,0,13 GSM1658144,0,25 GSM1658154,0,15 GSM1658161,0,48 GSM1658165,0,285 GSM1658178,0,5 GSM1658183,0,299 GSM1657934,0,10 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,144 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,1 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,0 GSM1657930,0,68 GSM1657931,0,155 GSM1657933,0,0 GSM1657935,0,81 GSM1657937,0,39 GSM1657939,0,0 GSM1657940,0,55 GSM1657941,0,0 GSM1657942,0,0 GSM1657943,0,75 GSM1657945,0,57 GSM1657946,0,277 GSM1657948,0,22 GSM1657949,0,12 GSM1657950,0,11 GSM1657951,0,124 GSM1657952,0,1 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,0 GSM1657955,0,0 GSM1657956,0,28 GSM1657957,0,16 GSM1657958,0,77 GSM1657959,0,126 GSM1657960,0,62 GSM1657961,0,49 GSM1657962,0,37 GSM1657963,0,286 GSM1657964,0,0 GSM1657966,0,1 GSM1657967,0,42 GSM1657968,0,0 GSM1657970,0,41 GSM1657971,0,115 GSM1657973,0,0 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,4 GSM1657977,0,657 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,86 GSM1657982,0,360 GSM1657983,0,1 GSM1657984,0,30 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,40 GSM1657987,0,64 GSM1657988,0,17 GSM1657989,0,42 GSM1657990,0,67 GSM1657991,0,3 GSM1658001,0,0 GSM1658002,0,0 GSM1658005,0,218 GSM1658009,0,7 GSM1658012,0,46 GSM1658014,0,585 GSM1658025,0,152 GSM1658032,0,11 GSM1658033,0,53 GSM1658034,0,181 GSM1658035,0,1 GSM1658037,0,4 GSM1658038,0,1 GSM1658039,0,7 GSM1658040,0,115 GSM1658041,0,690 GSM1658042,0,3 GSM1658046,0,1 GSM1658052,0,37 GSM1658058,0,7 GSM1658063,0,93 GSM1658080,0,10 GSM1658084,0,25 GSM1658087,0,1 GSM1658090,0,373 GSM1658091,0,24 GSM1658095,0,0 GSM1658101,0,0 GSM1658103,0,20 GSM1658104,0,35 GSM1658105,0,37 GSM1658106,0,0 GSM1658107,0,6 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,22 GSM1658111,0,95 GSM1658113,0,0 GSM1658114,0,6 GSM1658115,0,168 GSM1658127,0,63 GSM1658128,0,19 GSM1658129,0,4 GSM1658131,0,460 GSM1658134,0,125 GSM1658135,0,43 GSM1658136,0,0 GSM1658137,0,194 GSM1658138,0,42 GSM1658139,0,0 GSM1658141,0,218 GSM1658143,0,37 GSM1658145,0,30 GSM1658146,0,8 GSM1658147,0,30 GSM1658148,0,3 GSM1658149,0,472 GSM1658150,0,163 GSM1658151,0,5 GSM1658152,0,0 GSM1658153,0,0 GSM1658156,0,89 GSM1658158,0,10 GSM1658160,0,316 GSM1658163,0,124 GSM1658166,0,224 GSM1658169,0,23 GSM1658170,0,35 GSM1658171,0,33 GSM1658172,0,417 GSM1658175,0,4 GSM1658176,0,0 GSM1658177,0,2 GSM1658181,0,51 GSM1658182,0,0 GSM1658192,0,22 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,0 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,1 GSM1658200,0,2 GSM1657871,0,964 GSM1657873,0,0 GSM1657876,0,59 GSM1657877,0,133 GSM1657881,0,0 GSM1657889,0,600 GSM1657890,0,10 GSM1657891,0,264 GSM1657892,0,372 GSM1657894,0,532 GSM1657898,0,1 GSM1657899,0,512 GSM1657900,0,19 GSM1657901,0,499 GSM1657902,0,12 GSM1657944,0,8 GSM1658018,0,20 GSM1658088,0,494 GSM1658093,0,4 GSM1658097,0,19 GSM1658130,0,72 GSM1658133,0,77 GSM1658140,0,362 GSM1658155,0,41 GSM1658157,0,20 GSM1658159,0,617 GSM1658162,0,1 GSM1658164,0,764 GSM1658167,0,45 GSM1658173,0,245 GSM1658179,0,126 GSM1658180,0,93 GSM1657893,0,44 GSM1657903,0,1 GSM1658117,0,16 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,183 GSM1657912,0,337 GSM1657910,0,41 GSM1657918,0,0 GSM1657919,0,872 GSM1657923,0,0 GSM1657925,0,34 GSM1657926,0,7 GSM1657927,0,0 GSM1658116,0,32 GSM1658121,0,57 GSM1658118,0,0 GSM1658119,0,18 GSM1658120,0,0 GSM1658123,0,66 GSM1658124,0,176 GSM1658125,0,27 GSM1657904,0,170 GSM1657906,0,92 GSM1657907,0,120 GSM1657908,0,39 GSM1657909,0,1435 GSM1657911,0,0 GSM1657913,0,207 GSM1657914,0,78 GSM1657915,0,11 GSM1657916,0,1 GSM1657917,0,10 GSM1657920,0,0 GSM1657921,0,0 GSM1657922,0,59 GSM1657924,0,2 GSM1657928,0,887
Synonyms | RO60;RORNP;SSA2 |
Description | TROVE domain family member 2 |
---|---|
Chromosome | 1q31 |
Database Reference | MIM:600063 HGNC:11313 HPRD:15964 Vega:OTTHUMG00000035675 |
See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
Dataset | GSE67835 |
TROVE2 expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
---|---|---|---|
cortex astrocytes | 0 | 46.5 | 1,915 |
cortex endothelial | 0 | 41 | 298 |
cortex fetal-quiescent | 0 | 35.5 | 1,415 |
cortex fetal-replicating | 0 | 8 | 803 |
cortex hybrid | 0 | 111 | 1,045 |
cortex microglia | 0 | 0 | 144 |
cortex neurons | 0 | 22.5 | 690 |
cortex oligodendrocytes | 0 | 74.5 | 964 |
cortex OPC | 1 | 22.5 | 44 |
hippocampus endothelial | 0 | 0 | 16 |
hippocampus hybrid | 183 | 260 | 337 |
hippocampus microglia | 0 | 19.5 | 872 |
hippocampus neurons | 57 | 57 | 57 |
hippocampus oligodendrocytes | 0 | 22.5 | 176 |
hippocampus OPC | 0 | 49 | 1,435 |
Comparing TROVE2 expression between groups | FDR |
---|---|
hippocampus microglia VS hippocampus neurons | NS |
hippocampus microglia VS hippocampus oligodendrocytes | NS |
hippocampus neurons VS hippocampu | NS |
hippocampus neurons VS hippocampus oligodendro | NS |
hippocampus oligodendrocytes VS hippocampus OPC | NS |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]