gene,0,0 GSM1657885,0,23 GSM1657932,0,788 GSM1657938,0,0 GSM1657965,0,0 GSM1657969,0,12 GSM1657975,0,548 GSM1657979,0,1 GSM1657981,0,6 GSM1657992,0,0 GSM1657998,0,68 GSM1658000,0,0 GSM1658006,0,305 GSM1658007,0,80 GSM1658010,0,197 GSM1658016,0,527 GSM1658017,0,3 GSM1658020,0,253 GSM1658021,0,0 GSM1658026,0,1 GSM1658027,0,25 GSM1658029,0,183 GSM1658031,0,8 GSM1658043,0,67 GSM1658045,0,17 GSM1658048,0,353 GSM1658049,0,4 GSM1658050,0,128 GSM1658051,0,69 GSM1658053,0,1 GSM1658054,0,277 GSM1658055,0,12 GSM1658056,0,1 GSM1658059,0,344 GSM1658060,0,163 GSM1658061,0,6 GSM1658062,0,8 GSM1658064,0,219 GSM1658065,0,13 GSM1658066,0,2 GSM1658067,0,4 GSM1658068,0,4 GSM1658069,0,8 GSM1658071,0,20 GSM1658072,0,15 GSM1658073,0,212 GSM1658078,0,287 GSM1658079,0,64 GSM1658081,0,259 GSM1658082,0,382 GSM1658142,0,349 GSM1658168,0,368 GSM1658174,0,95 GSM1658184,0,0 GSM1658185,0,0 GSM1658186,0,0 GSM1658187,0,42 GSM1658190,0,0 GSM1658191,0,0 GSM1658193,0,0 GSM1658199,0,0 GSM1658201,0,10 GSM1658202,0,0 GSM1657972,0,0 GSM1657993,0,0 GSM1657995,0,0 GSM1658004,0,0 GSM1658083,0,0 GSM1658085,0,1005 GSM1658086,0,0 GSM1658089,0,0 GSM1658092,0,0 GSM1658094,0,3 GSM1658096,0,0 GSM1658098,0,0 GSM1658099,0,0 GSM1658100,0,61 GSM1658102,0,0 GSM1658109,0,290 GSM1658112,0,147 GSM1658003,0,0 GSM1658221,0,0 GSM1658223,0,0 GSM1658225,0,0 GSM1658226,0,0 GSM1658227,0,0 GSM1658229,0,0 GSM1658230,0,66 GSM1658231,0,0 GSM1658232,0,0 GSM1658233,0,0 GSM1658234,0,0 GSM1658235,0,0 GSM1658236,0,0 GSM1658237,0,0 GSM1658238,0,0 GSM1658239,0,9 GSM1658240,0,1 GSM1658241,0,0 GSM1658243,0,0 GSM1658244,0,0 GSM1658245,0,0 GSM1658246,0,0 GSM1658247,0,0 GSM1658248,0,0 GSM1658249,0,0 GSM1658251,0,0 GSM1658253,0,0 GSM1658255,0,0 GSM1658257,0,0 GSM1658259,0,56 GSM1658262,0,0 GSM1658264,0,892 GSM1658266,0,0 GSM1658268,0,0 GSM1658270,0,0 GSM1658272,0,0 GSM1658275,0,0 GSM1658277,0,65 GSM1658279,0,0 GSM1658281,0,0 GSM1658284,0,0 GSM1658286,0,0 GSM1658288,0,92 GSM1658290,0,0 GSM1658292,0,0 GSM1658294,0,0 GSM1658297,0,16 GSM1658299,0,0 GSM1658301,0,2 GSM1658305,0,0 GSM1658306,0,269 GSM1658307,0,0 GSM1658308,0,0 GSM1658309,0,0 GSM1658310,0,0 GSM1658311,0,0 GSM1658312,0,0 GSM1658313,0,81 GSM1658314,0,0 GSM1658315,0,0 GSM1658316,0,0 GSM1658317,0,0 GSM1658318,0,213 GSM1658319,0,0 GSM1658320,0,0 GSM1658321,0,0 GSM1658322,0,0 GSM1658323,0,66 GSM1658324,0,0 GSM1658325,0,0 GSM1658326,0,0 GSM1658327,0,0 GSM1658328,0,51 GSM1658329,0,470 GSM1658330,0,0 GSM1658331,0,84 GSM1658332,0,0 GSM1658333,0,0 GSM1658334,0,0 GSM1658335,0,0 GSM1658336,0,0 GSM1658337,0,0 GSM1658338,0,0 GSM1658339,0,0 GSM1658340,0,280 GSM1658341,0,0 GSM1658342,0,0 GSM1658343,0,0 GSM1658344,0,0 GSM1658345,0,0 GSM1658346,0,11 GSM1658348,0,0 GSM1658349,0,0 GSM1658350,0,0 GSM1658351,0,0 GSM1658352,0,0 GSM1658353,0,0 GSM1658354,0,0 GSM1658356,0,0 GSM1658357,0,1 GSM1658358,0,0 GSM1658359,0,0 GSM1658360,0,15 GSM1658361,0,0 GSM1658362,0,0 GSM1658363,0,0 GSM1658364,0,0 GSM1658365,0,0 GSM1658366,0,0 GSM1658203,0,56 GSM1658204,0,0 GSM1658205,0,2 GSM1658206,0,0 GSM1658207,0,0 GSM1658208,0,0 GSM1658209,0,3 GSM1658210,0,0 GSM1658211,0,1 GSM1658212,0,1 GSM1658213,0,0 GSM1658214,0,0 GSM1658215,0,0 GSM1658216,0,0 GSM1658217,0,0 GSM1658218,0,38 GSM1658219,0,0 GSM1658220,0,0 GSM1658222,0,187 GSM1658224,0,0 GSM1658228,0,0 GSM1658242,0,0 GSM1658304,0,0 GSM1658347,0,143 GSM1658355,0,2 GSM1657872,0,946 GSM1657874,0,234 GSM1657875,0,65 GSM1657878,0,25 GSM1657879,0,207 GSM1657880,0,2444 GSM1657882,0,63 GSM1657883,0,52 GSM1657884,0,64 GSM1657886,0,36 GSM1657887,0,601 GSM1657888,0,4 GSM1657895,0,127 GSM1657896,0,101 GSM1657897,0,595 GSM1657929,0,380 GSM1657936,0,24 GSM1657947,0,0 GSM1658008,0,50 GSM1658011,0,15 GSM1658013,0,185 GSM1658015,0,167 GSM1658019,0,563 GSM1658022,0,159 GSM1658023,0,5 GSM1658024,0,27 GSM1658028,0,99 GSM1658030,0,0 GSM1658036,0,1 GSM1658044,0,4 GSM1658047,0,351 GSM1658057,0,222 GSM1658070,0,695 GSM1658074,0,436 GSM1658075,0,244 GSM1658076,0,22 GSM1658077,0,14 GSM1658132,0,180 GSM1658144,0,1 GSM1658154,0,1333 GSM1658161,0,239 GSM1658165,0,478 GSM1658178,0,136 GSM1658183,0,431 GSM1657934,0,2 GSM1657994,0,0 GSM1657996,0,0 GSM1657997,0,0 GSM1657999,0,0 GSM1658188,0,0 GSM1658189,0,0 GSM1658196,0,0 GSM1657930,0,177 GSM1657931,0,4 GSM1657933,0,1 GSM1657935,0,457 GSM1657937,0,19 GSM1657939,0,1 GSM1657940,0,69 GSM1657941,0,20 GSM1657942,0,1 GSM1657943,0,52 GSM1657945,0,47 GSM1657946,0,0 GSM1657948,0,0 GSM1657949,0,29 GSM1657950,0,23 GSM1657951,0,0 GSM1657952,0,24 GSM1657953,0,0 GSM1657954,0,5 GSM1657955,0,0 GSM1657956,0,135 GSM1657957,0,0 GSM1657958,0,80 GSM1657959,0,30 GSM1657960,0,0 GSM1657961,0,0 GSM1657962,0,0 GSM1657963,0,369 GSM1657964,0,70 GSM1657966,0,46 GSM1657967,0,289 GSM1657968,0,20 GSM1657970,0,0 GSM1657971,0,16 GSM1657973,0,65 GSM1657974,0,0 GSM1657976,0,23 GSM1657977,0,0 GSM1657978,0,0 GSM1657980,0,1585 GSM1657982,0,243 GSM1657983,0,21 GSM1657984,0,15 GSM1657985,0,0 GSM1657986,0,288 GSM1657987,0,10 GSM1657988,0,2 GSM1657989,0,7 GSM1657990,0,221 GSM1657991,0,69 GSM1658001,0,45 GSM1658002,0,1 GSM1658005,0,222 GSM1658009,0,124 GSM1658012,0,175 GSM1658014,0,994 GSM1658025,0,60 GSM1658032,0,0 GSM1658033,0,662 GSM1658034,0,325 GSM1658035,0,1 GSM1658037,0,0 GSM1658038,0,2 GSM1658039,0,1 GSM1658040,0,16 GSM1658041,0,1 GSM1658042,0,3 GSM1658046,0,0 GSM1658052,0,223 GSM1658058,0,239 GSM1658063,0,148 GSM1658080,0,3 GSM1658084,0,0 GSM1658087,0,0 GSM1658090,0,0 GSM1658091,0,457 GSM1658095,0,0 GSM1658101,0,0 GSM1658103,0,81 GSM1658104,0,166 GSM1658105,0,5 GSM1658106,0,294 GSM1658107,0,21 GSM1658108,0,0 GSM1658110,0,0 GSM1658111,0,74 GSM1658113,0,0 GSM1658114,0,508 GSM1658115,0,0 GSM1658127,0,201 GSM1658128,0,0 GSM1658129,0,280 GSM1658131,0,10 GSM1658134,0,88 GSM1658135,0,54 GSM1658136,0,7 GSM1658137,0,3 GSM1658138,0,20 GSM1658139,0,25 GSM1658141,0,309 GSM1658143,0,8 GSM1658145,0,60 GSM1658146,0,87 GSM1658147,0,79 GSM1658148,0,28 GSM1658149,0,0 GSM1658150,0,36 GSM1658151,0,33 GSM1658152,0,4 GSM1658153,0,2 GSM1658156,0,268 GSM1658158,0,245 GSM1658160,0,335 GSM1658163,0,167 GSM1658166,0,0 GSM1658169,0,105 GSM1658170,0,2 GSM1658171,0,101 GSM1658172,0,27 GSM1658175,0,368 GSM1658176,0,0 GSM1658177,0,29 GSM1658181,0,221 GSM1658182,0,123 GSM1658192,0,0 GSM1658194,0,0 GSM1658195,0,0 GSM1658197,0,0 GSM1658198,0,0 GSM1658200,0,0 GSM1657871,0,1588 GSM1657873,0,0 GSM1657876,0,292 GSM1657877,0,1204 GSM1657881,0,843 GSM1657889,0,648 GSM1657890,0,1484 GSM1657891,0,1342 GSM1657892,0,1151 GSM1657894,0,574 GSM1657898,0,1 GSM1657899,0,1411 GSM1657900,0,900 GSM1657901,0,792 GSM1657902,0,289 GSM1657944,0,115 GSM1658018,0,2627 GSM1658088,0,857 GSM1658093,0,840 GSM1658097,0,913 GSM1658130,0,1271 GSM1658133,0,1112 GSM1658140,0,1688 GSM1658155,0,233 GSM1658157,0,744 GSM1658159,0,2735 GSM1658162,0,728 GSM1658164,0,1233 GSM1658167,0,1456 GSM1658173,0,1403 GSM1658179,0,838 GSM1658180,0,523 GSM1657893,0,72 GSM1657903,0,3 GSM1658117,0,2 GSM1658122,0,0 GSM1658126,0,0 GSM1657905,0,1165 GSM1657912,0,15 GSM1657910,0,0 GSM1657918,0,25 GSM1657919,0,0 GSM1657923,0,573 GSM1657925,0,54 GSM1657926,0,0 GSM1657927,0,0 GSM1658116,0,0 GSM1658121,0,0 GSM1658118,0,463 GSM1658119,0,1788 GSM1658120,0,297 GSM1658123,0,324 GSM1658124,0,278 GSM1658125,0,780 GSM1657904,0,42 GSM1657906,0,300 GSM1657907,0,54 GSM1657908,0,55 GSM1657909,0,0 GSM1657911,0,1 GSM1657913,0,216 GSM1657914,0,6 GSM1657915,0,10 GSM1657916,0,69 GSM1657917,0,275 GSM1657920,0,0 GSM1657921,0,66 GSM1657922,0,463 GSM1657924,0,4 GSM1657928,0,293
| Synonyms | NCRNA00043;SOX2OT |
| Description | SOX2 overlapping transcript |
|---|---|
| Chromosome | 3q26.33 |
| Database Reference | MIM:616338 HGNC:20209 |
| See related | THE HUMAN PROTEIN ATLAS |
| Dataset | GSE67835 |
| SOX2-OT expression in each cell group | Minimum Value (Read count) | Median Value (Read count) | Maximum Value (Read count) |
|---|---|---|---|
| cortex astrocytes | 0 | 14 | 788 |
| cortex endothelial | 0 | 0 | 1,005 |
| cortex fetal-quiescent | 0 | 0 | 892 |
| cortex fetal-replicating | 0 | 0 | 187 |
| cortex hybrid | 0 | 131.5 | 2,444 |
| cortex microglia | 0 | 0 | 2 |
| cortex neurons | 0 | 20 | 1,585 |
| cortex oligodendrocytes | 0 | 878.5 | 2,735 |
| cortex OPC | 3 | 37.5 | 72 |
| hippocampus endothelial | 0 | 0 | 2 |
| hippocampus hybrid | 15 | 590 | 1,165 |
| hippocampus microglia | 0 | 0 | 573 |
| hippocampus neurons | 0 | 0 | 0 |
| hippocampus oligodendrocytes | 278 | 393.5 | 1,788 |
| hippocampus OPC | 0 | 54.5 | 463 |
Top correlated genes were calculated by using Spearman rank correlation. Enrichment analysis can be performed on DAVID server using its API, while alternative links are also provided.
KEGG GO Others cortex astrocytes[62]
cortex endothelial[17]
cortex fetal-quiescent[110]
cortex fetal-replicating[25]
cortex hybrid[44]
cortex microglia[8]
cortex neurons[130]
cortex oligodendrocytes[32]
cortex OPC[2]
hippocampus endothelial[3]
hippocampus hybrid[2]
hippocampus microglia[8]
hippocampus neurons[1]
hippocampus oligodendrocytes[6]
hippocampus OPC[16]
