DegronMD: protein-targeted degradation, mutation and drug response to degrons
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BSML
CPH
CGC
Degron:
TTPSENGDVPSP
Uniprot ID:
Q9HCM3
Source protein:
UPF0606 protein KIAA1549
Source gene:
KIAA1549
Class:
DEG_COP1_1
Location:
1385:1396
E3 ligase:
COP1
DEGRON score:
0.8187
ASA_SCORE:
82.35
COIL:
0.9278
CONS_SCORE:
0.4554
DSS_SCORE:
0.7672
HELIX:
0.0358
FCONS_SCORE:
0.9512
RIG_SCORE:
0.5674
Degron related mutations and impact score
Mutation
Sample
Cancer
Dataset
Degron
Degron class
Impact score
p.R1406H
TCGA-A5-A0G2
UCEC
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.R1406H
TCGA-EY-A5W2
UCEC
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.R1406H
DO52450
COCA
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.R1406H
DO48177
UCEC
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.R1406H
DO41235
UCEC
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.K1399N
TCGA-DG-A2KL
CESC
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.3611
p.K1399N
DO51596
CESC
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.3611
p.P1401L
TCGA-EE-A183
SKCM
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.1944
p.P1401L
DO37715
SKCM
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.1944
p.P1376T
TCGA-GL-A59R
KIRP
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0833
p.P1376T
DO44525
KIRP
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0833
p.R1406C
TCGA-HU-A4H5
STAD
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.R1406C
DO47727
STAD
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.P1401A
TCGA-IN-AB1V
STAD
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.1944
p.P1401A
DO222333
STAD
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.1944
p.R1406G
TCGA-US-A77E
PAAD
TCGA
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.R1406G
DO49416
PAAD
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.R1406G
DO34496
PACA
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0556
p.T1386M
DO222765
COCA
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.7423
p.P1401H
DO228971
LICA
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.1944
p.S1402Y
DO229035
LICA
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.1667
p.G1379V
DO51489
PACA
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.1667
p.I1400S
DO229502
SKCA
ICGC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.2222
p.V1393M
SIDM00789
Colorectal Carcinoma
GDSC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.7208
p.V1393M
ACH-000997
Colon/Colorectal Cancer
CCLE
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.7208
p.D1392E
SIDM00832
Colorectal Carcinoma
GDSC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.5647
p.D1392E
ACH-000680
Colon/Colorectal Cancer
CCLE
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.5647
p.D1392E
SW948
large_intestine
COSMIC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.5647
p.S1395N
SIDM00138
Non-Small Cell Lung Carcinoma
GDSC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.818
p.V1405I
SIDM01594
Breast Carcinoma
GDSC
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0833
p.V1405I
ACH-000083
Non-Cancerous
CCLE
TTPSENGDVPSP
DEG_COP1_1
0.0833
Drug responses associated with KIAA1549 mutations
Sample
Cancer
Mutation (In Degron?)
Dataset
Drug
IC50
All proteins holding degron of TTPSENGDVPSP
Uniprot ID
Source protein
Degron class
Location
Hit
E3 ligase
Degron score
Detail
Q9HCM3
UPF0606 protein KIAA1549
DEG_COP1_1
1385:1396
TTPSENGDVPSP
COP1
0.8187
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