rs11863931

Homo sapiens
A>G
None
Check p-value
SNV (Single Nucleotide Variation)
G=0088 (2641/29970,GnomAD)
G=0130 (3785/29118,TOPMED)
G=0102 (509/5008,1000G)
G=0015 (57/3854,ALSPAC)
G=0018 (68/3708,TWINSUK)
chr16:66344849 (GRCh38.p7) (16q21)
AD
GWASdb2
1   publication(s)
See rs on genome

Genomic Coordinates

Sequence Name Change(s)
GRCh38.p7 chr 16NC_000016.10:g.66344849A>G
GRCh37.p13 chr 16NC_000016.9:g.66378752A>G

Population Frequency

Study Population Group Sample # Ref Allele Alt Allele
1000GenomesAfricanSub1322A=0.682G=0.318
1000GenomesAmericanSub694A=0.960G=0.040
1000GenomesEast AsianSub1008A=1.000G=0.000
1000GenomesEuropeSub1006A=0.977G=0.023
1000GenomesGlobalStudy-wide5008A=0.898G=0.102
1000GenomesSouth AsianSub978A=0.970G=0.030
The Avon Longitudinal Study of Parents and ChildrenPARENT AND CHILD COHORTStudy-wide3854A=0.985G=0.015
The Genome Aggregation DatabaseAfricanSub8708A=0.734G=0.266
The Genome Aggregation DatabaseAmericanSub838A=0.960G=0.040
The Genome Aggregation DatabaseEast AsianSub1622A=1.000G=0.000
The Genome Aggregation DatabaseEuropeSub18500A=0.984G=0.015
The Genome Aggregation DatabaseGlobalStudy-wide29970A=0.911G=0.088
The Genome Aggregation DatabaseOtherSub302A=0.970G=0.030
Trans-Omics for Precision MedicineGlobalStudy-wide29118A=0.870G=0.130
UK 10K study - TwinsTWIN COHORTStudy-wide3708A=0.982G=0.018
PMID Title Author Journal
21314694Genomewide association analysis of symptoms of alcohol dependence in the molecular genetics of schizophrenia (MGS2) control sample.Kendler KSAlcohol Clin Exp Res

P-Value

SNP ID p-value Traits Study
rs118639310.000464alcohol dependence21314694

eQTL of rs11863931 in Brain tissues (GTEx Analysis Release V7)

Position (v37) eGene GeneID Variant p-value TSS Tissue
There is no eQTL annotation for this SNP

meQTL of rs11863931 in Fetal Brain

Probe ID Position Gene beta p-value
There is no meQTL annotation for this SNP

Genomic View

Chromatin Interaction

There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.

Enhancer Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance ( -/+ : Up/Downstream )
chr166635915366359352E067-19400
chr166635938966359429E067-19323
chr166635945166359608E067-19144
chr166635964366359848E067-18904
chr166635990466359958E067-18794
chr166636020566360255E067-18497
chr166636028466360376E067-18376
chr166636046366360585E067-18167
chr166636064666361402E067-17350
chr166636143866361521E067-17231
chr166636153066361580E067-17172
chr166636174166361948E067-16804
chr166636196366362019E067-16733
chr166636203766362087E067-16665
chr166636208866362168E067-16584
chr166636232166362417E067-16335
chr166636660766366941E067-11811
chr166636695866367605E067-11147
chr166636765766367782E067-10970
chr166636808166368147E067-10605
chr166636890066369017E067-9735
chr166636909366369425E067-9327
chr166636944466370207E067-8545
chr166633788266337934E068-40818
chr166633805666338691E068-40061
chr166635915366359352E068-19400
chr166635938966359429E068-19323
chr166635945166359608E068-19144
chr166635964366359848E068-18904
chr166635990466359958E068-18794
chr166636020566360255E068-18497
chr166636028466360376E068-18376
chr166636046366360585E068-18167
chr166636064666361402E068-17350
chr166636143866361521E068-17231
chr166636153066361580E068-17172
chr166636174166361948E068-16804
chr166636196366362019E068-16733
chr166636203766362087E068-16665
chr166636208866362168E068-16584
chr166636232166362417E068-16335
chr166636660766366941E068-11811
chr166636695866367605E068-11147
chr166636765766367782E068-10970
chr166636890066369017E068-9735
chr166636909366369425E068-9327
chr166636944466370207E068-8545
chr166637026766370632E068-8120
chr166639332666393402E06814574
chr166639340366394204E06814651
chr166640326866403406E06824516
chr166635915366359352E069-19400
chr166635938966359429E069-19323
chr166635945166359608E069-19144
chr166635964366359848E069-18904
chr166635990466359958E069-18794
chr166636020566360255E069-18497
chr166636028466360376E069-18376
chr166636046366360585E069-18167
chr166636064666361402E069-17350
chr166636143866361521E069-17231
chr166636153066361580E069-17172
chr166636174166361948E069-16804
chr166636196366362019E069-16733
chr166636203766362087E069-16665
chr166636208866362168E069-16584
chr166636232166362417E069-16335
chr166636660766366941E069-11811
chr166636695866367605E069-11147
chr166636765766367782E069-10970
chr166636808166368147E069-10605
chr166636890066369017E069-9735
chr166636909366369425E069-9327
chr166636944466370207E069-8545
chr166635421666354261E070-24491
chr166635440166354441E070-24311
chr166635459966354653E070-24099
chr166635855666359114E070-19638
chr166635915366359352E070-19400
chr166635938966359429E070-19323
chr166635945166359608E070-19144
chr166635964366359848E070-18904
chr166635990466359958E070-18794
chr166636020566360255E070-18497
chr166636028466360376E070-18376
chr166636046366360585E070-18167
chr166636064666361402E070-17350
chr166636143866361521E070-17231
chr166636153066361580E070-17172
chr166636174166361948E070-16804
chr166636196366362019E070-16733
chr166636203766362087E070-16665
chr166636208866362168E070-16584
chr166636232166362417E070-16335
chr166636660766366941E070-11811
chr166636695866367605E070-11147
chr166636765766367782E070-10970
chr166636808166368147E070-10605
chr166636909366369425E070-9327
chr166636944466370207E070-8545
chr166637026766370632E070-8120
chr166633805666338691E071-40061
chr166635855666359114E071-19638
chr166635915366359352E071-19400
chr166635938966359429E071-19323
chr166635945166359608E071-19144
chr166635964366359848E071-18904
chr166635990466359958E071-18794
chr166636020566360255E071-18497
chr166636028466360376E071-18376
chr166636046366360585E071-18167
chr166636064666361402E071-17350
chr166636143866361521E071-17231
chr166636153066361580E071-17172
chr166636174166361948E071-16804
chr166636196366362019E071-16733
chr166636203766362087E071-16665
chr166636208866362168E071-16584
chr166636232166362417E071-16335
chr166636260966362659E071-16093
chr166636649966366549E071-12203
chr166636660766366941E071-11811
chr166636695866367605E071-11147
chr166636765766367782E071-10970
chr166636808166368147E071-10605
chr166636890066369017E071-9735
chr166636909366369425E071-9327
chr166636944466370207E071-8545
chr166637775666377876E071-876
chr166637803766378182E071-570
chr166637819866378976E0710
chr166639628266396380E07117530
chr166639728866399409E07118536
chr166639943766399998E07120685
chr166640010066400257E07121348
chr166635855666359114E072-19638
chr166635915366359352E072-19400
chr166635938966359429E072-19323
chr166635945166359608E072-19144
chr166635964366359848E072-18904
chr166635990466359958E072-18794
chr166636020566360255E072-18497
chr166636028466360376E072-18376
chr166636046366360585E072-18167
chr166636064666361402E072-17350
chr166636143866361521E072-17231
chr166636153066361580E072-17172
chr166636174166361948E072-16804
chr166636196366362019E072-16733
chr166636203766362087E072-16665
chr166636208866362168E072-16584
chr166636232166362417E072-16335
chr166636260966362659E072-16093
chr166636660766366941E072-11811
chr166636695866367605E072-11147
chr166636765766367782E072-10970
chr166636808166368147E072-10605
chr166637026766370632E072-8120
chr166637618666376236E072-2516
chr166637632066376556E072-2196
chr166637819866378976E0720
chr166635855666359114E073-19638
chr166635915366359352E073-19400
chr166635938966359429E073-19323
chr166635945166359608E073-19144
chr166635964366359848E073-18904
chr166635990466359958E073-18794
chr166636064666361402E073-17350
chr166636143866361521E073-17231
chr166636153066361580E073-17172
chr166636174166361948E073-16804
chr166636196366362019E073-16733
chr166636203766362087E073-16665
chr166636208866362168E073-16584
chr166636232166362417E073-16335
chr166636909366369425E073-9327
chr166636944466370207E073-8545
chr166639728866399409E07318536
chr166639943766399998E07320685
chr166640291766403264E07324165
chr166641738166417658E07338629
chr166634893366349622E074-29130
chr166634975366349807E074-28945
chr166635855666359114E074-19638
chr166635915366359352E074-19400
chr166635938966359429E074-19323
chr166635945166359608E074-19144
chr166635964366359848E074-18904
chr166635990466359958E074-18794
chr166636020566360255E074-18497
chr166636028466360376E074-18376
chr166636046366360585E074-18167
chr166636064666361402E074-17350
chr166636143866361521E074-17231
chr166636153066361580E074-17172
chr166636174166361948E074-16804
chr166636196366362019E074-16733
chr166636203766362087E074-16665
chr166636208866362168E074-16584
chr166636232166362417E074-16335
chr166636649966366549E074-12203
chr166636660766366941E074-11811
chr166636695866367605E074-11147
chr166636765766367782E074-10970
chr166636808166368147E074-10605
chr166636890066369017E074-9735
chr166636909366369425E074-9327
chr166636944466370207E074-8545
chr166637775666377876E074-876
chr166637803766378182E074-570
chr166637819866378976E0740
chr166640030766400634E07421555
chr166633805666338691E081-40061
chr166633882566338875E081-39877
chr166635855666359114E081-19638
chr166636064666361402E081-17350
chr166636143866361521E081-17231
chr166636153066361580E081-17172
chr166636649966366549E081-12203
chr166636660766366941E081-11811
chr166636695866367605E081-11147
chr166636765766367782E081-10970
chr166638680366386843E0818051
chr166638692066387401E0818168
chr166638743966387606E0818687
chr166638771866387899E0818966
chr166638800666388056E0819254
chr166638807266388167E0819320
chr166633805666338691E082-40061
chr166633882566338875E082-39877
chr166638743966387606E0828687
chr166638771866387899E0828966
chr166638800666388056E0829254
chr166638807266388167E0829320










Promoter Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance(-/+:Up/Downstream)
chr166640064166400808E06721889
chr166640087366400967E06722121
chr166640109866401224E06722346
chr166640135866401427E06722606
chr166640148866401550E06722736
chr166640170866401804E06722956
chr166640188466401989E06723132
chr166640064166400808E06821889
chr166640087366400967E06822121
chr166640109866401224E06822346
chr166640135866401427E06822606
chr166640148866401550E06822736
chr166640170866401804E06822956
chr166640188466401989E06823132
chr166640064166400808E06921889
chr166640087366400967E06922121
chr166640064166400808E07121889
chr166640087366400967E07122121
chr166640109866401224E07122346
chr166640135866401427E07122606
chr166640148866401550E07122736
chr166640170866401804E07222956
chr166640188466401989E07223132
chr166640064166400808E07321889
chr166640087366400967E07322121
chr166640109866401224E07322346
chr166640135866401427E07322606
chr166640148866401550E07322736
chr166640170866401804E07322956
chr166640188466401989E07323132