rs16874653

Homo sapiens
A>G
CREB5 : Intron Variant
Check p-value
SNV (Single Nucleotide Variation)
G=0308 (9238/29906,GnomAD)
G=0320 (9328/29118,TOPMED)
G=0305 (1527/5008,1000G)
G=0318 (1226/3854,ALSPAC)
G=0319 (1181/3708,TWINSUK)
chr7:28675439 (GRCh38.p7) (7p15.1)
AD
GWASdb2
1   publication(s)
See rs on genome

Genomic Coordinates

Sequence Name Change(s)
GRCh38.p7 chr 7NC_000007.14:g.28675439A>G
GRCh37.p13 chr 7NC_000007.13:g.28715056A>G

Gene: CREB5, cAMP responsive element binding protein 5(plus strand)

Molecule type Change Amino acid[Codon] SO Term
CREB5 transcript variant 2NM_004904.3:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant 1NM_182898.3:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant 3NM_182899.4:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant 4NM_001011666.2:c.N/AGenic Upstream Transcript Variant
CREB5 transcript variant X4XM_005249906.1:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant X1XM_017012806.1:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant X2XM_017012807.1:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant X3XM_017012808.1:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant X5XM_017012809.1:c.N/AIntron Variant
CREB5 transcript variant X7XM_017012810.1:c.N/AGenic Upstream Transcript Variant
CREB5 transcript variant X9XM_011515618.2:c.N/AGenic Downstream Transcript Variant
CREB5 transcript variant X7XR_001744893.1:n.N/AGenic Upstream Transcript Variant

Population Frequency

Study Population Group Sample # Ref Allele Alt Allele
1000GenomesAfricanSub1322A=0.688G=0.312
1000GenomesAmericanSub694A=0.700G=0.300
1000GenomesEast AsianSub1008A=0.745G=0.255
1000GenomesEuropeSub1006A=0.674G=0.326
1000GenomesGlobalStudy-wide5008A=0.695G=0.305
1000GenomesSouth AsianSub978A=0.670G=0.330
The Avon Longitudinal Study of Parents and ChildrenPARENT AND CHILD COHORTStudy-wide3854A=0.682G=0.318
The Genome Aggregation DatabaseAfricanSub8702A=0.699G=0.301
The Genome Aggregation DatabaseAmericanSub836A=0.720G=0.280
The Genome Aggregation DatabaseEast AsianSub1610A=0.798G=0.202
The Genome Aggregation DatabaseEuropeSub18456A=0.676G=0.323
The Genome Aggregation DatabaseGlobalStudy-wide29906A=0.691G=0.308
The Genome Aggregation DatabaseOtherSub302A=0.720G=0.280
Trans-Omics for Precision MedicineGlobalStudy-wide29118A=0.679G=0.320
UK 10K study - TwinsTWIN COHORTStudy-wide3708A=0.681G=0.319
PMID Title Author Journal
20201924Genome-wide association study of alcohol dependence implicates a region on chromosome 11.Edenberg HJAlcohol Clin Exp Res

P-Value

SNP ID p-value Traits Study
rs168746530.000535alcohol dependence20201924

eQTL of rs16874653 in Brain tissues (GTEx Analysis Release V7)

Position (v37) eGene GeneID Variant p-value TSS Tissue
There is no eQTL annotation for this SNP

meQTL of rs16874653 in Fetal Brain

Probe ID Position Gene beta p-value
There is no meQTL annotation for this SNP

Genomic View

Chromatin Interaction

There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.

Enhancer Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance ( -/+ : Up/Downstream )
chr72866842828668478E067-46578
chr72866852628668826E067-46230
chr72866890628669498E067-45558
chr72866951228669750E067-45306
chr72868150428681555E067-33501
chr72868157328681711E067-33345
chr72868179728682039E067-33017
chr72868216728682555E067-32501
chr72868264328682753E067-32303
chr72868278828682870E067-32186
chr72868616028686940E067-28116
chr72868711628687166E067-27890
chr72869339828693448E067-21608
chr72869374728693797E067-21259
chr72869387828693990E067-21066
chr72872277828722937E0677722
chr72872303828723226E0677982
chr72872332828723411E0678272
chr72872368828723738E0678632
chr72872787628728010E06712820
chr72872802728728731E06712971
chr72873415828734276E06719102
chr72873431828734455E06719262
chr72873446028734590E06719404
chr72873473828734821E06719682
chr72873493328735167E06719877
chr72873524528735834E06720189
chr72873584128735980E06720785
chr72873728128737379E06722225
chr72873794628738073E06722890
chr72873818228738280E06723126
chr72873833528738385E06723279
chr72874124628742229E06726190
chr72874235528742405E06727299
chr72874271528742944E06727659
chr72874660628746656E06731550
chr72874691928746998E06731863
chr72874699928747256E06731943
chr72874735228747432E06732296
chr72874897028749087E06733914
chr72875065128751343E06735595
chr72875379028753852E06738734
chr72875394728754098E06738891
chr72875420528754517E06739149
chr72875452928754596E06739473
chr72875463528754705E06739579
chr72875490528754945E06739849
chr72875702228757102E06741966
chr72875714028757507E06742084
chr72875753128758124E06742475
chr72875824328758385E06743187
chr72875843428758611E06743378
chr72876260528762655E06747549
chr72876273228762805E06747676
chr72876295328763247E06747897
chr72876385028763908E06748794
chr72866890628669498E068-45558
chr72867083328671037E068-44019
chr72867112828671225E068-43831
chr72867145128671508E068-43548
chr72867157428671624E068-43432
chr72867167528672051E068-43005
chr72867208428672434E068-42622
chr72868150428681555E068-33501
chr72868157328681711E068-33345
chr72868179728682039E068-33017
chr72868216728682555E068-32501
chr72868616028686940E068-28116
chr72868711628687166E068-27890
chr72869796528698437E068-16619
chr72872212028722768E0687064
chr72872277828722937E0687722
chr72872303828723226E0687982
chr72872332828723411E0688272
chr72872368828723738E0688632
chr72872963628729699E06814580
chr72872978528730079E06814729
chr72873028428730365E06815228
chr72873209728732433E06817041
chr72873403728734120E06818981
chr72873415828734276E06819102
chr72873431828734455E06819262
chr72873446028734590E06819404
chr72873473828734821E06819682
chr72873493328735167E06819877
chr72873524528735834E06820189
chr72873584128735980E06820785
chr72873611028736262E06821054
chr72873728128737379E06822225
chr72873740128737546E06822345
chr72873758328737813E06822527
chr72873794628738073E06822890
chr72873818228738280E06823126
chr72873833528738385E06823279
chr72873903528739200E06823979
chr72873931328739424E06824257
chr72873946828739694E06824412
chr72873976528740102E06824709
chr72874014528741028E06825089
chr72874107528741143E06826019
chr72874124628742229E06826190
chr72874235528742405E06827299
chr72874271528742944E06827659
chr72874612328746574E06831067
chr72874660628746656E06831550
chr72874691928746998E06831863
chr72874699928747256E06831943
chr72874735228747432E06832296
chr72874897028749087E06833914
chr72874912528749336E06834069
chr72874941728749658E06834361
chr72875065128751343E06835595
chr72875394728754098E06838891
chr72875420528754517E06839149
chr72875452928754596E06839473
chr72875463528754705E06839579
chr72875490528754945E06839849
chr72875714028757507E06842084
chr72875753128758124E06842475
chr72875824328758385E06843187
chr72875843428758611E06843378
chr72875895928759009E06843903
chr72876295328763247E06847897
chr72876385028763908E06848794
chr72876469328764760E06849637
chr72876476628764919E06849710
chr72866890628669498E069-45558
chr72867083328671037E069-44019
chr72867145128671508E069-43548
chr72867157428671624E069-43432
chr72867167528672051E069-43005
chr72868150428681555E069-33501
chr72868157328681711E069-33345
chr72868179728682039E069-33017
chr72868556728685826E069-29230
chr72868616028686940E069-28116
chr72868711628687166E069-27890
chr72869339828693448E069-21608
chr72869374728693797E069-21259
chr72869387828693990E069-21066
chr72872277828722937E0697722
chr72872303828723226E0697982
chr72872332828723411E0698272
chr72872368828723738E0698632
chr72872963628729699E06914580
chr72872978528730079E06914729
chr72873403728734120E06918981
chr72873415828734276E06919102
chr72873431828734455E06919262
chr72873446028734590E06919404
chr72873473828734821E06919682
chr72873493328735167E06919877
chr72873524528735834E06920189
chr72873584128735980E06920785
chr72873728128737379E06922225
chr72873740128737546E06922345
chr72873758328737813E06922527
chr72873794628738073E06922890
chr72873818228738280E06923126
chr72873833528738385E06923279
chr72873841628738571E06923360
chr72873861228738748E06923556
chr72873885328738907E06923797
chr72873903528739200E06923979
chr72873931328739424E06924257
chr72873946828739694E06924412
chr72873976528740102E06924709
chr72874014528741028E06925089
chr72874107528741143E06926019
chr72874124628742229E06926190
chr72874235528742405E06927299
chr72874271528742944E06927659
chr72874302028743278E06927964
chr72874353328743619E06928477
chr72874596328746027E06930907
chr72874612328746574E06931067
chr72874660628746656E06931550
chr72874691928746998E06931863
chr72874699928747256E06931943
chr72874735228747432E06932296
chr72874897028749087E06933914
chr72874912528749336E06934069
chr72874941728749658E06934361
chr72875065128751343E06935595
chr72875394728754098E06938891
chr72875420528754517E06939149
chr72875452928754596E06939473
chr72875463528754705E06939579
chr72875490528754945E06939849
chr72875702228757102E06941966
chr72875714028757507E06942084
chr72875753128758124E06942475
chr72875824328758385E06943187
chr72875843428758611E06943378
chr72876201928762093E06946963
chr72876237828762574E06947322
chr72876260528762655E06947549
chr72876273228762805E06947676
chr72876295328763247E06947897
chr72876385028763908E06948794
chr72876469328764760E06949637
chr72876476628764919E06949710
chr72869500628695104E070-19952
chr72869511128695189E070-19867
chr72869683528696917E070-18139
chr72869739428697471E070-17585
chr72869796528698437E070-16619
chr72872212028722768E0707064
chr72872277828722937E0707722
chr72872978528730079E07014729
chr72873028428730365E07015228
chr72873058228730642E07015526
chr72873304228733101E07017986
chr72873350928733559E07018453
chr72873403728734120E07018981
chr72873415828734276E07019102
chr72873431828734455E07019262
chr72873446028734590E07019404
chr72873473828734821E07019682
chr72873493328735167E07019877
chr72873524528735834E07020189
chr72873584128735980E07020785
chr72873611028736262E07021054
chr72873740128737546E07022345
chr72873758328737813E07022527
chr72873794628738073E07022890
chr72873818228738280E07023126
chr72873833528738385E07023279
chr72873885328738907E07023797
chr72873903528739200E07023979
chr72873931328739424E07024257
chr72873946828739694E07024412
chr72873976528740102E07024709
chr72874014528741028E07025089
chr72874107528741143E07026019
chr72874124628742229E07026190
chr72874235528742405E07027299
chr72874612328746574E07031067
chr72874660628746656E07031550
chr72874691928746998E07031863
chr72874699928747256E07031943
chr72874735228747432E07032296
chr72875018428750224E07035128
chr72875037228750412E07035316
chr72875065128751343E07035595
chr72875420528754517E07039149
chr72875452928754596E07039473
chr72875463528754705E07039579
chr72875490528754945E07039849
chr72875702228757102E07041966
chr72875714028757507E07042084
chr72875753128758124E07042475
chr72875824328758385E07043187
chr72875843428758611E07043378
chr72875895928759009E07043903
chr72875910428759178E07044048
chr72876237828762574E07047322
chr72876260528762655E07047549
chr72876273228762805E07047676
chr72876295328763247E07047897
chr72876385028763908E07048794
chr72876469328764760E07049637
chr72876476628764919E07049710
chr72866571428666635E071-48421
chr72866668228668055E071-47001
chr72866823728668296E071-46760
chr72866842828668478E071-46578
chr72866852628668826E071-46230
chr72866890628669498E071-45558
chr72866951228669750E071-45306
chr72866976928670426E071-44630
chr72867055728670597E071-44459
chr72867067428670728E071-44328
chr72867083328671037E071-44019
chr72867112828671225E071-43831
chr72867145128671508E071-43548
chr72867157428671624E071-43432
chr72867167528672051E071-43005
chr72867208428672434E071-42622
chr72867248728672537E071-42519
chr72868150428681555E071-33501
chr72868157328681711E071-33345
chr72868179728682039E071-33017
chr72868216728682555E071-32501
chr72868264328682753E071-32303
chr72868278828682870E071-32186
chr72868288228683527E071-31529
chr72868616028686940E071-28116
chr72868711628687166E071-27890
chr72869339828693448E071-21608
chr72869374728693797E071-21259
chr72869387828693990E071-21066
chr72869796528698437E071-16619
chr72872212028722768E0717064
chr72872277828722937E0717722
chr72872963628729699E07114580
chr72872978528730079E07114729
chr72873028428730365E07115228
chr72873280528732922E07117749
chr72873304228733101E07117986
chr72873350928733559E07118453
chr72873403728734120E07118981
chr72873415828734276E07119102
chr72873431828734455E07119262
chr72873446028734590E07119404
chr72873473828734821E07119682
chr72873493328735167E07119877
chr72873524528735834E07120189
chr72873584128735980E07120785
chr72873611028736262E07121054
chr72873728128737379E07122225
chr72873740128737546E07122345
chr72873758328737813E07122527
chr72873794628738073E07122890
chr72873818228738280E07123126
chr72873833528738385E07123279
chr72873841628738571E07123360
chr72873861228738748E07123556
chr72873885328738907E07123797
chr72873903528739200E07123979
chr72873931328739424E07124257
chr72873946828739694E07124412
chr72873976528740102E07124709
chr72874014528741028E07125089
chr72874107528741143E07126019
chr72874124628742229E07126190
chr72874235528742405E07127299
chr72874271528742944E07127659
chr72874302028743278E07127964
chr72874502328745151E07129967
chr72874518628745398E07130130
chr72874596328746027E07130907
chr72874612328746574E07131067
chr72874660628746656E07131550
chr72874691928746998E07131863
chr72874699928747256E07131943
chr72874735228747432E07132296
chr72874897028749087E07133914
chr72874912528749336E07134069
chr72874941728749658E07134361
chr72875018428750224E07135128
chr72875037228750412E07135316
chr72875065128751343E07135595
chr72875379028753852E07138734
chr72875394728754098E07138891
chr72875420528754517E07139149
chr72875452928754596E07139473
chr72875463528754705E07139579
chr72875490528754945E07139849
chr72875702228757102E07141966
chr72875714028757507E07142084
chr72875753128758124E07142475
chr72875824328758385E07143187
chr72875843428758611E07143378
chr72875895928759009E07143903
chr72876054828760673E07145492
chr72876237828762574E07147322
chr72876260528762655E07147549
chr72876273228762805E07147676
chr72876295328763247E07147897
chr72876385028763908E07148794
chr72876469328764760E07149637
chr72876476628764919E07149710
chr72866852628668826E072-46230
chr72866890628669498E072-45558
chr72866951228669750E072-45306
chr72866976928670426E072-44630
chr72867055728670597E072-44459
chr72867067428670728E072-44328
chr72867083328671037E072-44019
chr72867112828671225E072-43831
chr72867145128671508E072-43548
chr72867157428671624E072-43432
chr72867167528672051E072-43005
chr72867208428672434E072-42622
chr72867248728672537E072-42519
chr72868157328681711E072-33345
chr72868179728682039E072-33017
chr72868216728682555E072-32501
chr72868264328682753E072-32303
chr72868278828682870E072-32186
chr72868288228683527E072-31529
chr72868616028686940E072-28116
chr72872277828722937E0727722
chr72872303828723226E0727982
chr72872332828723411E0728272
chr72872368828723738E0728632
chr72872940328729453E07214347
chr72872963628729699E07214580
chr72872978528730079E07214729
chr72873350928733559E07218453
chr72873403728734120E07218981
chr72873415828734276E07219102
chr72873431828734455E07219262
chr72873446028734590E07219404
chr72873473828734821E07219682
chr72873493328735167E07219877
chr72873524528735834E07220189
chr72873584128735980E07220785
chr72873818228738280E07223126
chr72873833528738385E07223279
chr72873841628738571E07223360
chr72873861228738748E07223556
chr72873885328738907E07223797
chr72873903528739200E07223979
chr72873931328739424E07224257
chr72873946828739694E07224412
chr72873976528740102E07224709
chr72874014528741028E07225089
chr72874107528741143E07226019
chr72874124628742229E07226190
chr72874235528742405E07227299
chr72874271528742944E07227659
chr72874612328746574E07231067
chr72874897028749087E07233914
chr72874912528749336E07234069
chr72874941728749658E07234361
chr72875065128751343E07235595
chr72875379028753852E07238734
chr72875394728754098E07238891
chr72875420528754517E07239149
chr72875452928754596E07239473
chr72875463528754705E07239579
chr72875490528754945E07239849
chr72875714028757507E07242084
chr72875753128758124E07242475
chr72875824328758385E07243187
chr72875843428758611E07243378
chr72869796528698437E073-16619
chr72872277828722937E0737722
chr72872940328729453E07314347
chr72872978528730079E07314729
chr72873473828734821E07319682
chr72873493328735167E07319877
chr72873524528735834E07320189
chr72873584128735980E07320785
chr72874660628746656E07331550
chr72874691928746998E07331863
chr72874699928747256E07331943
chr72874735228747432E07332296
chr72875824328758385E07343187
chr72875843428758611E07343378
chr72876476628764919E07349710
chr72866890628669498E074-45558
chr72866951228669750E074-45306
chr72867067428670728E074-44328
chr72867083328671037E074-44019
chr72867112828671225E074-43831
chr72867145128671508E074-43548
chr72867157428671624E074-43432
chr72867167528672051E074-43005
chr72867208428672434E074-42622
chr72867248728672537E074-42519
chr72868112928681180E074-33876
chr72868124628681309E074-33747
chr72868150428681555E074-33501
chr72868157328681711E074-33345
chr72868179728682039E074-33017
chr72868216728682555E074-32501
chr72868264328682753E074-32303
chr72868278828682870E074-32186
chr72868530028685340E074-29716
chr72868556728685826E074-29230
chr72868616028686940E074-28116
chr72868711628687166E074-27890
chr72872212028722768E0747064
chr72872277828722937E0747722
chr72872303828723226E0747982
chr72872332828723411E0748272
chr72872368828723738E0748632
chr72872963628729699E07414580
chr72872978528730079E07414729
chr72873028428730365E07415228
chr72873058228730642E07415526
chr72873113928731189E07416083
chr72873133528731393E07416279
chr72873140928731477E07416353
chr72873178628731845E07416730
chr72873186328731952E07416807
chr72873209728732433E07417041
chr72873280528732922E07417749
chr72873304228733101E07417986
chr72873350928733559E07418453
chr72873403728734120E07418981
chr72873415828734276E07419102
chr72873431828734455E07419262
chr72873446028734590E07419404
chr72873473828734821E07419682
chr72873493328735167E07419877
chr72873524528735834E07420189
chr72873584128735980E07420785
chr72873611028736262E07421054
chr72873740128737546E07422345
chr72873758328737813E07422527
chr72873794628738073E07422890
chr72873818228738280E07423126
chr72873833528738385E07423279
chr72873841628738571E07423360
chr72873861228738748E07423556
chr72873885328738907E07423797
chr72873903528739200E07423979
chr72873931328739424E07424257
chr72873946828739694E07424412
chr72873976528740102E07424709
chr72874014528741028E07425089
chr72874235528742405E07427299
chr72874271528742944E07427659
chr72874612328746574E07431067
chr72874660628746656E07431550
chr72874691928746998E07431863
chr72874699928747256E07431943
chr72874735228747432E07432296
chr72874941728749658E07434361
chr72875018428750224E07435128
chr72875037228750412E07435316
chr72875065128751343E07435595
chr72875313528753229E07438079
chr72875379028753852E07438734
chr72875394728754098E07438891
chr72875420528754517E07439149
chr72875452928754596E07439473
chr72875463528754705E07439579
chr72875490528754945E07439849
chr72875639828756616E07441342
chr72875675128756809E07441695
chr72875702228757102E07441966
chr72875714028757507E07442084
chr72875753128758124E07442475
chr72875824328758385E07443187
chr72875843428758611E07443378
chr72876143528761491E07446379
chr72876158128761662E07446525
chr72876201928762093E07446963
chr72876237828762574E07447322
chr72876385028763908E07448794
chr72876469328764760E07449637
chr72876476628764919E07449710
chr72866976928670426E081-44630
chr72868150428681555E081-33501
chr72868157328681711E081-33345
chr72868216728682555E081-32501
chr72868264328682753E081-32303
chr72868278828682870E081-32186
chr72868288228683527E081-31529
chr72873493328735167E08119877
chr72873524528735834E08120189
chr72873611028736262E08121054
chr72873728128737379E08122225
chr72873740128737546E08122345
chr72873758328737813E08122527
chr72873794628738073E08122890
chr72873818228738280E08123126
chr72873833528738385E08123279
chr72873841628738571E08123360
chr72873861228738748E08123556
chr72873885328738907E08123797
chr72873946828739694E08124412
chr72873976528740102E08124709
chr72874747128748811E08132415
chr72874897028749087E08133914
chr72874912528749336E08134069
chr72874941728749658E08134361
chr72875018428750224E08135128
chr72875037228750412E08135316
chr72875065128751343E08135595
chr72866951228669750E082-45306
chr72866976928670426E082-44630
chr72867055728670597E082-44459
chr72867067428670728E082-44328
chr72873473828734821E08219682
chr72873493328735167E08219877
chr72873524528735834E08220189
chr72873584128735980E08220785
chr72873728128737379E08222225
chr72873794628738073E08222890
chr72873818228738280E08223126
chr72873833528738385E08223279
chr72873861228738748E08223556
chr72873885328738907E08223797
chr72873903528739200E08223979
chr72873931328739424E08224257
chr72873946828739694E08224412
chr72873976528740102E08224709
chr72874014528741028E08225089
chr72874107528741143E08226019
chr72874124628742229E08226190
chr72874612328746574E08231067
chr72874660628746656E08231550
chr72874691928746998E08231863
chr72874699928747256E08231943
chr72874735228747432E08232296
chr72874912528749336E08234069
chr72874941728749658E08234361
chr72875037228750412E08235316
chr72875065128751343E08235595
chr72875379028753852E08238734
chr72875394728754098E08238891
chr72875420528754517E08239149
chr72875452928754596E08239473
chr72875824328758385E08243187
chr72875843428758611E08243378
chr72875895928759009E08243903
chr72876237828762574E08247322
chr72876260528762655E08247549
chr72876273228762805E08247676
chr72876295328763247E08247897










Promoter Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance(-/+:Up/Downstream)
chr72872389828726697E0678842
chr72872675728727620E06711701
chr72872389828726697E0688842
chr72872675728727620E06811701
chr72872389828726697E0698842
chr72872675728727620E06911701
chr72872389828726697E0708842
chr72872675728727620E07011701
chr72872389828726697E0718842
chr72872675728727620E07111701
chr72872389828726697E0728842
chr72872675728727620E07211701
chr72872389828726697E0738842
chr72872675728727620E07311701
chr72872389828726697E0748842
chr72872675728727620E07411701
chr72872675728727620E08111701
chr72872389828726697E0828842
chr72872675728727620E08211701