rs2746177

Homo sapiens
G>A
None
Check p-value
SNV (Single Nucleotide Variation)
A=0391 (11701/29860,GnomAD)
A=0428 (12490/29118,TOPMED)
A=0415 (2076/5008,1000G)
A=0355 (1367/3854,ALSPAC)
A=0350 (1296/3708,TWINSUK)
chr6:41671837 (GRCh38.p7) (6p21.1)
AD
GWASdb2
1   publication(s)
See rs on genome
3 Promoters around

Genomic Coordinates

Sequence Name Change(s)
GRCh38.p7 chr 6NC_000006.12:g.41671837G>A
GRCh37.p13 chr 6NC_000006.11:g.41639575G>A

Population Frequency

Study Population Group Sample # Ref Allele Alt Allele
1000GenomesAfricanSub1322G=0.394A=0.606
1000GenomesAmericanSub694G=0.650A=0.350
1000GenomesEast AsianSub1008G=0.679A=0.321
1000GenomesEuropeSub1006G=0.677A=0.323
1000GenomesGlobalStudy-wide5008G=0.585A=0.415
1000GenomesSouth AsianSub978G=0.610A=0.390
The Avon Longitudinal Study of Parents and ChildrenPARENT AND CHILD COHORTStudy-wide3854G=0.645A=0.355
The Genome Aggregation DatabaseAfricanSub8690G=0.453A=0.547
The Genome Aggregation DatabaseAmericanSub836G=0.680A=0.320
The Genome Aggregation DatabaseEast AsianSub1614G=0.639A=0.361
The Genome Aggregation DatabaseEuropeSub18418G=0.673A=0.326
The Genome Aggregation DatabaseGlobalStudy-wide29860G=0.608A=0.391
The Genome Aggregation DatabaseOtherSub302G=0.710A=0.290
Trans-Omics for Precision MedicineGlobalStudy-wide29118G=0.571A=0.428
UK 10K study - TwinsTWIN COHORTStudy-wide3708G=0.650A=0.350
PMID Title Author Journal
23743675A meta-analysis of two genome-wide association studies to identify novel loci for maximum number of alcoholic drinks.Kapoor MHum Genet

P-Value

SNP ID p-value Traits Study
rs27461771.8E-05alcohol consumption23743675

eQTL of rs2746177 in Brain tissues (GTEx Analysis Release V7)

Position (v37) eGene GeneID Variant p-value TSS Tissue
There is no eQTL annotation for this SNP

meQTL of rs2746177 in Fetal Brain

Probe ID Position Gene beta p-value
There is no meQTL annotation for this SNP

Genomic View

Chromatin Interaction

There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.

Enhancer Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance ( -/+ : Up/Downstream )
chr64159323641593492E067-46083
chr64159355841593694E067-45881
chr64164975141650751E06710176
chr64165183841652097E06712263
chr64165589441655946E06716319
chr64165608041656164E06716505
chr64165618341656570E06716608
chr64165695641657006E06717381
chr64165725641657396E06717681
chr64166030041660460E06720725
chr64166079941661080E06721224
chr64166129841661452E06721723
chr64166175441661920E06722179
chr64166199941662049E06722424
chr64166253141662581E06722956
chr64166259441662644E06723019
chr64166273141662866E06723156
chr64166298041663061E06723405
chr64166376441664133E06724189
chr64166525141665426E06725676
chr64166544541666713E06725870
chr64166681241666873E06727237
chr64166692641667051E06727351
chr64166712941667229E06727554
chr64166746141667574E06727886
chr64166824841668457E06728673
chr64166847041668662E06728895
chr64166874441668794E06729169
chr64166896241669030E06729387
chr64166931841669396E06729743
chr64167356641674239E06733991
chr64167429441674429E06734719
chr64167446241674530E06734887
chr64167456741675057E06734992
chr64167511541675275E06735540
chr64167532541675465E06735750
chr64167546941675954E06735894
chr64167598841676081E06736413
chr64167613341676311E06736558
chr64167658541676939E06737010
chr64167926141679348E06739686
chr64167939741679447E06739822
chr64167997041680070E06740395
chr64168016441680268E06740589
chr64168034941681754E06740774
chr64168203941682119E06742464
chr64168212841682197E06742553
chr64168233641682430E06742761
chr64168254241682684E06742967
chr64168439041684552E06744815
chr64168495141685041E06745376
chr64168515341685352E06745578
chr64168550541685555E06745930
chr64168557841685766E06746003
chr64168741241688232E06747837
chr64168833541688447E06748760
chr64168893641688986E06749361
chr64168910041689150E06749525
chr64168935641689445E06749781
chr64159323641593492E068-46083
chr64159355841593694E068-45881
chr64160197941602336E068-37239
chr64160237241602717E068-36858
chr64160279841602927E068-36648
chr64160301041603149E068-36426
chr64160824541608467E068-31108
chr64161310141613335E068-26240
chr64161479841615274E068-24301
chr64164963641649681E06810061
chr64165183841652097E06812263
chr64165213641652225E06812561
chr64165618341656570E06816608
chr64165695641657006E06817381
chr64165725641657396E06817681
chr64166030041660460E06820725
chr64166079941661080E06821224
chr64166129841661452E06821723
chr64166175441661920E06822179
chr64166199941662049E06822424
chr64166253141662581E06822956
chr64166259441662644E06823019
chr64166273141662866E06823156
chr64166298041663061E06823405
chr64166376441664133E06824189
chr64166544541666713E06825870
chr64166681241666873E06827237
chr64166692641667051E06827351
chr64166712941667229E06827554
chr64166746141667574E06827886
chr64167356641674239E06833991
chr64167429441674429E06834719
chr64167446241674530E06834887
chr64167456741675057E06834992
chr64167511541675275E06835540
chr64167532541675465E06835750
chr64167546941675954E06835894
chr64167598841676081E06836413
chr64167613341676311E06836558
chr64167658541676939E06837010
chr64167926141679348E06839686
chr64167939741679447E06839822
chr64168034941681754E06840774
chr64168203941682119E06842464
chr64168212841682197E06842553
chr64168233641682430E06842761
chr64168254241682684E06842967
chr64168356241683848E06843987
chr64168439041684552E06844815
chr64168495141685041E06845376
chr64168515341685352E06845578
chr64168550541685555E06845930
chr64168557841685766E06846003
chr64168729641687393E06847721
chr64168741241688232E06847837
chr64168833541688447E06848760
chr64168893641688986E06849361
chr64168910041689150E06849525
chr64168935641689445E06849781
chr64160237241602717E069-36858
chr64160279841602927E069-36648
chr64160301041603149E069-36426
chr64164975141650751E06910176
chr64165183841652097E06912263
chr64165213641652225E06912561
chr64165608041656164E06916505
chr64165618341656570E06916608
chr64165695641657006E06917381
chr64165725641657396E06917681
chr64165924441660126E06919669
chr64166030041660460E06920725
chr64166079941661080E06921224
chr64166129841661452E06921723
chr64166175441661920E06922179
chr64166199941662049E06922424
chr64166253141662581E06922956
chr64166259441662644E06923019
chr64166273141662866E06923156
chr64166298041663061E06923405
chr64166376441664133E06924189
chr64166525141665426E06925676
chr64166544541666713E06925870
chr64166681241666873E06927237
chr64166692641667051E06927351
chr64166712941667229E06927554
chr64166746141667574E06927886
chr64166824841668457E06928673
chr64166847041668662E06928895
chr64166874441668794E06929169
chr64166896241669030E06929387
chr64166931841669396E06929743
chr64167429441674429E06934719
chr64167446241674530E06934887
chr64167456741675057E06934992
chr64167511541675275E06935540
chr64167532541675465E06935750
chr64167546941675954E06935894
chr64167598841676081E06936413
chr64167613341676311E06936558
chr64167658541676939E06937010
chr64168016441680268E06940589
chr64168034941681754E06940774
chr64168203941682119E06942464
chr64168212841682197E06942553
chr64168233641682430E06942761
chr64168254241682684E06942967
chr64168307741683141E06943502
chr64168356241683848E06943987
chr64168439041684552E06944815
chr64168495141685041E06945376
chr64168515341685352E06945578
chr64168550541685555E06945930
chr64168557841685766E06946003
chr64168616941686271E06946594
chr64168634141686391E06946766
chr64168646241686763E06946887
chr64168729641687393E06947721
chr64168741241688232E06947837
chr64168833541688447E06948760
chr64168893641688986E06949361
chr64168910041689150E06949525
chr64168935641689445E06949781
chr64159323641593492E070-46083
chr64159355841593694E070-45881
chr64160197941602336E070-37239
chr64160237241602717E070-36858
chr64160279841602927E070-36648
chr64160824541608467E070-31108
chr64161199741612498E070-27077
chr64163874541639315E070-260
chr64163943141639555E070-20
chr64163996241640025E070387
chr64164092941641111E0701354
chr64164112241641172E0701547
chr64164117641641320E0701601
chr64164147941641567E0701904
chr64164168041641833E0702105
chr64164325141643468E0703676
chr64164352541643641E0703950
chr64164498041645124E0705405
chr64164704641647096E0707471
chr64165183841652097E07012263
chr64167429441674429E07034719
chr64167446241674530E07034887
chr64167456741675057E07034992
chr64168016441680268E07040589
chr64168034941681754E07040774
chr64160197941602336E071-37239
chr64160237241602717E071-36858
chr64160279841602927E071-36648
chr64160301041603149E071-36426
chr64164963641649681E07110061
chr64164975141650751E07110176
chr64165183841652097E07112263
chr64165213641652225E07112561
chr64165233741652451E07112762
chr64165260641652657E07113031
chr64165279041652857E07113215
chr64165510541655219E07115530
chr64165529041655683E07115715
chr64165589441655946E07116319
chr64165608041656164E07116505
chr64165618341656570E07116608
chr64165695641657006E07117381
chr64165725641657396E07117681
chr64165924441660126E07119669
chr64166030041660460E07120725
chr64166079941661080E07121224
chr64166175441661920E07122179
chr64166199941662049E07122424
chr64166253141662581E07122956
chr64166259441662644E07123019
chr64166273141662866E07123156
chr64166298041663061E07123405
chr64166376441664133E07124189
chr64166453941664589E07124964
chr64166525141665426E07125676
chr64166544541666713E07125870
chr64166681241666873E07127237
chr64166692641667051E07127351
chr64166712941667229E07127554
chr64166746141667574E07127886
chr64166824841668457E07128673
chr64166847041668662E07128895
chr64166874441668794E07129169
chr64166896241669030E07129387
chr64166931841669396E07129743
chr64167456741675057E07134992
chr64167546941675954E07135894
chr64167598841676081E07136413
chr64167613341676311E07136558
chr64167658541676939E07137010
chr64167926141679348E07139686
chr64167939741679447E07139822
chr64167997041680070E07140395
chr64168016441680268E07140589
chr64168034941681754E07140774
chr64168203941682119E07142464
chr64168212841682197E07142553
chr64168233641682430E07142761
chr64168254241682684E07142967
chr64168307741683141E07143502
chr64168356241683848E07143987
chr64168439041684552E07144815
chr64168495141685041E07145376
chr64168515341685352E07145578
chr64168550541685555E07145930
chr64168557841685766E07146003
chr64168616941686271E07146594
chr64168634141686391E07146766
chr64168646241686763E07146887
chr64168729641687393E07147721
chr64168741241688232E07147837
chr64168833541688447E07148760
chr64168893641688986E07149361
chr64168910041689150E07149525
chr64168935641689445E07149781
chr64160197941602336E072-37239
chr64160237241602717E072-36858
chr64160279841602927E072-36648
chr64160301041603149E072-36426
chr64165183841652097E07212263
chr64165510541655219E07215530
chr64165529041655683E07215715
chr64165589441655946E07216319
chr64165608041656164E07216505
chr64165618341656570E07216608
chr64165695641657006E07217381
chr64165725641657396E07217681
chr64165924441660126E07219669
chr64166030041660460E07220725
chr64166079941661080E07221224
chr64166129841661452E07221723
chr64166175441661920E07222179
chr64166199941662049E07222424
chr64166253141662581E07222956
chr64166259441662644E07223019
chr64166273141662866E07223156
chr64166298041663061E07223405
chr64166376441664133E07224189
chr64166544541666713E07225870
chr64166681241666873E07227237
chr64166692641667051E07227351
chr64166712941667229E07227554
chr64166746141667574E07227886
chr64166824841668457E07228673
chr64167429441674429E07234719
chr64167446241674530E07234887
chr64167456741675057E07234992
chr64167511541675275E07235540
chr64167532541675465E07235750
chr64167546941675954E07235894
chr64167598841676081E07236413
chr64167613341676311E07236558
chr64167658541676939E07237010
chr64167926141679348E07239686
chr64167939741679447E07239822
chr64167997041680070E07240395
chr64168016441680268E07240589
chr64168034941681754E07240774
chr64168203941682119E07242464
chr64168212841682197E07242553
chr64168233641682430E07242761
chr64168254241682684E07242967
chr64168307741683141E07243502
chr64168356241683848E07243987
chr64168439041684552E07244815
chr64168495141685041E07245376
chr64168515341685352E07245578
chr64168550541685555E07245930
chr64168557841685766E07246003
chr64168616941686271E07246594
chr64168729641687393E07247721
chr64168741241688232E07247837
chr64168833541688447E07248760
chr64168893641688986E07249361
chr64168910041689150E07249525
chr64168935641689445E07249781
chr64160237241602717E073-36858
chr64160279841602927E073-36648
chr64160301041603149E073-36426
chr64162419641624445E073-15130
chr64164975141650751E07310176
chr64165183841652097E07312263
chr64165695641657006E07317381
chr64166030041660460E07320725
chr64166079941661080E07321224
chr64166129841661452E07321723
chr64166175441661920E07322179
chr64166199941662049E07322424
chr64166253141662581E07322956
chr64166259441662644E07323019
chr64166273141662866E07323156
chr64166298041663061E07323405
chr64166376441664133E07324189
chr64166544541666713E07325870
chr64166681241666873E07327237
chr64166692641667051E07327351
chr64166712941667229E07327554
chr64166746141667574E07327886
chr64166824841668457E07328673
chr64166847041668662E07328895
chr64166874441668794E07329169
chr64166896241669030E07329387
chr64166931841669396E07329743
chr64167195341672008E07332378
chr64167201741672107E07332442
chr64167356641674239E07333991
chr64167429441674429E07334719
chr64167446241674530E07334887
chr64167456741675057E07334992
chr64167511541675275E07335540
chr64167532541675465E07335750
chr64167546941675954E07335894
chr64167598841676081E07336413
chr64167613341676311E07336558
chr64167658541676939E07337010
chr64167926141679348E07339686
chr64167939741679447E07339822
chr64167997041680070E07340395
chr64168016441680268E07340589
chr64168034941681754E07340774
chr64168203941682119E07342464
chr64168212841682197E07342553
chr64168233641682430E07342761
chr64168254241682684E07342967
chr64168439041684552E07344815
chr64168495141685041E07345376
chr64168515341685352E07345578
chr64168550541685555E07345930
chr64168557841685766E07346003
chr64168729641687393E07347721
chr64168741241688232E07347837
chr64168893641688986E07349361
chr64160197941602336E074-37239
chr64160237241602717E074-36858
chr64160279841602927E074-36648
chr64160301041603149E074-36426
chr64161479841615274E074-24301
chr64164975141650751E07410176
chr64165183841652097E07412263
chr64165213641652225E07412561
chr64165233741652451E07412762
chr64165608041656164E07416505
chr64165618341656570E07416608
chr64165695641657006E07417381
chr64165725641657396E07417681
chr64165924441660126E07419669
chr64166030041660460E07420725
chr64166079941661080E07421224
chr64166129841661452E07421723
chr64166175441661920E07422179
chr64166199941662049E07422424
chr64166253141662581E07422956
chr64166259441662644E07423019
chr64166273141662866E07423156
chr64166298041663061E07423405
chr64166376441664133E07424189
chr64166544541666713E07425870
chr64166681241666873E07427237
chr64166692641667051E07427351
chr64166712941667229E07427554
chr64166746141667574E07427886
chr64166824841668457E07428673
chr64166847041668662E07428895
chr64166874441668794E07429169
chr64166896241669030E07429387
chr64166931841669396E07429743
chr64167356641674239E07433991
chr64167429441674429E07434719
chr64167446241674530E07434887
chr64167456741675057E07434992
chr64167511541675275E07435540
chr64167532541675465E07435750
chr64167546941675954E07435894
chr64167598841676081E07436413
chr64167613341676311E07436558
chr64167658541676939E07437010
chr64167926141679348E07439686
chr64167939741679447E07439822
chr64167997041680070E07440395
chr64168016441680268E07440589
chr64168034941681754E07440774
chr64168203941682119E07442464
chr64168212841682197E07442553
chr64168233641682430E07442761
chr64168254241682684E07442967
chr64168307741683141E07443502
chr64168356241683848E07443987
chr64168439041684552E07444815
chr64168495141685041E07445376
chr64168515341685352E07445578
chr64168550541685555E07445930
chr64168557841685766E07446003
chr64168616941686271E07446594
chr64168634141686391E07446766
chr64168646241686763E07446887
chr64168729641687393E07447721
chr64168741241688232E07447837
chr64168833541688447E07448760
chr64168893641688986E07449361
chr64168910041689150E07449525
chr64168935641689445E07449781
chr64159471541595097E081-44478
chr64160824541608467E081-31108
chr64161310141613335E081-26240
chr64162658541626720E081-12855
chr64163874541639315E081-260
chr64163943141639555E081-20
chr64164092941641111E0811354
chr64164112241641172E0811547
chr64164117641641320E0811601
chr64164147941641567E0811904
chr64164498041645124E0815405
chr64164975141650751E08110176
chr64160824541608467E082-31108
chr64163874541639315E082-260
chr64163943141639555E082-20
chr64164092941641111E0821354
chr64164112241641172E0821547
chr64164117641641320E0821601
chr64164975141650751E08210176










Promoter Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance(-/+:Up/Downstream)
chr64160444341608186E067-31389
chr64160444341608186E068-31389
chr64160444341608186E074-31389