rs6700403

Homo sapiens
T>C
PDE4B : Intron Variant
Check p-value
SNV (Single Nucleotide Variation)
C=0495 (14816/29928,GnomAD)
C=0459 (13365/29118,TOPMED)
C=0444 (2222/5008,1000G)
T==0418 (1610/3854,ALSPAC)
T==0423 (1567/3708,TWINSUK)
chr1:66269918 (GRCh38.p7) (1p31.3)
ND
GWASdb2
1   publication(s)
See rs on genome
0 Promoter around

Genomic Coordinates

Sequence Name Change(s)
GRCh38.p7 chr 1NC_000001.11:g.66269918T>C
GRCh37.p13 chr 1NC_000001.10:g.66735601T>C
PDE4B RefSeqGeneNG_029038.1:g.482409T>C

Gene: PDE4B, phosphodiesterase 4B(plus strand)

Molecule type Change Amino acid[Codon] SO Term
PDE4B transcript variant cNM_001037340.2:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant dNM_001037341.1:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant eNM_001297440.1:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant fNM_001297441.1:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant aNM_002600.3:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant bNM_001037339.2:c.N/AGenic Upstream Transcript Variant
PDE4B transcript variant gNM_001297442.1:c.N/AGenic Upstream Transcript Variant
PDE4B transcript variant X3XM_011541566.1:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant X1XM_017001445.1:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant X4XM_017001446.1:c.N/AIntron Variant
PDE4B transcript variant X3XM_005270924.3:c.N/AGenic Upstream Transcript Variant
PDE4B transcript variant X4XM_005270925.2:c.N/AGenic Upstream Transcript Variant
PDE4B transcript variant X2XM_006710680.3:c.N/AGenic Upstream Transcript Variant

Population Frequency

Study Population Group Sample # Ref Allele Alt Allele
1000GenomesAfricanSub1322T=0.676C=0.324
1000GenomesAmericanSub694T=0.620C=0.380
1000GenomesEast AsianSub1008T=0.491C=0.509
1000GenomesEuropeSub1006T=0.402C=0.598
1000GenomesGlobalStudy-wide5008T=0.556C=0.444
1000GenomesSouth AsianSub978T=0.570C=0.430
The Avon Longitudinal Study of Parents and ChildrenPARENT AND CHILD COHORTStudy-wide3854T=0.418C=0.582
The Genome Aggregation DatabaseAfricanSub8706T=0.664C=0.336
The Genome Aggregation DatabaseAmericanSub834T=0.570C=0.430
The Genome Aggregation DatabaseEast AsianSub1616T=0.498C=0.502
The Genome Aggregation DatabaseEuropeSub18470T=0.429C=0.570
The Genome Aggregation DatabaseGlobalStudy-wide29928T=0.504C=0.495
The Genome Aggregation DatabaseOtherSub302T=0.410C=0.590
Trans-Omics for Precision MedicineGlobalStudy-wide29118T=0.541C=0.459
UK 10K study - TwinsTWIN COHORTStudy-wide3708T=0.423C=0.577
PMID Title Author Journal
19268276Genome-wide association study of smoking initiation and current smoking.Vink JMAm J Hum Genet

P-Value

SNP ID p-value Traits Study
rs67004030.000149nicotine smoking19268276

eQTL of rs6700403 in Brain tissues (GTEx Analysis Release V7)

Position (v37) eGene GeneID Variant p-value TSS Tissue
There is no eQTL annotation for this SNP

meQTL of rs6700403 in Fetal Brain

Probe ID Position Gene beta p-value
There is no meQTL annotation for this SNP

Genomic View

Chromatin Interaction

There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.

Enhancer Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance ( -/+ : Up/Downstream )
chr16669751666697584E067-38017
chr16669783766697971E067-37630
chr16670375966704045E067-31556
chr16670565766705778E067-29823
chr16670666366706747E067-28854
chr16670674966706920E067-28681
chr16670770066707740E067-27861
chr16670825766708782E067-26819
chr16670902966709126E067-26475
chr16670920466709517E067-26084
chr16670956866709768E067-25833
chr16671008266710122E067-25479
chr16671021966710416E067-25185
chr16671138266711422E067-24179
chr16671148366711550E067-24051
chr16671188266712010E067-23591
chr16671205066712329E067-23272
chr16671237866712484E067-23117
chr16671272866712871E067-22730
chr16671351366713745E067-21856
chr16671387466714166E067-21435
chr16671418166714231E067-21370
chr16671450966714816E067-20785
chr16671895866719395E067-16206
chr16671955966719636E067-15965
chr16671967366719723E067-15878
chr16671998166720031E067-15570
chr16672010166720173E067-15428
chr16672283966723222E067-12379
chr16672984566729930E067-5671
chr16673019966730249E067-5352
chr16673046566730713E067-4888
chr16673081066730883E067-4718
chr16673141266731701E067-3900
chr16673207766732768E067-2833
chr16673302866733126E067-2475
chr16673320466733279E067-2322
chr16673331766733662E067-1939
chr16673376166733858E067-1743
chr16673534566735519E067-82
chr16673593966735999E067338
chr16673613366736443E067532
chr16673656066738119E067959
chr16673816066738250E0672559
chr16673836266738412E0672761
chr16674082166741147E0675220
chr16674125366741499E0675652
chr16674163466741698E0676033
chr16674181566742212E0676214
chr16674230866742449E0676707
chr16674362166743693E0678020
chr16674379066743862E0678189
chr16674388966744745E0678288
chr16674544166745633E0679840
chr16674627566746447E06710674
chr16674656566746685E06710964
chr16674673066746781E06711129
chr16674761566749328E06712014
chr16674933866749841E06713737
chr16675657766756695E06720976
chr16675745566757765E06721854
chr16675806366758145E06722462
chr16675833766758597E06722736
chr16675859966758972E06722998
chr16676215366762333E06726552
chr16676271166762793E06727110
chr16676280266762896E06727201
chr16676380166763978E06728200
chr16676423166764514E06728630
chr16677692066777068E06741319
chr16677729166777449E06741690
chr16677784266778393E06742241
chr16678220266783152E06746601
chr16668947466689563E068-46038
chr16669437066694444E068-41157
chr16669687966697307E068-38294
chr16669751666697584E068-38017
chr16669783766697971E068-37630
chr16670375966704045E068-31556
chr16670565766705778E068-29823
chr16670674966706920E068-28681
chr16670770066707740E068-27861
chr16670825766708782E068-26819
chr16670902966709126E068-26475
chr16670920466709517E068-26084
chr16670956866709768E068-25833
chr16671008266710122E068-25479
chr16671021966710416E068-25185
chr16671138266711422E068-24179
chr16671148366711550E068-24051
chr16671188266712010E068-23591
chr16671205066712329E068-23272
chr16671237866712484E068-23117
chr16671272866712871E068-22730
chr16671351366713745E068-21856
chr16671387466714166E068-21435
chr16671418166714231E068-21370
chr16671450966714816E068-20785
chr16671625066716558E068-19043
chr16671724166717295E068-18306
chr16671729966717572E068-18029
chr16671998166720031E068-15570
chr16672010166720173E068-15428
chr16672026166720374E068-15227
chr16672242966722558E068-13043
chr16672634366726452E068-9149
chr16672666266726730E068-8871
chr16673019966730249E068-5352
chr16673046566730713E068-4888
chr16673081066730883E068-4718
chr16673113566731263E068-4338
chr16673141266731701E068-3900
chr16673207766732768E068-2833
chr16673302866733126E068-2475
chr16673320466733279E068-2322
chr16673331766733662E068-1939
chr16673494466735067E068-534
chr16673511566735176E068-425
chr16673534566735519E068-82
chr16673593966735999E068338
chr16673613366736443E068532
chr16673656066738119E068959
chr16673816066738250E0682559
chr16673836266738412E0682761
chr16674039366740682E0684792
chr16674082166741147E0685220
chr16674125366741499E0685652
chr16674163466741698E0686033
chr16674181566742212E0686214
chr16674230866742449E0686707
chr16674362166743693E0688020
chr16674379066743862E0688189
chr16674544166745633E0689840
chr16674627566746447E06810674
chr16674656566746685E06810964
chr16674673066746781E06811129
chr16674761566749328E06812014
chr16674933866749841E06813737
chr16675657766756695E06820976
chr16675689666757133E06821295
chr16675806366758145E06822462
chr16675833766758597E06822736
chr16675859966758972E06822998
chr16676046766760959E06824866
chr16676153766761603E06825936
chr16676164266761739E06826041
chr16676215366762333E06826552
chr16676621766766528E06830616
chr16676663866767222E06831037
chr16676762466767733E06832023
chr16676813166768197E06832530
chr16677241866772543E06836817
chr16677377866773872E06838177
chr16677784266778393E06842241
chr16677840366778505E06842802
chr16677913766779427E06843536
chr16678144966781642E06845848
chr16678195766782009E06846356
chr16678220266783152E06846601
chr16668947466689563E069-46038
chr16669687966697307E069-38294
chr16669751666697584E069-38017
chr16669783766697971E069-37630
chr16670666366706747E069-28854
chr16670674966706920E069-28681
chr16670770066707740E069-27861
chr16670825766708782E069-26819
chr16670902966709126E069-26475
chr16670920466709517E069-26084
chr16670956866709768E069-25833
chr16671008266710122E069-25479
chr16671021966710416E069-25185
chr16671138266711422E069-24179
chr16671148366711550E069-24051
chr16671188266712010E069-23591
chr16671205066712329E069-23272
chr16671237866712484E069-23117
chr16671272866712871E069-22730
chr16671351366713745E069-21856
chr16671387466714166E069-21435
chr16671418166714231E069-21370
chr16671450966714816E069-20785
chr16671955966719636E069-15965
chr16671967366719723E069-15878
chr16671998166720031E069-15570
chr16672010166720173E069-15428
chr16672026166720374E069-15227
chr16672634366726452E069-9149
chr16672666266726730E069-8871
chr16673019966730249E069-5352
chr16673046566730713E069-4888
chr16673141266731701E069-3900
chr16673207766732768E069-2833
chr16673302866733126E069-2475
chr16673320466733279E069-2322
chr16673331766733662E069-1939
chr16673376166733858E069-1743
chr16673494466735067E069-534
chr16673511566735176E069-425
chr16673534566735519E069-82
chr16673593966735999E069338
chr16673613366736443E069532
chr16673656066738119E069959
chr16673816066738250E0692559
chr16673836266738412E0692761
chr16673850166738551E0692900
chr16673886066739032E0693259
chr16674022866740373E0694627
chr16674039366740682E0694792
chr16674082166741147E0695220
chr16674125366741499E0695652
chr16674163466741698E0696033
chr16674181566742212E0696214
chr16674230866742449E0696707
chr16674362166743693E0698020
chr16674379066743862E0698189
chr16674544166745633E0699840
chr16674627566746447E06910674
chr16674656566746685E06910964
chr16674673066746781E06911129
chr16674761566749328E06912014
chr16674933866749841E06913737
chr16675022566750287E06914624
chr16675657766756695E06920976
chr16675689666757133E06921295
chr16675833766758597E06922736
chr16675859966758972E06922998
chr16676153766761603E06925936
chr16676164266761739E06926041
chr16676215366762333E06926552
chr16676271166762793E06927110
chr16676280266762896E06927201
chr16676380166763978E06928200
chr16676423166764514E06928630
chr16676621766766528E06930616
chr16676663866767222E06931037
chr16676762466767733E06932023
chr16676813166768197E06932530
chr16676946766769577E06933866
chr16677241866772543E06936817
chr16677377866773872E06938177
chr16677913766779427E06943536
chr16678144966781642E06945848
chr16678195766782009E06946356
chr16678220266783152E06946601
chr16671021966710416E070-25185
chr16671138266711422E070-24179
chr16671148366711550E070-24051
chr16671188266712010E070-23591
chr16671205066712329E070-23272
chr16671237866712484E070-23117
chr16671272866712871E070-22730
chr16673320466733279E070-2322
chr16673331766733662E070-1939
chr16673376166733858E070-1743
chr16673593966735999E070338
chr16673613366736443E070532
chr16673656066738119E070959
chr16674388966744745E0708288
chr16675657766756695E07020976
chr16675806366758145E07022462
chr16668947466689563E071-46038
chr16669687966697307E071-38294
chr16669751666697584E071-38017
chr16669783766697971E071-37630
chr16670375966704045E071-31556
chr16670565766705778E071-29823
chr16670666366706747E071-28854
chr16670674966706920E071-28681
chr16670770066707740E071-27861
chr16670825766708782E071-26819
chr16670902966709126E071-26475
chr16671008266710122E071-25479
chr16671138266711422E071-24179
chr16671148366711550E071-24051
chr16671188266712010E071-23591
chr16671205066712329E071-23272
chr16671237866712484E071-23117
chr16671272866712871E071-22730
chr16671387466714166E071-21435
chr16671418166714231E071-21370
chr16671450966714816E071-20785
chr16671625066716558E071-19043
chr16671724166717295E071-18306
chr16671729966717572E071-18029
chr16671955966719636E071-15965
chr16671967366719723E071-15878
chr16671998166720031E071-15570
chr16672010166720173E071-15428
chr16672026166720374E071-15227
chr16672161566721665E071-13936
chr16672173866721824E071-13777
chr16672242966722558E071-13043
chr16672283966723222E071-12379
chr16672420666724377E071-11224
chr16672451766724669E071-10932
chr16672704266727522E071-8079
chr16672757266727770E071-7831
chr16672783866728373E071-7228
chr16672925766729323E071-6278
chr16672947166729745E071-5856
chr16672984566729930E071-5671
chr16673019966730249E071-5352
chr16673046566730713E071-4888
chr16673081066730883E071-4718
chr16673113566731263E071-4338
chr16673141266731701E071-3900
chr16673207766732768E071-2833
chr16673302866733126E071-2475
chr16673320466733279E071-2322
chr16673331766733662E071-1939
chr16673376166733858E071-1743
chr16673494466735067E071-534
chr16673511566735176E071-425
chr16673534566735519E071-82
chr16673593966735999E071338
chr16673613366736443E071532
chr16673656066738119E071959
chr16673816066738250E0712559
chr16673836266738412E0712761
chr16673850166738551E0712900
chr16673886066739032E0713259
chr16673953966739652E0713938
chr16674022866740373E0714627
chr16674039366740682E0714792
chr16674082166741147E0715220
chr16674125366741499E0715652
chr16674163466741698E0716033
chr16674181566742212E0716214
chr16674230866742449E0716707
chr16674362166743693E0718020
chr16674379066743862E0718189
chr16674388966744745E0718288
chr16674544166745633E0719840
chr16674627566746447E07110674
chr16674656566746685E07110964
chr16674673066746781E07111129
chr16674761566749328E07112014
chr16674933866749841E07113737
chr16675657766756695E07120976
chr16675689666757133E07121295
chr16675727366757432E07121672
chr16675745566757765E07121854
chr16675806366758145E07122462
chr16675833766758597E07122736
chr16675859966758972E07122998
chr16676153766761603E07125936
chr16676164266761739E07126041
chr16676215366762333E07126552
chr16676271166762793E07127110
chr16676280266762896E07127201
chr16676380166763978E07128200
chr16676621766766528E07130616
chr16676663866767222E07131037
chr16676762466767733E07132023
chr16676813166768197E07132530
chr16677241866772543E07136817
chr16677692066777068E07141319
chr16677729166777449E07141690
chr16677913766779427E07143536
chr16678056266780612E07144961
chr16678066766780736E07145066
chr16678144966781642E07145848
chr16678195766782009E07146356
chr16678220266783152E07146601
chr16678548366785596E07149882
chr16668947466689563E072-46038
chr16669751666697584E072-38017
chr16669783766697971E072-37630
chr16670565766705778E072-29823
chr16670666366706747E072-28854
chr16670674966706920E072-28681
chr16670770066707740E072-27861
chr16670825766708782E072-26819
chr16670902966709126E072-26475
chr16670920466709517E072-26084
chr16670956866709768E072-25833
chr16671008266710122E072-25479
chr16671021966710416E072-25185
chr16671138266711422E072-24179
chr16671148366711550E072-24051
chr16671188266712010E072-23591
chr16671205066712329E072-23272
chr16671237866712484E072-23117
chr16671272866712871E072-22730
chr16671351366713745E072-21856
chr16671387466714166E072-21435
chr16671450966714816E072-20785
chr16672783866728373E072-7228
chr16672947166729745E072-5856
chr16672984566729930E072-5671
chr16673019966730249E072-5352
chr16673046566730713E072-4888
chr16673141266731701E072-3900
chr16673302866733126E072-2475
chr16673320466733279E072-2322
chr16673331766733662E072-1939
chr16673613366736443E072532
chr16674082166741147E0725220
chr16674125366741499E0725652
chr16674163466741698E0726033
chr16674181566742212E0726214
chr16674230866742449E0726707
chr16674362166743693E0728020
chr16674379066743862E0728189
chr16674544166745633E0729840
chr16674627566746447E07210674
chr16674656566746685E07210964
chr16674673066746781E07211129
chr16674761566749328E07212014
chr16674933866749841E07213737
chr16675022566750287E07214624
chr16675657766756695E07220976
chr16675689666757133E07221295
chr16675727366757432E07221672
chr16675745566757765E07221854
chr16675806366758145E07222462
chr16675833766758597E07222736
chr16675859966758972E07222998
chr16675940166759535E07223800
chr16676046766760959E07224866
chr16676153766761603E07225936
chr16676164266761739E07226041
chr16676215366762333E07226552
chr16676271166762793E07227110
chr16676621766766528E07230616
chr16676663866767222E07231037
chr16676762466767733E07232023
chr16676813166768197E07232530
chr16677241866772543E07236817
chr16677913766779427E07243536
chr16678056266780612E07244961
chr16678220266783152E07246601
chr16678548366785596E07249882
chr16670375966704045E073-31556
chr16670666366706747E073-28854
chr16670674966706920E073-28681
chr16670770066707740E073-27861
chr16670825766708782E073-26819
chr16670902966709126E073-26475
chr16670920466709517E073-26084
chr16670956866709768E073-25833
chr16671008266710122E073-25479
chr16671021966710416E073-25185
chr16671138266711422E073-24179
chr16671148366711550E073-24051
chr16671188266712010E073-23591
chr16671205066712329E073-23272
chr16671237866712484E073-23117
chr16671351366713745E073-21856
chr16671387466714166E073-21435
chr16671418166714231E073-21370
chr16671450966714816E073-20785
chr16673081066730883E073-4718
chr16673113566731263E073-4338
chr16673141266731701E073-3900
chr16673207766732768E073-2833
chr16673593966735999E073338
chr16673613366736443E073532
chr16673656066738119E073959
chr16673816066738250E0732559
chr16673836266738412E0732761
chr16674039366740682E0734792
chr16674082166741147E0735220
chr16674125366741499E0735652
chr16674163466741698E0736033
chr16674181566742212E0736214
chr16674230866742449E0736707
chr16674362166743693E0738020
chr16674379066743862E0738189
chr16674388966744745E0738288
chr16674544166745633E0739840
chr16674627566746447E07310674
chr16674656566746685E07310964
chr16674673066746781E07311129
chr16674761566749328E07312014
chr16675022566750287E07314624
chr16676153766761603E07325936
chr16676164266761739E07326041
chr16676621766766528E07330616
chr16676663866767222E07331037
chr16676762466767733E07332023
chr16678195766782009E07346356
chr16678220266783152E07346601
chr16669221166692297E074-43304
chr16669657766696654E074-38947
chr16669687966697307E074-38294
chr16669751666697584E074-38017
chr16669783766697971E074-37630
chr16670375966704045E074-31556
chr16670565766705778E074-29823
chr16670666366706747E074-28854
chr16670674966706920E074-28681
chr16670770066707740E074-27861
chr16670825766708782E074-26819
chr16670902966709126E074-26475
chr16671008266710122E074-25479
chr16671021966710416E074-25185
chr16671138266711422E074-24179
chr16671148366711550E074-24051
chr16671188266712010E074-23591
chr16671205066712329E074-23272
chr16671237866712484E074-23117
chr16671272866712871E074-22730
chr16671351366713745E074-21856
chr16671387466714166E074-21435
chr16671418166714231E074-21370
chr16671450966714816E074-20785
chr16671724166717295E074-18306
chr16671729966717572E074-18029
chr16671895866719395E074-16206
chr16671955966719636E074-15965
chr16671967366719723E074-15878
chr16672161566721665E074-13936
chr16672173866721824E074-13777
chr16672242966722558E074-13043
chr16672704266727522E074-8079
chr16672757266727770E074-7831
chr16672783866728373E074-7228
chr16672925766729323E074-6278
chr16672947166729745E074-5856
chr16672984566729930E074-5671
chr16673019966730249E074-5352
chr16673046566730713E074-4888
chr16673081066730883E074-4718
chr16673113566731263E074-4338
chr16673141266731701E074-3900
chr16673207766732768E074-2833
chr16673302866733126E074-2475
chr16673320466733279E074-2322
chr16673494466735067E074-534
chr16673511566735176E074-425
chr16673534566735519E074-82
chr16673593966735999E074338
chr16673613366736443E074532
chr16673656066738119E074959
chr16673816066738250E0742559
chr16673836266738412E0742761
chr16673850166738551E0742900
chr16673886066739032E0743259
chr16673953966739652E0743938
chr16674022866740373E0744627
chr16674039366740682E0744792
chr16674082166741147E0745220
chr16674125366741499E0745652
chr16674163466741698E0746033
chr16674181566742212E0746214
chr16674230866742449E0746707
chr16674362166743693E0748020
chr16674379066743862E0748189
chr16674544166745633E0749840
chr16674627566746447E07410674
chr16674656566746685E07410964
chr16674673066746781E07411129
chr16674761566749328E07412014
chr16674933866749841E07413737
chr16675022566750287E07414624
chr16675053266750646E07414931
chr16675657766756695E07420976
chr16675689666757133E07421295
chr16675727366757432E07421672
chr16675745566757765E07421854
chr16675806366758145E07422462
chr16675833766758597E07422736
chr16675859966758972E07422998
chr16676046766760959E07424866
chr16676153766761603E07425936
chr16676164266761739E07426041
chr16676215366762333E07426552
chr16676271166762793E07427110
chr16676280266762896E07427201
chr16676621766766528E07430616
chr16676663866767222E07431037
chr16676762466767733E07432023
chr16676813166768197E07432530
chr16676851066768928E07432909
chr16677241866772543E07436817
chr16677692066777068E07441319
chr16677729166777449E07441690
chr16677784266778393E07442241
chr16677840366778505E07442802
chr16677913766779427E07443536
chr16678056266780612E07444961
chr16678144966781642E07445848
chr16678195766782009E07446356
chr16678220266783152E07446601
chr16678548366785596E07449882
chr16674388966744745E0818288
chr16673656066738119E082959
chr16674379066743862E0828189
chr16674388966744745E0828288