| Sequence Name | Change(s) |
|---|---|
| GRCh38.p7 chr 6 | NC_000006.12:g.148560592G>A |
| GRCh37.p13 chr 6 | NC_000006.11:g.148881728G>A |
| Study | Population | Group | Sample # | Ref Allele | Alt Allele |
|---|---|---|---|---|---|
| 1000Genomes | African | Sub | 1322 | G=0.949 | A=0.051 |
| 1000Genomes | American | Sub | 694 | G=0.900 | A=0.100 |
| 1000Genomes | East Asian | Sub | 1008 | G=0.958 | A=0.042 |
| 1000Genomes | Europe | Sub | 1006 | G=0.819 | A=0.181 |
| 1000Genomes | Global | Study-wide | 5008 | G=0.918 | A=0.082 |
| 1000Genomes | South Asian | Sub | 978 | G=0.950 | A=0.050 |
| The Avon Longitudinal Study of Parents and Children | PARENT AND CHILD COHORT | Study-wide | 3854 | G=0.798 | A=0.202 |
| The Genome Aggregation Database | African | Sub | 8702 | G=0.933 | A=0.067 |
| The Genome Aggregation Database | American | Sub | 838 | G=0.910 | A=0.090 |
| The Genome Aggregation Database | East Asian | Sub | 1620 | G=0.963 | A=0.037 |
| The Genome Aggregation Database | Europe | Sub | 18450 | G=0.820 | A=0.179 |
| The Genome Aggregation Database | Global | Study-wide | 29912 | G=0.863 | A=0.136 |
| The Genome Aggregation Database | Other | Sub | 302 | G=0.870 | A=0.130 |
| Trans-Omics for Precision Medicine | Global | Study-wide | 29118 | G=0.868 | A=0.131 |
| UK 10K study - Twins | TWIN COHORT | Study-wide | 3708 | G=0.796 | A=0.204 |
| PMID | Title | Author | Journal |
|---|---|---|---|
| 29071344 | Genetic Risk Variants Associated With Comorbid Alcohol Dependence and Major Depression. | Zhou H | JAMA Psychiatry |
| SNP ID | p-value | Traits | Study |
|---|---|---|---|
| rs73017046 | 6E-06 | alcohol dependence | 29071344 |
| Position (v37) | eGene | GeneID | Variant | p-value | TSS | Tissue | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| There is no eQTL annotation for this SNP | |||||||
| Probe ID | Position | Gene | beta | p-value | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| There is no meQTL annotation for this SNP | |||||||
There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.
| Chromosome | Start | End | Region | Distance ( -/+ : Up/Downstream ) |
|---|---|---|---|---|
| chr6 | 148833868 | 148834049 | E067 | -47679 |
| chr6 | 148834053 | 148834152 | E067 | -47576 |
| chr6 | 148835645 | 148835821 | E067 | -45907 |
| chr6 | 148836022 | 148836089 | E067 | -45639 |
| chr6 | 148836111 | 148836195 | E067 | -45533 |
| chr6 | 148836598 | 148836672 | E067 | -45056 |
| chr6 | 148836935 | 148836985 | E067 | -44743 |
| chr6 | 148836994 | 148837083 | E067 | -44645 |
| chr6 | 148837291 | 148837724 | E067 | -44004 |
| chr6 | 148837824 | 148837996 | E067 | -43732 |
| chr6 | 148838192 | 148838252 | E067 | -43476 |
| chr6 | 148838381 | 148838582 | E067 | -43146 |
| chr6 | 148838588 | 148839062 | E067 | -42666 |
| chr6 | 148839235 | 148840895 | E067 | -40833 |
| chr6 | 148841364 | 148841701 | E067 | -40027 |
| chr6 | 148841750 | 148842017 | E067 | -39711 |
| chr6 | 148842114 | 148842193 | E067 | -39535 |
| chr6 | 148842324 | 148843412 | E067 | -38316 |
| chr6 | 148843783 | 148843833 | E067 | -37895 |
| chr6 | 148843920 | 148844023 | E067 | -37705 |
| chr6 | 148844077 | 148844127 | E067 | -37601 |
| chr6 | 148844247 | 148844518 | E067 | -37210 |
| chr6 | 148844675 | 148845037 | E067 | -36691 |
| chr6 | 148845697 | 148846934 | E067 | -34794 |
| chr6 | 148848456 | 148848506 | E067 | -33222 |
| chr6 | 148848724 | 148848827 | E067 | -32901 |
| chr6 | 148848906 | 148849005 | E067 | -32723 |
| chr6 | 148849123 | 148849173 | E067 | -32555 |
| chr6 | 148849447 | 148849748 | E067 | -31980 |
| chr6 | 148850210 | 148850250 | E067 | -31478 |
| chr6 | 148850323 | 148850478 | E067 | -31250 |
| chr6 | 148850627 | 148850697 | E067 | -31031 |
| chr6 | 148850753 | 148850803 | E067 | -30925 |
| chr6 | 148850972 | 148851022 | E067 | -30706 |
| chr6 | 148851328 | 148852398 | E067 | -29330 |
| chr6 | 148852490 | 148852795 | E067 | -28933 |
| chr6 | 148852997 | 148853051 | E067 | -28677 |
| chr6 | 148855369 | 148855477 | E067 | -26251 |
| chr6 | 148855523 | 148855591 | E067 | -26137 |
| chr6 | 148855870 | 148855954 | E067 | -25774 |
| chr6 | 148856170 | 148856214 | E067 | -25514 |
| chr6 | 148856215 | 148856277 | E067 | -25451 |
| chr6 | 148856368 | 148856408 | E067 | -25320 |
| chr6 | 148856454 | 148856572 | E067 | -25156 |
| chr6 | 148856830 | 148857529 | E067 | -24199 |
| chr6 | 148857802 | 148857848 | E067 | -23880 |
| chr6 | 148857898 | 148857974 | E067 | -23754 |
| chr6 | 148858232 | 148858312 | E067 | -23416 |
| chr6 | 148858384 | 148858519 | E067 | -23209 |
| chr6 | 148858674 | 148858740 | E067 | -22988 |
| chr6 | 148859001 | 148859108 | E067 | -22620 |
| chr6 | 148859116 | 148859285 | E067 | -22443 |
| chr6 | 148859335 | 148860289 | E067 | -21439 |
| chr6 | 148863866 | 148864584 | E067 | -17144 |
| chr6 | 148868304 | 148868628 | E067 | -13100 |
| chr6 | 148868845 | 148868925 | E067 | -12803 |
| chr6 | 148869042 | 148870214 | E067 | -11514 |
| chr6 | 148870249 | 148870561 | E067 | -11167 |
| chr6 | 148872027 | 148872221 | E067 | -9507 |
| chr6 | 148880209 | 148880647 | E067 | -1081 |
| chr6 | 148881729 | 148881919 | E067 | 1 |
| chr6 | 148887119 | 148888208 | E067 | 5391 |
| chr6 | 148833868 | 148834049 | E068 | -47679 |
| chr6 | 148834053 | 148834152 | E068 | -47576 |
| chr6 | 148835645 | 148835821 | E068 | -45907 |
| chr6 | 148836022 | 148836089 | E068 | -45639 |
| chr6 | 148836111 | 148836195 | E068 | -45533 |
| chr6 | 148836935 | 148836985 | E068 | -44743 |
| chr6 | 148836994 | 148837083 | E068 | -44645 |
| chr6 | 148837291 | 148837724 | E068 | -44004 |
| chr6 | 148837824 | 148837996 | E068 | -43732 |
| chr6 | 148838192 | 148838252 | E068 | -43476 |
| chr6 | 148838381 | 148838582 | E068 | -43146 |
| chr6 | 148838588 | 148839062 | E068 | -42666 |
| chr6 | 148839235 | 148840895 | E068 | -40833 |
| chr6 | 148840931 | 148841252 | E068 | -40476 |
| chr6 | 148841364 | 148841701 | E068 | -40027 |
| chr6 | 148841750 | 148842017 | E068 | -39711 |
| chr6 | 148842114 | 148842193 | E068 | -39535 |
| chr6 | 148842324 | 148843412 | E068 | -38316 |
| chr6 | 148843783 | 148843833 | E068 | -37895 |
| chr6 | 148843920 | 148844023 | E068 | -37705 |
| chr6 | 148844077 | 148844127 | E068 | -37601 |
| chr6 | 148844247 | 148844518 | E068 | -37210 |
| chr6 | 148844675 | 148845037 | E068 | -36691 |
| chr6 | 148845697 | 148846934 | E068 | -34794 |
| chr6 | 148848724 | 148848827 | E068 | -32901 |
| chr6 | 148848906 | 148849005 | E068 | -32723 |
| chr6 | 148849123 | 148849173 | E068 | -32555 |
| chr6 | 148849447 | 148849748 | E068 | -31980 |
| chr6 | 148850210 | 148850250 | E068 | -31478 |
| chr6 | 148850323 | 148850478 | E068 | -31250 |
| chr6 | 148850627 | 148850697 | E068 | -31031 |
| chr6 | 148850753 | 148850803 | E068 | -30925 |
| chr6 | 148851328 | 148852398 | E068 | -29330 |
| chr6 | 148855182 | 148855253 | E068 | -26475 |
| chr6 | 148855369 | 148855477 | E068 | -26251 |
| chr6 | 148855523 | 148855591 | E068 | -26137 |
| chr6 | 148855870 | 148855954 | E068 | -25774 |
| chr6 | 148856170 | 148856214 | E068 | -25514 |
| chr6 | 148856215 | 148856277 | E068 | -25451 |
| chr6 | 148856368 | 148856408 | E068 | -25320 |
| chr6 | 148856454 | 148856572 | E068 | -25156 |
| chr6 | 148856830 | 148857529 | E068 | -24199 |
| chr6 | 148857802 | 148857848 | E068 | -23880 |
| chr6 | 148857898 | 148857974 | E068 | -23754 |
| chr6 | 148858232 | 148858312 | E068 | -23416 |
| chr6 | 148858384 | 148858519 | E068 | -23209 |
| chr6 | 148858674 | 148858740 | E068 | -22988 |
| chr6 | 148858788 | 148858897 | E068 | -22831 |
| chr6 | 148859001 | 148859108 | E068 | -22620 |
| chr6 | 148859116 | 148859285 | E068 | -22443 |
| chr6 | 148859335 | 148860289 | E068 | -21439 |
| chr6 | 148868304 | 148868628 | E068 | -13100 |
| chr6 | 148868845 | 148868925 | E068 | -12803 |
| chr6 | 148869042 | 148870214 | E068 | -11514 |
| chr6 | 148870249 | 148870561 | E068 | -11167 |
| chr6 | 148870683 | 148870765 | E068 | -10963 |
| chr6 | 148871768 | 148871993 | E068 | -9735 |
| chr6 | 148886372 | 148886447 | E068 | 4644 |
| chr6 | 148886575 | 148886994 | E068 | 4847 |
| chr6 | 148887119 | 148888208 | E068 | 5391 |
| chr6 | 148833868 | 148834049 | E069 | -47679 |
| chr6 | 148834053 | 148834152 | E069 | -47576 |
| chr6 | 148835645 | 148835821 | E069 | -45907 |
| chr6 | 148836022 | 148836089 | E069 | -45639 |
| chr6 | 148836111 | 148836195 | E069 | -45533 |
| chr6 | 148836598 | 148836672 | E069 | -45056 |
| chr6 | 148836935 | 148836985 | E069 | -44743 |
| chr6 | 148836994 | 148837083 | E069 | -44645 |
| chr6 | 148837291 | 148837724 | E069 | -44004 |
| chr6 | 148837824 | 148837996 | E069 | -43732 |
| chr6 | 148838192 | 148838252 | E069 | -43476 |
| chr6 | 148838381 | 148838582 | E069 | -43146 |
| chr6 | 148838588 | 148839062 | E069 | -42666 |
| chr6 | 148839235 | 148840895 | E069 | -40833 |
| chr6 | 148840931 | 148841252 | E069 | -40476 |
| chr6 | 148841364 | 148841701 | E069 | -40027 |
| chr6 | 148841750 | 148842017 | E069 | -39711 |
| chr6 | 148842114 | 148842193 | E069 | -39535 |
| chr6 | 148842324 | 148843412 | E069 | -38316 |
| chr6 | 148843783 | 148843833 | E069 | -37895 |
| chr6 | 148843920 | 148844023 | E069 | -37705 |
| chr6 | 148844077 | 148844127 | E069 | -37601 |
| chr6 | 148844247 | 148844518 | E069 | -37210 |
| chr6 | 148844675 | 148845037 | E069 | -36691 |
| chr6 | 148845697 | 148846934 | E069 | -34794 |
| chr6 | 148846963 | 148847049 | E069 | -34679 |
| chr6 | 148847846 | 148848001 | E069 | -33727 |
| chr6 | 148848456 | 148848506 | E069 | -33222 |
| chr6 | 148848724 | 148848827 | E069 | -32901 |
| chr6 | 148848906 | 148849005 | E069 | -32723 |
| chr6 | 148849123 | 148849173 | E069 | -32555 |
| chr6 | 148849447 | 148849748 | E069 | -31980 |
| chr6 | 148850210 | 148850250 | E069 | -31478 |
| chr6 | 148850323 | 148850478 | E069 | -31250 |
| chr6 | 148850627 | 148850697 | E069 | -31031 |
| chr6 | 148850753 | 148850803 | E069 | -30925 |
| chr6 | 148850972 | 148851022 | E069 | -30706 |
| chr6 | 148851328 | 148852398 | E069 | -29330 |
| chr6 | 148852997 | 148853051 | E069 | -28677 |
| chr6 | 148855369 | 148855477 | E069 | -26251 |
| chr6 | 148855523 | 148855591 | E069 | -26137 |
| chr6 | 148855870 | 148855954 | E069 | -25774 |
| chr6 | 148856170 | 148856214 | E069 | -25514 |
| chr6 | 148856215 | 148856277 | E069 | -25451 |
| chr6 | 148856368 | 148856408 | E069 | -25320 |
| chr6 | 148856454 | 148856572 | E069 | -25156 |
| chr6 | 148856830 | 148857529 | E069 | -24199 |
| chr6 | 148857802 | 148857848 | E069 | -23880 |
| chr6 | 148857898 | 148857974 | E069 | -23754 |
| chr6 | 148858232 | 148858312 | E069 | -23416 |
| chr6 | 148858384 | 148858519 | E069 | -23209 |
| chr6 | 148858674 | 148858740 | E069 | -22988 |
| chr6 | 148858788 | 148858897 | E069 | -22831 |
| chr6 | 148859001 | 148859108 | E069 | -22620 |
| chr6 | 148859116 | 148859285 | E069 | -22443 |
| chr6 | 148859335 | 148860289 | E069 | -21439 |
| chr6 | 148863866 | 148864584 | E069 | -17144 |
| chr6 | 148864815 | 148865004 | E069 | -16724 |
| chr6 | 148868304 | 148868628 | E069 | -13100 |
| chr6 | 148868845 | 148868925 | E069 | -12803 |
| chr6 | 148869042 | 148870214 | E069 | -11514 |
| chr6 | 148870249 | 148870561 | E069 | -11167 |
| chr6 | 148870683 | 148870765 | E069 | -10963 |
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| chr6 | 148851328 | 148852398 | E074 | -29330 |
| chr6 | 148852490 | 148852795 | E074 | -28933 |
| chr6 | 148855870 | 148855954 | E074 | -25774 |
| chr6 | 148856170 | 148856214 | E074 | -25514 |
| chr6 | 148856215 | 148856277 | E074 | -25451 |
| chr6 | 148856368 | 148856408 | E074 | -25320 |
| chr6 | 148856454 | 148856572 | E074 | -25156 |
| chr6 | 148856830 | 148857529 | E074 | -24199 |
| chr6 | 148857802 | 148857848 | E074 | -23880 |
| chr6 | 148857898 | 148857974 | E074 | -23754 |
| chr6 | 148858232 | 148858312 | E074 | -23416 |
| chr6 | 148858384 | 148858519 | E074 | -23209 |
| chr6 | 148858674 | 148858740 | E074 | -22988 |
| chr6 | 148858788 | 148858897 | E074 | -22831 |
| chr6 | 148859001 | 148859108 | E074 | -22620 |
| chr6 | 148859116 | 148859285 | E074 | -22443 |
| chr6 | 148863866 | 148864584 | E074 | -17144 |
| chr6 | 148868105 | 148868161 | E074 | -13567 |
| chr6 | 148868304 | 148868628 | E074 | -13100 |
| chr6 | 148868845 | 148868925 | E074 | -12803 |
| chr6 | 148869042 | 148870214 | E074 | -11514 |
| chr6 | 148870249 | 148870561 | E074 | -11167 |
| chr6 | 148870683 | 148870765 | E074 | -10963 |
| chr6 | 148872411 | 148872498 | E074 | -9230 |
| chr6 | 148881729 | 148881919 | E074 | 1 |
| chr6 | 148886575 | 148886994 | E074 | 4847 |
| chr6 | 148887119 | 148888208 | E074 | 5391 |
| chr6 | 148836598 | 148836672 | E081 | -45056 |
| chr6 | 148836935 | 148836985 | E081 | -44743 |
| chr6 | 148836994 | 148837083 | E081 | -44645 |
| chr6 | 148837291 | 148837724 | E081 | -44004 |
| chr6 | 148837824 | 148837996 | E081 | -43732 |
| chr6 | 148838192 | 148838252 | E081 | -43476 |
| chr6 | 148838381 | 148838582 | E081 | -43146 |
| chr6 | 148838588 | 148839062 | E081 | -42666 |
| chr6 | 148839235 | 148840895 | E081 | -40833 |
| chr6 | 148840931 | 148841252 | E081 | -40476 |
| chr6 | 148841364 | 148841701 | E081 | -40027 |
| chr6 | 148851328 | 148852398 | E081 | -29330 |
| chr6 | 148837291 | 148837724 | E082 | -44004 |
| chr6 | 148837824 | 148837996 | E082 | -43732 |
| chr6 | 148838192 | 148838252 | E082 | -43476 |
| chr6 | 148838381 | 148838582 | E082 | -43146 |
| Chromosome | Start | End | Region | Distance(-/+:Up/Downstream) |
|---|---|---|---|---|
| chr6 | 148880729 | 148881707 | E068 | -21 |
| chr6 | 148880729 | 148881707 | E069 | -21 |
| chr6 | 148880729 | 148881707 | E072 | -21 |
| chr6 | 148880729 | 148881707 | E074 | -21 |
| chr6 | 148880729 | 148881707 | E082 | -21 |