rs9448894

Organism: Homo sapiens

Alleles: G>A / G>T

Gene : Feature

BCKDHB : Intron Variant

p-value: Check p-value

Variation Type: SNV (Single Nucleotide Variation)

Frequency:

T=0398 (11610/29118,TOPMED)
T=0435 (12334/28318,GnomAD)
G==0482 (2412/5008,1000G)

Position: chr6:80127536 (GRCh38.p7) (6q14.1)

Phenotype: AD

Dataset:

GWASdb2

Publications: 3 publication(s)

Genomic View: See rs on genome

Enhancer: 616 Enhancers around

Promoter: 42 Promoters around

Variant Details Frequency Publications p-values eSNP meSNP

Genomic Coordinates

Sequence Name	Change(s)
GRCh38.p7 chr 6	NC_000006.12:g.80127536G>A
GRCh38.p7 chr 6	NC_000006.12:g.80127536G>T
GRCh37.p13 chr 6	NC_000006.11:g.80837253G>A
GRCh37.p13 chr 6	NC_000006.11:g.80837253G>T
BCKDHB RefSeqGene	NG_009775.1:g.25910G>A
BCKDHB RefSeqGene	NG_009775.1:g.25910G>T

Gene: BCKDHB, branched chain keto acid dehydrogenase E1, beta polypeptide(plus strand)

Molecule type	Change	Amino acid[Codon]	SO Term
BCKDHB transcript variant 2	NM_000056.4:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant 3	NM_001318975.1:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant 1	NM_183050.3:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant 4	NR_134945.1:n.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X2	XM_005248756.4:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X5	XM_011536023.2:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X7	XM_011536024.2:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X8	XM_011536025.2:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X9	XM_011536026.2:c.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X1	XR_001743546.1:n.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X3	XR_001743547.1:n.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X4	XR_001743548.1:n.	N/A	Intron Variant
BCKDHB transcript variant X6	XR_001743549.1:n.	N/A	Intron Variant

Population Frequency

Study	Population	Group	Sample #	Ref Allele	Alt Allele
1000Genomes	African	Sub	1322	G=0.822	T=0.178
1000Genomes	American	Sub	694	G=0.350	T=0.650
1000Genomes	East Asian	Sub	1008	G=0.305	T=0.695
1000Genomes	Europe	Sub	1006	G=0.487	T=0.513
1000Genomes	Global	Study-wide	5008	G=0.482	T=0.518
1000Genomes	South Asian	Sub	978	G=0.290	T=0.710
The Genome Aggregation Database	African	Sub	8232	G=0.765	T=0.235
The Genome Aggregation Database	American	Sub	786	G=0.350	T=0.650
The Genome Aggregation Database	East Asian	Sub	1602	G=0.303	T=0.697
The Genome Aggregation Database	Europe	Sub	17406	G=0.505	T=0.494
The Genome Aggregation Database	Global	Study-wide	28318	G=0.564	T=0.435
The Genome Aggregation Database	Other	Sub	292	G=0.450	T=0.550
Trans-Omics for Precision Medicine	Global	Study-wide	29118	G=0.601	T=0.398

PMID	Title	Author	Journal
20201924	Genome-wide association study of alcohol dependence implicates a region on chromosome 11.	Edenberg HJ	Alcohol Clin Exp Res
23757202	Free the data: one laboratory's approach to knowledge-based genomic variant classification and preparation for EMR integration of genomic data.	Bean LJ	Hum Mutat
25741868	Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology.	Richards S	Genet Med

P-Value

SNP ID	p-value	Traits	Study
rs9448894	0.000071	alcohol dependence	20201924
rs9448894	0.0000714	alcoholism	pha002893
rs9448894	0.0000728	alcoholism	pha002892
rs9448894	0.000073	alcohol dependence(early age of onset)	20201924

eQTL of rs9448894 in Brain tissues (GTEx Analysis Release V7)

Position (v37)	eGene	GeneID	Variant	p-value	TSS	Tissue
There is no eQTL annotation for this SNP

meQTL of rs9448894 in Fetal Brain

Probe ID	Position	Gene	beta	p-value
There is no meQTL annotation for this SNP

Genomic View

Chromatin Interaction

There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.

Enhancer Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome	Start	End	Region	Distance ( -/+ : Up/Downstream )
chr6	56532327	56532400	E067	-46553
chr6	56532957	56533315	E067	-45638
chr6	56535637	56535721	E067	-43232
chr6	56535972	56536079	E067	-42874
chr6	56536084	56536409	E067	-42544
chr6	56537452	56537575	E067	-41378
chr6	56547407	56547613	E067	-31340
chr6	56548253	56548343	E067	-30610
chr6	56548372	56548479	E067	-30474
chr6	56548572	56549119	E067	-29834
chr6	56549255	56549652	E067	-29301
chr6	56549894	56549944	E067	-29009
chr6	56550281	56550335	E067	-28618
chr6	56550557	56550607	E067	-28346
chr6	56550628	56550689	E067	-28264
chr6	56550943	56551068	E067	-27885
chr6	56551786	56551853	E067	-27100
chr6	56553396	56553618	E067	-25335
chr6	56553769	56553961	E067	-24992
chr6	56563436	56563515	E067	-15438
chr6	56563831	56563892	E067	-15061
chr6	56563932	56564110	E067	-14843
chr6	56571935	56571985	E067	-6968
chr6	56572241	56572529	E067	-6424
chr6	56573266	56573421	E067	-5532
chr6	56573434	56574181	E067	-4772
chr6	56574446	56574496	E067	-4457
chr6	56574597	56574697	E067	-4256
chr6	56574720	56574776	E067	-4177
chr6	56575046	56575100	E067	-3853
chr6	56577773	56577929	E067	-1024
chr6	56578061	56578523	E067	-430
chr6	56578540	56578746	E067	-207
chr6	56579163	56579582	E067	210
chr6	56579615	56580529	E067	662
chr6	56580698	56580831	E067	1745
chr6	56581023	56581073	E067	2070
chr6	56581137	56581505	E067	2184
chr6	56589301	56589586	E067	10348
chr6	56589828	56589917	E067	10875
chr6	56590096	56590345	E067	11143
chr6	56595500	56596026	E067	16547
chr6	56596038	56596163	E067	17085
chr6	56596328	56596382	E067	17375
chr6	56597243	56597287	E067	18290
chr6	56597462	56597512	E067	18509
chr6	56597594	56597759	E067	18641
chr6	56598125	56598373	E067	19172
chr6	56604529	56604686	E067	25576
chr6	56605240	56605360	E067	26287
chr6	56605391	56605580	E067	26438
chr6	56606250	56606601	E067	27297
chr6	56607415	56607585	E067	28462
chr6	56607967	56608050	E067	29014
chr6	56609358	56609431	E067	30405
chr6	56609482	56609604	E067	30529
chr6	56609899	56610218	E067	30946
chr6	56611654	56611811	E067	32701
chr6	56611853	56612253	E067	32900
chr6	56614360	56614942	E067	35407
chr6	56615472	56615659	E067	36519
chr6	56615686	56615786	E067	36733
chr6	56617161	56617285	E067	38208
chr6	56617377	56617559	E067	38424
chr6	56618016	56618066	E067	39063
chr6	56618068	56618118	E067	39115
chr6	56618163	56618232	E067	39210
chr6	56618507	56618563	E067	39554
chr6	56618623	56618778	E067	39670
chr6	56618821	56618961	E067	39868
chr6	56619264	56619456	E067	40311
chr6	56619988	56620088	E067	41035
chr6	56620117	56620167	E067	41164
chr6	56620298	56620395	E067	41345
chr6	56620717	56620761	E067	41764
chr6	56620764	56620882	E067	41811
chr6	56620925	56621002	E067	41972
chr6	56621072	56621518	E067	42119
chr6	56621699	56622372	E067	42746
chr6	56622412	56622745	E067	43459
chr6	56622989	56623207	E067	44036
chr6	56623355	56623454	E067	44402
chr6	56623466	56623527	E067	44513
chr6	56623576	56623628	E067	44623
chr6	56623660	56623871	E067	44707
chr6	56624149	56624259	E067	45196
chr6	56624433	56624645	E067	45480
chr6	56532327	56532400	E068	-46553
chr6	56532957	56533315	E068	-45638
chr6	56534474	56534572	E068	-44381
chr6	56534590	56535169	E068	-43784
chr6	56535225	56535281	E068	-43672
chr6	56535637	56535721	E068	-43232
chr6	56535972	56536079	E068	-42874
chr6	56536084	56536409	E068	-42544
chr6	56536433	56537299	E068	-41654
chr6	56537452	56537575	E068	-41378
chr6	56538245	56538344	E068	-40609
chr6	56545448	56545498	E068	-33455
chr6	56547407	56547613	E068	-31340
chr6	56548253	56548343	E068	-30610
chr6	56548372	56548479	E068	-30474
chr6	56548572	56549119	E068	-29834
chr6	56549255	56549652	E068	-29301
chr6	56549894	56549944	E068	-29009
chr6	56550281	56550335	E068	-28618
chr6	56550557	56550607	E068	-28346
chr6	56550628	56550689	E068	-28264
chr6	56550943	56551068	E068	-27885
chr6	56551786	56551853	E068	-27100
chr6	56552312	56552656	E068	-26297
chr6	56571935	56571985	E068	-6968
chr6	56572241	56572529	E068	-6424
chr6	56573266	56573421	E068	-5532
chr6	56573434	56574181	E068	-4772
chr6	56574446	56574496	E068	-4457
chr6	56574597	56574697	E068	-4256
chr6	56574720	56574776	E068	-4177
chr6	56575046	56575100	E068	-3853
chr6	56577773	56577929	E068	-1024
chr6	56578061	56578523	E068	-430
chr6	56578540	56578746	E068	-207
chr6	56579163	56579582	E068	210
chr6	56579615	56580529	E068	662
chr6	56580698	56580831	E068	1745
chr6	56581023	56581073	E068	2070
chr6	56581137	56581505	E068	2184
chr6	56589301	56589586	E068	10348
chr6	56589828	56589917	E068	10875
chr6	56590096	56590345	E068	11143
chr6	56594591	56594823	E068	15638
chr6	56595027	56595201	E068	16074
chr6	56595500	56596026	E068	16547
chr6	56597462	56597512	E068	18509
chr6	56597594	56597759	E068	18641
chr6	56598125	56598373	E068	19172
chr6	56605240	56605360	E068	26287
chr6	56605391	56605580	E068	26438
chr6	56606250	56606601	E068	27297
chr6	56607415	56607585	E068	28462
chr6	56607967	56608050	E068	29014
chr6	56609358	56609431	E068	30405
chr6	56609482	56609604	E068	30529
chr6	56611654	56611811	E068	32701
chr6	56611853	56612253	E068	32900
chr6	56614360	56614942	E068	35407
chr6	56615472	56615659	E068	36519
chr6	56615686	56615786	E068	36733
chr6	56616382	56616503	E068	37429
chr6	56616516	56616771	E068	37563
chr6	56616825	56617108	E068	37872
chr6	56617161	56617285	E068	38208
chr6	56617377	56617559	E068	38424
chr6	56618016	56618066	E068	39063
chr6	56618068	56618118	E068	39115
chr6	56618163	56618232	E068	39210
chr6	56618507	56618563	E068	39554
chr6	56618623	56618778	E068	39670
chr6	56618821	56618961	E068	39868
chr6	56619264	56619456	E068	40311
chr6	56619988	56620088	E068	41035
chr6	56620117	56620167	E068	41164
chr6	56620298	56620395	E068	41345
chr6	56620717	56620761	E068	41764
chr6	56620764	56620882	E068	41811
chr6	56620925	56621002	E068	41972
chr6	56621072	56621518	E068	42119
chr6	56621699	56622372	E068	42746
chr6	56622412	56622745	E068	43459
chr6	56622989	56623207	E068	44036
chr6	56623355	56623454	E068	44402
chr6	56623466	56623527	E068	44513
chr6	56623576	56623628	E068	44623
chr6	56623660	56623871	E068	44707
chr6	56624149	56624259	E068	45196
chr6	56624433	56624645	E068	45480
chr6	56625825	56625977	E068	46872
chr6	56534590	56535169	E069	-43784
chr6	56535225	56535281	E069	-43672
chr6	56535637	56535721	E069	-43232
chr6	56535972	56536079	E069	-42874
chr6	56536084	56536409	E069	-42544
chr6	56537452	56537575	E069	-41378
chr6	56538245	56538344	E069	-40609
chr6	56547407	56547613	E069	-31340
chr6	56548253	56548343	E069	-30610
chr6	56548372	56548479	E069	-30474
chr6	56548572	56549119	E069	-29834
chr6	56549255	56549652	E069	-29301
chr6	56549894	56549944	E069	-29009
chr6	56550281	56550335	E069	-28618
chr6	56550557	56550607	E069	-28346
chr6	56550628	56550689	E069	-28264
chr6	56550943	56551068	E069	-27885
chr6	56551786	56551853	E069	-27100
chr6	56552312	56552656	E069	-26297
chr6	56552857	56552901	E069	-26052
chr6	56553009	56553135	E069	-25818
chr6	56553396	56553618	E069	-25335
chr6	56553769	56553961	E069	-24992
chr6	56563831	56563892	E069	-15061
chr6	56563932	56564110	E069	-14843
chr6	56571935	56571985	E069	-6968
chr6	56572241	56572529	E069	-6424
chr6	56573266	56573421	E069	-5532
chr6	56573434	56574181	E069	-4772
chr6	56574446	56574496	E069	-4457
chr6	56574597	56574697	E069	-4256
chr6	56574720	56574776	E069	-4177
chr6	56575046	56575100	E069	-3853
chr6	56577773	56577929	E069	-1024
chr6	56578061	56578523	E069	-430
chr6	56578540	56578746	E069	-207
chr6	56579163	56579582	E069	210
chr6	56579615	56580529	E069	662
chr6	56580698	56580831	E069	1745
chr6	56581023	56581073	E069	2070
chr6	56581137	56581505	E069	2184
chr6	56589301	56589586	E069	10348
chr6	56589828	56589917	E069	10875
chr6	56590096	56590345	E069	11143
chr6	56604529	56604686	E069	25576
chr6	56605240	56605360	E069	26287
chr6	56605391	56605580	E069	26438
chr6	56606250	56606601	E069	27297
chr6	56607415	56607585	E069	28462
chr6	56607967	56608050	E069	29014
chr6	56609358	56609431	E069	30405
chr6	56609482	56609604	E069	30529
chr6	56609899	56610218	E069	30946
chr6	56611654	56611811	E069	32701
chr6	56611853	56612253	E069	32900
chr6	56614360	56614942	E069	35407
chr6	56615472	56615659	E069	36519
chr6	56615686	56615786	E069	36733
chr6	56616382	56616503	E069	37429
chr6	56616516	56616771	E069	37563
chr6	56616825	56617108	E069	37872
chr6	56617161	56617285	E069	38208
chr6	56618016	56618066	E069	39063
chr6	56618068	56618118	E069	39115
chr6	56618163	56618232	E069	39210
chr6	56618507	56618563	E069	39554
chr6	56618623	56618778	E069	39670
chr6	56618821	56618961	E069	39868
chr6	56619264	56619456	E069	40311
chr6	56619988	56620088	E069	41035
chr6	56620117	56620167	E069	41164
chr6	56620298	56620395	E069	41345
chr6	56620717	56620761	E069	41764
chr6	56620764	56620882	E069	41811
chr6	56620925	56621002	E069	41972
chr6	56621072	56621518	E069	42119
chr6	56621699	56622372	E069	42746
chr6	56622412	56622745	E069	43459
chr6	56622989	56623207	E069	44036
chr6	56623355	56623454	E069	44402
chr6	56623466	56623527	E069	44513
chr6	56623576	56623628	E069	44623
chr6	56623660	56623871	E069	44707
chr6	56624149	56624259	E069	45196
chr6	56624433	56624645	E069	45480
chr6	56605240	56605360	E070	26287
chr6	56605391	56605580	E070	26438
chr6	56606250	56606601	E070	27297
chr6	56606902	56607350	E070	27949
chr6	56618163	56618232	E070	39210
chr6	56618507	56618563	E070	39554
chr6	56618623	56618778	E070	39670
chr6	56620717	56620761	E070	41764
chr6	56620764	56620882	E070	41811
chr6	56620925	56621002	E070	41972
chr6	56621072	56621518	E070	42119
chr6	56621699	56622372	E070	42746
chr6	56622412	56622745	E070	43459
chr6	56622989	56623207	E070	44036
chr6	56623355	56623454	E070	44402
chr6	56623466	56623527	E070	44513
chr6	56623576	56623628	E070	44623
chr6	56623660	56623871	E070	44707
chr6	56624149	56624259	E070	45196
chr6	56624433	56624645	E070	45480
chr6	56532327	56532400	E071	-46553
chr6	56534474	56534572	E071	-44381
chr6	56535225	56535281	E071	-43672
chr6	56535637	56535721	E071	-43232
chr6	56535972	56536079	E071	-42874
chr6	56536084	56536409	E071	-42544
chr6	56537452	56537575	E071	-41378
chr6	56538245	56538344	E071	-40609
chr6	56539291	56539412	E071	-39541
chr6	56542474	56542630	E071	-36323
chr6	56547407	56547613	E071	-31340
chr6	56548253	56548343	E071	-30610
chr6	56548372	56548479	E071	-30474
chr6	56548572	56549119	E071	-29834
chr6	56549255	56549652	E071	-29301
chr6	56549894	56549944	E071	-29009
chr6	56550281	56550335	E071	-28618
chr6	56550557	56550607	E071	-28346
chr6	56550628	56550689	E071	-28264
chr6	56550943	56551068	E071	-27885
chr6	56551786	56551853	E071	-27100
chr6	56552312	56552656	E071	-26297
chr6	56552857	56552901	E071	-26052
chr6	56553009	56553135	E071	-25818
chr6	56561854	56561948	E071	-17005
chr6	56561970	56562038	E071	-16915
chr6	56563436	56563515	E071	-15438
chr6	56563831	56563892	E071	-15061
chr6	56563932	56564110	E071	-14843
chr6	56564187	56564250	E071	-14703
chr6	56571935	56571985	E071	-6968
chr6	56572241	56572529	E071	-6424
chr6	56573266	56573421	E071	-5532
chr6	56573434	56574181	E071	-4772
chr6	56574446	56574496	E071	-4457
chr6	56574597	56574697	E071	-4256
chr6	56574720	56574776	E071	-4177
chr6	56575046	56575100	E071	-3853
chr6	56577773	56577929	E071	-1024
chr6	56578061	56578523	E071	-430
chr6	56578540	56578746	E071	-207
chr6	56579163	56579582	E071	210
chr6	56579615	56580529	E071	662
chr6	56580698	56580831	E071	1745
chr6	56581023	56581073	E071	2070
chr6	56581137	56581505	E071	2184
chr6	56589301	56589586	E071	10348
chr6	56589828	56589917	E071	10875
chr6	56590096	56590345	E071	11143
chr6	56604529	56604686	E071	25576
chr6	56605240	56605360	E071	26287
chr6	56605391	56605580	E071	26438
chr6	56606250	56606601	E071	27297
chr6	56607415	56607585	E071	28462
chr6	56607967	56608050	E071	29014
chr6	56608853	56608914	E071	29900
chr6	56609358	56609431	E071	30405
chr6	56609482	56609604	E071	30529
chr6	56609899	56610218	E071	30946
chr6	56611654	56611811	E071	32701
chr6	56611853	56612253	E071	32900
chr6	56614360	56614942	E071	35407
chr6	56615472	56615659	E071	36519
chr6	56615686	56615786	E071	36733
chr6	56616382	56616503	E071	37429
chr6	56616516	56616771	E071	37563
chr6	56616825	56617108	E071	37872
chr6	56617161	56617285	E071	38208
chr6	56617377	56617559	E071	38424
chr6	56618016	56618066	E071	39063
chr6	56618068	56618118	E071	39115
chr6	56618163	56618232	E071	39210
chr6	56618507	56618563	E071	39554
chr6	56618623	56618778	E071	39670
chr6	56618821	56618961	E071	39868
chr6	56619264	56619456	E071	40311
chr6	56620117	56620167	E071	41164
chr6	56620298	56620395	E071	41345
chr6	56620717	56620761	E071	41764
chr6	56620764	56620882	E071	41811
chr6	56620925	56621002	E071	41972
chr6	56621072	56621518	E071	42119
chr6	56623355	56623454	E071	44402
chr6	56623466	56623527	E071	44513
chr6	56623576	56623628	E071	44623
chr6	56623660	56623871	E071	44707
chr6	56624149	56624259	E071	45196
chr6	56624433	56624645	E071	45480
chr6	56625825	56625977	E071	46872
chr6	56534590	56535169	E072	-43784
chr6	56535225	56535281	E072	-43672
chr6	56535637	56535721	E072	-43232
chr6	56535972	56536079	E072	-42874
chr6	56536084	56536409	E072	-42544
chr6	56537452	56537575	E072	-41378
chr6	56538245	56538344	E072	-40609
chr6	56547407	56547613	E072	-31340
chr6	56548253	56548343	E072	-30610
chr6	56548372	56548479	E072	-30474
chr6	56548572	56549119	E072	-29834
chr6	56549255	56549652	E072	-29301
chr6	56549894	56549944	E072	-29009
chr6	56550281	56550335	E072	-28618
chr6	56550557	56550607	E072	-28346
chr6	56550628	56550689	E072	-28264
chr6	56550943	56551068	E072	-27885
chr6	56551786	56551853	E072	-27100
chr6	56553769	56553961	E072	-24992
chr6	56571935	56571985	E072	-6968
chr6	56572241	56572529	E072	-6424
chr6	56573266	56573421	E072	-5532
chr6	56573434	56574181	E072	-4772
chr6	56577773	56577929	E072	-1024
chr6	56578061	56578523	E072	-430
chr6	56578540	56578746	E072	-207
chr6	56579163	56579582	E072	210
chr6	56579615	56580529	E072	662
chr6	56580698	56580831	E072	1745
chr6	56581023	56581073	E072	2070
chr6	56581137	56581505	E072	2184
chr6	56589301	56589586	E072	10348
chr6	56589828	56589917	E072	10875
chr6	56590096	56590345	E072	11143
chr6	56591926	56592771	E072	12973
chr6	56604529	56604686	E072	25576
chr6	56605240	56605360	E072	26287
chr6	56605391	56605580	E072	26438
chr6	56606250	56606601	E072	27297
chr6	56606902	56607350	E072	27949
chr6	56607967	56608050	E072	29014
chr6	56609358	56609431	E072	30405
chr6	56609482	56609604	E072	30529
chr6	56609899	56610218	E072	30946
chr6	56611486	56611556	E072	32533
chr6	56611654	56611811	E072	32701
chr6	56611853	56612253	E072	32900
chr6	56615472	56615659	E072	36519
chr6	56615686	56615786	E072	36733
chr6	56616382	56616503	E072	37429
chr6	56616516	56616771	E072	37563
chr6	56616825	56617108	E072	37872
chr6	56617161	56617285	E072	38208
chr6	56617377	56617559	E072	38424
chr6	56618016	56618066	E072	39063
chr6	56618068	56618118	E072	39115
chr6	56618163	56618232	E072	39210
chr6	56618507	56618563	E072	39554
chr6	56618623	56618778	E072	39670
chr6	56618821	56618961	E072	39868
chr6	56619264	56619456	E072	40311
chr6	56619988	56620088	E072	41035
chr6	56620117	56620167	E072	41164
chr6	56620298	56620395	E072	41345
chr6	56620717	56620761	E072	41764
chr6	56621072	56621518	E072	42119
chr6	56621699	56622372	E072	42746
chr6	56622989	56623207	E072	44036
chr6	56623355	56623454	E072	44402
chr6	56623466	56623527	E072	44513
chr6	56623576	56623628	E072	44623
chr6	56623660	56623871	E072	44707
chr6	56624149	56624259	E072	45196
chr6	56624433	56624645	E072	45480
chr6	56534590	56535169	E073	-43784
chr6	56536433	56537299	E073	-41654
chr6	56537452	56537575	E073	-41378
chr6	56547407	56547613	E073	-31340
chr6	56548253	56548343	E073	-30610
chr6	56548372	56548479	E073	-30474
chr6	56548572	56549119	E073	-29834
chr6	56549255	56549652	E073	-29301
chr6	56553769	56553961	E073	-24992
chr6	56571935	56571985	E073	-6968
chr6	56572241	56572529	E073	-6424
chr6	56573266	56573421	E073	-5532
chr6	56573434	56574181	E073	-4772
chr6	56574446	56574496	E073	-4457
chr6	56574597	56574697	E073	-4256
chr6	56574720	56574776	E073	-4177
chr6	56575046	56575100	E073	-3853
chr6	56577773	56577929	E073	-1024
chr6	56578061	56578523	E073	-430
chr6	56578540	56578746	E073	-207
chr6	56579163	56579582	E073	210
chr6	56581023	56581073	E073	2070
chr6	56589301	56589586	E073	10348
chr6	56589828	56589917	E073	10875
chr6	56590096	56590345	E073	11143
chr6	56605240	56605360	E073	26287
chr6	56605391	56605580	E073	26438
chr6	56606250	56606601	E073	27297
chr6	56606902	56607350	E073	27949
chr6	56607967	56608050	E073	29014
chr6	56610814	56611144	E073	31861
chr6	56611486	56611556	E073	32533
chr6	56611654	56611811	E073	32701
chr6	56611853	56612253	E073	32900
chr6	56614360	56614942	E073	35407
chr6	56615472	56615659	E073	36519
chr6	56615686	56615786	E073	36733
chr6	56616825	56617108	E073	37872
chr6	56617161	56617285	E073	38208
chr6	56617377	56617559	E073	38424
chr6	56618016	56618066	E073	39063
chr6	56618068	56618118	E073	39115
chr6	56618163	56618232	E073	39210
chr6	56618507	56618563	E073	39554
chr6	56618623	56618778	E073	39670
chr6	56619988	56620088	E073	41035
chr6	56620117	56620167	E073	41164
chr6	56620298	56620395	E073	41345
chr6	56620717	56620761	E073	41764
chr6	56620764	56620882	E073	41811
chr6	56620925	56621002	E073	41972
chr6	56621072	56621518	E073	42119
chr6	56621699	56622372	E073	42746
chr6	56622412	56622745	E073	43459
chr6	56622989	56623207	E073	44036
chr6	56623355	56623454	E073	44402
chr6	56623466	56623527	E073	44513
chr6	56623576	56623628	E073	44623
chr6	56623660	56623871	E073	44707
chr6	56532327	56532400	E074	-46553
chr6	56532957	56533315	E074	-45638
chr6	56534474	56534572	E074	-44381
chr6	56534590	56535169	E074	-43784
chr6	56535225	56535281	E074	-43672
chr6	56535637	56535721	E074	-43232
chr6	56535972	56536079	E074	-42874
chr6	56536084	56536409	E074	-42544
chr6	56537452	56537575	E074	-41378
chr6	56538245	56538344	E074	-40609
chr6	56539291	56539412	E074	-39541
chr6	56542474	56542630	E074	-36323
chr6	56547407	56547613	E074	-31340
chr6	56548253	56548343	E074	-30610
chr6	56548372	56548479	E074	-30474
chr6	56548572	56549119	E074	-29834
chr6	56549255	56549652	E074	-29301
chr6	56549894	56549944	E074	-29009
chr6	56550281	56550335	E074	-28618
chr6	56550557	56550607	E074	-28346
chr6	56550628	56550689	E074	-28264
chr6	56550943	56551068	E074	-27885
chr6	56551786	56551853	E074	-27100
chr6	56552312	56552656	E074	-26297
chr6	56560654	56560733	E074	-18220
chr6	56560769	56560878	E074	-18075
chr6	56561854	56561948	E074	-17005
chr6	56561970	56562038	E074	-16915
chr6	56563436	56563515	E074	-15438
chr6	56563831	56563892	E074	-15061
chr6	56563932	56564110	E074	-14843
chr6	56571935	56571985	E074	-6968
chr6	56572241	56572529	E074	-6424
chr6	56573266	56573421	E074	-5532
chr6	56573434	56574181	E074	-4772
chr6	56574446	56574496	E074	-4457
chr6	56574597	56574697	E074	-4256
chr6	56574720	56574776	E074	-4177
chr6	56575046	56575100	E074	-3853
chr6	56577773	56577929	E074	-1024
chr6	56578061	56578523	E074	-430
chr6	56578540	56578746	E074	-207
chr6	56579163	56579582	E074	210
chr6	56579615	56580529	E074	662
chr6	56580698	56580831	E074	1745
chr6	56581023	56581073	E074	2070
chr6	56581137	56581505	E074	2184
chr6	56589301	56589586	E074	10348
chr6	56589828	56589917	E074	10875
chr6	56590096	56590345	E074	11143
chr6	56594434	56594559	E074	15481
chr6	56594591	56594823	E074	15638
chr6	56597243	56597287	E074	18290
chr6	56597462	56597512	E074	18509
chr6	56604529	56604686	E074	25576
chr6	56605240	56605360	E074	26287
chr6	56605391	56605580	E074	26438
chr6	56606250	56606601	E074	27297
chr6	56607415	56607585	E074	28462
chr6	56607967	56608050	E074	29014
chr6	56608853	56608914	E074	29900
chr6	56609358	56609431	E074	30405
chr6	56609482	56609604	E074	30529
chr6	56610814	56611144	E074	31861
chr6	56611486	56611556	E074	32533
chr6	56611654	56611811	E074	32701
chr6	56611853	56612253	E074	32900
chr6	56616825	56617108	E074	37872
chr6	56617161	56617285	E074	38208
chr6	56617377	56617559	E074	38424
chr6	56618016	56618066	E074	39063
chr6	56618068	56618118	E074	39115
chr6	56618163	56618232	E074	39210
chr6	56618507	56618563	E074	39554
chr6	56618623	56618778	E074	39670
chr6	56619988	56620088	E074	41035
chr6	56620117	56620167	E074	41164
chr6	56620298	56620395	E074	41345
chr6	56620717	56620761	E074	41764
chr6	56620764	56620882	E074	41811
chr6	56621072	56621518	E074	42119
chr6	56621699	56622372	E074	42746
chr6	56622412	56622745	E074	43459
chr6	56622989	56623207	E074	44036
chr6	56623355	56623454	E074	44402
chr6	56623466	56623527	E074	44513
chr6	56623576	56623628	E074	44623
chr6	56623660	56623871	E074	44707
chr6	56624149	56624259	E074	45196
chr6	56624433	56624645	E074	45480
chr6	56625825	56625977	E074	46872
chr6	56534590	56535169	E081	-43784
chr6	56579615	56580529	E081	662
chr6	56580698	56580831	E081	1745
chr6	56581023	56581073	E081	2070
chr6	56581137	56581505	E081	2184
chr6	56615686	56615786	E081	36733
chr6	56620298	56620395	E081	41345
chr6	56620764	56620882	E081	41811
chr6	56620925	56621002	E081	41972
chr6	56621072	56621518	E081	42119
chr6	56621699	56622372	E081	42746
chr6	56622412	56622745	E081	43459
chr6	56536433	56537299	E082	-41654
chr6	56606250	56606601	E082	27297
chr6	56620717	56620761	E082	41764
chr6	56620764	56620882	E082	41811
chr6	56620925	56621002	E082	41972
chr6	56621072	56621518	E082	42119
chr6	56621699	56622372	E082	42746
chr6	56622412	56622745	E082	43459
chr6	56622989	56623207	E082	44036

Promoter Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome	Start	End	Region	Distance(-/+:Up/Downstream)
chr6	56555313	56555907	E067	-23046
chr6	56556101	56556253	E067	-22700
chr6	56556500	56556598	E067	-22355
chr6	56556659	56556931	E067	-22022
chr6	56556937	56557075	E067	-21878
chr6	56557104	56558570	E067	-20383
chr6	56555313	56555907	E068	-23046
chr6	56556101	56556253	E068	-22700
chr6	56556500	56556598	E068	-22355
chr6	56556659	56556931	E068	-22022
chr6	56556937	56557075	E068	-21878
chr6	56557104	56558570	E068	-20383
chr6	56555313	56555907	E069	-23046
chr6	56556101	56556253	E069	-22700
chr6	56556500	56556598	E069	-22355
chr6	56556659	56556931	E069	-22022
chr6	56556937	56557075	E069	-21878
chr6	56557104	56558570	E069	-20383
chr6	56555313	56555907	E071	-23046
chr6	56556101	56556253	E071	-22700
chr6	56556500	56556598	E071	-22355
chr6	56556659	56556931	E071	-22022
chr6	56556937	56557075	E071	-21878
chr6	56557104	56558570	E071	-20383
chr6	56555313	56555907	E072	-23046
chr6	56556101	56556253	E072	-22700
chr6	56556500	56556598	E072	-22355
chr6	56556659	56556931	E072	-22022
chr6	56556937	56557075	E072	-21878
chr6	56557104	56558570	E072	-20383
chr6	56555313	56555907	E073	-23046
chr6	56556101	56556253	E073	-22700
chr6	56556500	56556598	E073	-22355
chr6	56556659	56556931	E073	-22022
chr6	56556937	56557075	E073	-21878
chr6	56557104	56558570	E073	-20383
chr6	56555313	56555907	E074	-23046
chr6	56556101	56556253	E074	-22700
chr6	56556500	56556598	E074	-22355
chr6	56556659	56556931	E074	-22022
chr6	56556937	56557075	E074	-21878
chr6	56557104	56558570	E074	-20383