rs9581297

Homo sapiens
G>T
None
Check p-value
SNV (Single Nucleotide Variation)
T=0216 (6490/29936,GnomAD)
T=0202 (5900/29116,TOPMED)
T=0218 (1090/5008,1000G)
T=0218 (840/3854,ALSPAC)
T=0201 (744/3708,TWINSUK)
chr13:25209944 (GRCh38.p7) (13q12.13)
AD
GWASdb2
1   publication(s)
See rs on genome

Genomic Coordinates

Sequence Name Change(s)
GRCh38.p7 chr 13NC_000013.11:g.25209944G>T
GRCh37.p13 chr 13NC_000013.10:g.25784082G>T

Population Frequency

Study Population Group Sample # Ref Allele Alt Allele
1000GenomesAfricanSub1322G=0.815T=0.185
1000GenomesAmericanSub694G=0.770T=0.230
1000GenomesEast AsianSub1008G=0.737T=0.263
1000GenomesEuropeSub1006G=0.814T=0.186
1000GenomesGlobalStudy-wide5008G=0.782T=0.218
1000GenomesSouth AsianSub978G=0.760T=0.240
The Avon Longitudinal Study of Parents and ChildrenPARENT AND CHILD COHORTStudy-wide3854G=0.782T=0.218
The Genome Aggregation DatabaseAfricanSub8712G=0.808T=0.192
The Genome Aggregation DatabaseAmericanSub836G=0.740T=0.260
The Genome Aggregation DatabaseEast AsianSub1616G=0.762T=0.238
The Genome Aggregation DatabaseEuropeSub18470G=0.773T=0.226
The Genome Aggregation DatabaseGlobalStudy-wide29936G=0.783T=0.216
The Genome Aggregation DatabaseOtherSub302G=0.880T=0.120
Trans-Omics for Precision MedicineGlobalStudy-wide29116G=0.797T=0.202
UK 10K study - TwinsTWIN COHORTStudy-wide3708G=0.799T=0.201
PMID Title Author Journal
21314694Genomewide association analysis of symptoms of alcohol dependence in the molecular genetics of schizophrenia (MGS2) control sample.Kendler KSAlcohol Clin Exp Res

P-Value

SNP ID p-value Traits Study
rs95812970.000208alcohol dependence21314694

eQTL of rs9581297 in Brain tissues (GTEx Analysis Release V7)

Position (v37) eGene GeneID Variant p-value TSS Tissue
There is no eQTL annotation for this SNP

meQTL of rs9581297 in Fetal Brain

Probe ID Position Gene beta p-value
There is no meQTL annotation for this SNP

Genomic View

Chromatin Interaction

There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.

Enhancer Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance ( -/+ : Up/Downstream )
chr132574962325749685E067-34397
chr132574990625749956E067-34126
chr132575064125750703E067-33379
chr132575076125750819E067-33263
chr132575083425750884E067-33198
chr132575116425751477E067-32605
chr132575185625751906E067-32176
chr132575211925752169E067-31913
chr132575225425752426E067-31656
chr132575244725752690E067-31392
chr132575315925753209E067-30873
chr132575337925753514E067-30568
chr132575383725753887E067-30195
chr132575408125754330E067-29752
chr132575465125754719E067-29363
chr132575477125754829E067-29253
chr132575483925755365E067-28717
chr132575540125755674E067-28408
chr132575586425755942E067-28140
chr132575600325756104E067-27978
chr132575617625756230E067-27852
chr132575634525756444E067-27638
chr132576317625763277E067-20805
chr132576369625763793E067-20289
chr132576420525764296E067-19786
chr132576444125764502E067-19580
chr132576453225764594E067-19488
chr132576490825765017E067-19065
chr132576509825765209E067-18873
chr132576525725765307E067-18775
chr132576536425765461E067-18621
chr132576586525765915E067-18167
chr132577266825772718E067-11364
chr132577294925772989E067-11093
chr132577301625773127E067-10955
chr132577321425773559E067-10523
chr132577371425773807E067-10275
chr132577708825777142E067-6940
chr132577717025777331E067-6751
chr132577735725777445E067-6637
chr132577761925777781E067-6301
chr132577786125777911E067-6171
chr132577855825778720E067-5362
chr132578930425789539E0675222
chr132578956625789654E0675484
chr132579124325791454E0677161
chr132579154325791891E0677461
chr132579228425792461E0678202
chr132574728125747341E068-36741
chr132574738325747467E068-36615
chr132574769925747749E068-36333
chr132574783125747915E068-36167
chr132574797525748029E068-36053
chr132574851025748560E068-35522
chr132574856625748687E068-35395
chr132574916525749282E068-34800
chr132574929925749390E068-34692
chr132574962325749685E068-34397
chr132574990625749956E068-34126
chr132575064125750703E068-33379
chr132575076125750819E068-33263
chr132575116425751477E068-32605
chr132575185625751906E068-32176
chr132575211925752169E068-31913
chr132575225425752426E068-31656
chr132575244725752690E068-31392
chr132575315925753209E068-30873
chr132575383725753887E068-30195
chr132575408125754330E068-29752
chr132575465125754719E068-29363
chr132575477125754829E068-29253
chr132575483925755365E068-28717
chr132575540125755674E068-28408
chr132575586425755942E068-28140
chr132575600325756104E068-27978
chr132575617625756230E068-27852
chr132575634525756444E068-27638
chr132576317625763277E068-20805
chr132576369625763793E068-20289
chr132576420525764296E068-19786
chr132576444125764502E068-19580
chr132576453225764594E068-19488
chr132576490825765017E068-19065
chr132576509825765209E068-18873
chr132576525725765307E068-18775
chr132576536425765461E068-18621
chr132576586525765915E068-18167
chr132576846525768515E068-15567
chr132577321425773559E068-10523
chr132577761925777781E068-6301
chr132577786125777911E068-6171
chr132578774725788234E0683665
chr132578858625788713E0684504
chr132578881525789253E0684733
chr132578930425789539E0685222
chr132578956625789654E0685484
chr132579228425792461E0688202
chr132574728125747341E069-36741
chr132574738325747467E069-36615
chr132574769925747749E069-36333
chr132574783125747915E069-36167
chr132574797525748029E069-36053
chr132574916525749282E069-34800
chr132574929925749390E069-34692
chr132574962325749685E069-34397
chr132574990625749956E069-34126
chr132575116425751477E069-32605
chr132575185625751906E069-32176
chr132575244725752690E069-31392
chr132575315925753209E069-30873
chr132575337925753514E069-30568
chr132575383725753887E069-30195
chr132575408125754330E069-29752
chr132575465125754719E069-29363
chr132575477125754829E069-29253
chr132575483925755365E069-28717
chr132575540125755674E069-28408
chr132575586425755942E069-28140
chr132575600325756104E069-27978
chr132575617625756230E069-27852
chr132575634525756444E069-27638
chr132576317625763277E069-20805
chr132576369625763793E069-20289
chr132576420525764296E069-19786
chr132576444125764502E069-19580
chr132576453225764594E069-19488
chr132576490825765017E069-19065
chr132576509825765209E069-18873
chr132576525725765307E069-18775
chr132576536425765461E069-18621
chr132576586525765915E069-18167
chr132576719825767665E069-16417
chr132576801925768069E069-16013
chr132577266825772718E069-11364
chr132577294925772989E069-11093
chr132577301625773127E069-10955
chr132577321425773559E069-10523
chr132577674225776792E069-7290
chr132577708825777142E069-6940
chr132577717025777331E069-6751
chr132577735725777445E069-6637
chr132577855825778720E069-5362
chr132578396525784015E069-67
chr132579124325791454E0697161
chr132580687925807051E06922797
chr132580713925807499E06923057
chr132580756725807676E06923485
chr132582196025822010E06937878
chr132582222725822308E06938145
chr132582231325822428E06938231
chr132577266825772718E070-11364
chr132577294925772989E070-11093
chr132577301625773127E070-10955
chr132577321425773559E070-10523
chr132579154325791891E0707461
chr132574738325747467E071-36615
chr132574769925747749E071-36333
chr132574783125747915E071-36167
chr132574797525748029E071-36053
chr132574851025748560E071-35522
chr132574916525749282E071-34800
chr132574929925749390E071-34692
chr132574962325749685E071-34397
chr132574990625749956E071-34126
chr132575064125750703E071-33379
chr132575076125750819E071-33263
chr132575083425750884E071-33198
chr132575116425751477E071-32605
chr132575185625751906E071-32176
chr132575211925752169E071-31913
chr132575225425752426E071-31656
chr132575244725752690E071-31392
chr132575315925753209E071-30873
chr132575337925753514E071-30568
chr132575383725753887E071-30195
chr132575408125754330E071-29752
chr132575465125754719E071-29363
chr132575477125754829E071-29253
chr132575483925755365E071-28717
chr132575540125755674E071-28408
chr132575586425755942E071-28140
chr132575600325756104E071-27978
chr132575617625756230E071-27852
chr132575634525756444E071-27638
chr132575967525759824E071-24258
chr132576317625763277E071-20805
chr132576369625763793E071-20289
chr132576420525764296E071-19786
chr132576444125764502E071-19580
chr132576453225764594E071-19488
chr132576490825765017E071-19065
chr132576509825765209E071-18873
chr132576525725765307E071-18775
chr132576536425765461E071-18621
chr132576586525765915E071-18167
chr132576719825767665E071-16417
chr132576801925768069E071-16013
chr132576846525768515E071-15567
chr132577205525772206E071-11876
chr132577266825772718E071-11364
chr132577294925772989E071-11093
chr132577371425773807E071-10275
chr132577674225776792E071-7290
chr132577708825777142E071-6940
chr132577717025777331E071-6751
chr132577735725777445E071-6637
chr132577761925777781E071-6301
chr132577786125777911E071-6171
chr132577855825778720E071-5362
chr132579124325791454E0717161
chr132580713925807499E07123057
chr132580756725807676E07123485
chr132580768925807857E07123607
chr132580799425808229E07123912
chr132582169125821761E07137609
chr132582222725822308E07138145
chr132582231325822428E07138231
chr132582332525823604E07139243
chr132575064125750703E072-33379
chr132575076125750819E072-33263
chr132575083425750884E072-33198
chr132575116425751477E072-32605
chr132575185625751906E072-32176
chr132575211925752169E072-31913
chr132575315925753209E072-30873
chr132575337925753514E072-30568
chr132575383725753887E072-30195
chr132575465125754719E072-29363
chr132575477125754829E072-29253
chr132575483925755365E072-28717
chr132575540125755674E072-28408
chr132575586425755942E072-28140
chr132575600325756104E072-27978
chr132575617625756230E072-27852
chr132575634525756444E072-27638
chr132576317625763277E072-20805
chr132576369625763793E072-20289
chr132576420525764296E072-19786
chr132576444125764502E072-19580
chr132576453225764594E072-19488
chr132576490825765017E072-19065
chr132576509825765209E072-18873
chr132576525725765307E072-18775
chr132576536425765461E072-18621
chr132576586525765915E072-18167
chr132576719825767665E072-16417
chr132576801925768069E072-16013
chr132576846525768515E072-15567
chr132577051725770656E072-13426
chr132577097725771027E072-13055
chr132577266825772718E072-11364
chr132577294925772989E072-11093
chr132577301625773127E072-10955
chr132577321425773559E072-10523
chr132577371425773807E072-10275
chr132577674225776792E072-7290
chr132577708825777142E072-6940
chr132577717025777331E072-6751
chr132577735725777445E072-6637
chr132577786125777911E072-6171
chr132578774725788234E0723665
chr132578858625788713E0724504
chr132578881525789253E0724733
chr132578930425789539E0725222
chr132579124325791454E0727161
chr132581535125815471E07231269
chr132581556925815649E07231487
chr132582169125821761E07237609
chr132582332525823604E07239243
chr132582360525823658E07239523
chr132574728125747341E073-36741
chr132574783125747915E073-36167
chr132574962325749685E073-34397
chr132574990625749956E073-34126
chr132575064125750703E073-33379
chr132575076125750819E073-33263
chr132575083425750884E073-33198
chr132575116425751477E073-32605
chr132575185625751906E073-32176
chr132575211925752169E073-31913
chr132575225425752426E073-31656
chr132575408125754330E073-29752
chr132575465125754719E073-29363
chr132575477125754829E073-29253
chr132575483925755365E073-28717
chr132575540125755674E073-28408
chr132575586425755942E073-28140
chr132576369625763793E073-20289
chr132576420525764296E073-19786
chr132576444125764502E073-19580
chr132576453225764594E073-19488
chr132576490825765017E073-19065
chr132576509825765209E073-18873
chr132577294925772989E073-11093
chr132577301625773127E073-10955
chr132577321425773559E073-10523
chr132577786125777911E073-6171
chr132582231325822428E07338231
chr132574728125747341E074-36741
chr132574738325747467E074-36615
chr132574962325749685E074-34397
chr132574990625749956E074-34126
chr132575064125750703E074-33379
chr132575076125750819E074-33263
chr132575083425750884E074-33198
chr132575116425751477E074-32605
chr132575185625751906E074-32176
chr132575211925752169E074-31913
chr132575225425752426E074-31656
chr132575244725752690E074-31392
chr132575315925753209E074-30873
chr132575337925753514E074-30568
chr132575383725753887E074-30195
chr132575408125754330E074-29752
chr132575465125754719E074-29363
chr132575477125754829E074-29253
chr132575483925755365E074-28717
chr132575540125755674E074-28408
chr132575586425755942E074-28140
chr132575600325756104E074-27978
chr132575617625756230E074-27852
chr132575634525756444E074-27638
chr132576317625763277E074-20805
chr132576369625763793E074-20289
chr132576420525764296E074-19786
chr132576444125764502E074-19580
chr132576453225764594E074-19488
chr132576490825765017E074-19065
chr132576509825765209E074-18873
chr132576525725765307E074-18775
chr132576536425765461E074-18621
chr132576586525765915E074-18167
chr132576719825767665E074-16417
chr132576801925768069E074-16013
chr132577266825772718E074-11364
chr132577294925772989E074-11093
chr132577301625773127E074-10955
chr132577321425773559E074-10523
chr132577371425773807E074-10275
chr132577674225776792E074-7290
chr132577708825777142E074-6940
chr132577717025777331E074-6751
chr132577735725777445E074-6637
chr132577761925777781E074-6301
chr132577786125777911E074-6171
chr132577855825778720E074-5362
chr132578774725788234E0743665
chr132578881525789253E0744733
chr132578930425789539E0745222
chr132578956625789654E0745484
chr132579124325791454E0747161
chr132579154325791891E0747461
chr132579228425792461E0748202
chr132580687925807051E07422797
chr132580713925807499E07423057
chr132580756725807676E07423485
chr132580768925807857E07423607
chr132580799425808229E07423912
chr132582169125821761E07437609
chr132574660825746759E081-37323
chr132575408125754330E081-29752
chr132575465125754719E081-29363
chr132575477125754829E081-29253
chr132575483925755365E081-28717
chr132575540125755674E081-28408
chr132575586425755942E081-28140
chr132576444125764502E081-19580
chr132576453225764594E081-19488
chr132576490825765017E081-19065
chr132576509825765209E081-18873
chr132575408125754330E082-29752
chr132575465125754719E082-29363
chr132575477125754829E082-29253
chr132575483925755365E082-28717
chr132575540125755674E082-28408
chr132576490825765017E082-19065
chr132576509825765209E082-18873
chr132577266825772718E082-11364
chr132577294925772989E082-11093










Promoter Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance(-/+:Up/Downstream)
chr132573834125738454E067-45628
chr132573862025738676E067-45406
chr132573937625739437E067-44645
chr132574051825740699E067-43383
chr132574098725741090E067-42992
chr132574127025741451E067-42631
chr132574159725741958E067-42124
chr132574203325742223E067-41859
chr132574237825742519E067-41563
chr132574271425742800E067-41282
chr132574294725743786E067-40296
chr132574453325745350E067-38732
chr132574537325746541E067-37541
chr132573834125738454E068-45628
chr132573862025738676E068-45406
chr132573937625739437E068-44645
chr132574051825740699E068-43383
chr132574098725741090E068-42992
chr132574127025741451E068-42631
chr132574159725741958E068-42124
chr132574203325742223E068-41859
chr132574237825742519E068-41563
chr132574271425742800E068-41282
chr132574294725743786E068-40296
chr132574453325745350E068-38732
chr132574537325746541E068-37541
chr132573937625739437E069-44645
chr132574051825740699E069-43383
chr132574098725741090E069-42992
chr132574127025741451E069-42631
chr132574159725741958E069-42124
chr132574203325742223E069-41859
chr132574237825742519E069-41563
chr132574271425742800E069-41282
chr132574294725743786E069-40296
chr132574453325745350E069-38732
chr132574537325746541E069-37541
chr132573937625739437E070-44645
chr132574051825740699E070-43383
chr132574098725741090E070-42992
chr132574127025741451E070-42631
chr132574159725741958E070-42124
chr132574203325742223E070-41859
chr132574237825742519E070-41563
chr132574271425742800E070-41282
chr132574294725743786E070-40296
chr132574435825744527E070-39555
chr132574453325745350E070-38732
chr132574537325746541E070-37541
chr132573834125738454E071-45628
chr132573862025738676E071-45406
chr132573937625739437E071-44645
chr132574051825740699E071-43383
chr132574098725741090E071-42992
chr132574127025741451E071-42631
chr132574159725741958E071-42124
chr132574203325742223E071-41859
chr132574237825742519E071-41563
chr132574271425742800E071-41282
chr132574453325745350E071-38732
chr132574537325746541E071-37541
chr132573862025738676E072-45406
chr132573937625739437E072-44645
chr132574051825740699E072-43383
chr132574098725741090E072-42992
chr132574127025741451E072-42631
chr132574159725741958E072-42124
chr132574203325742223E072-41859
chr132574237825742519E072-41563
chr132574271425742800E072-41282
chr132574453325745350E072-38732
chr132574537325746541E072-37541
chr132573937625739437E073-44645
chr132574051825740699E073-43383
chr132574098725741090E073-42992
chr132574127025741451E073-42631
chr132574159725741958E073-42124
chr132574203325742223E073-41859
chr132574237825742519E073-41563
chr132574271425742800E073-41282
chr132574294725743786E073-40296
chr132574435825744527E073-39555
chr132574453325745350E073-38732
chr132574537325746541E073-37541
chr132573937625739437E074-44645
chr132574051825740699E074-43383
chr132574098725741090E074-42992
chr132574127025741451E074-42631
chr132574159725741958E074-42124
chr132574203325742223E074-41859
chr132574237825742519E074-41563
chr132574271425742800E074-41282
chr132574453325745350E074-38732
chr132574537325746541E074-37541
chr132573937625739437E081-44645
chr132574051825740699E081-43383
chr132574098725741090E081-42992
chr132574127025741451E081-42631
chr132574159725741958E081-42124
chr132574203325742223E081-41859
chr132574237825742519E081-41563
chr132574271425742800E081-41282
chr132574294725743786E081-40296
chr132574435825744527E081-39555
chr132574453325745350E081-38732
chr132574537325746541E081-37541
chr132573834125738454E082-45628
chr132573862025738676E082-45406
chr132573937625739437E082-44645
chr132574051825740699E082-43383
chr132574098725741090E082-42992
chr132574127025741451E082-42631
chr132574159725741958E082-42124
chr132574203325742223E082-41859
chr132574237825742519E082-41563
chr132574271425742800E082-41282
chr132574294725743786E082-40296
chr132574435825744527E082-39555
chr132574453325745350E082-38732
chr132574537325746541E082-37541