rs999986

Homo sapiens
C>A
None
Check p-value
SNV (Single Nucleotide Variation)
A=0244 (7304/29934,GnomAD)
A=0205 (5976/29118,TOPMED)
A=0281 (1409/5008,1000G)
A=0300 (1156/3854,ALSPAC)
A=0286 (1059/3708,TWINSUK)
chr14:95337519 (GRCh38.p7) (14q32.13)
ND
GWASdb2
1   publication(s)
See rs on genome

Genomic Coordinates

Sequence Name Change(s)
GRCh38.p7 chr 14NC_000014.9:g.95337519C>A
GRCh37.p13 chr 14NC_000014.8:g.95803856C>A

Population Frequency

Study Population Group Sample # Ref Allele Alt Allele
1000GenomesAfricanSub1322C=0.939A=0.061
1000GenomesAmericanSub694C=0.640A=0.360
1000GenomesEast AsianSub1008C=0.539A=0.461
1000GenomesEuropeSub1006C=0.689A=0.311
1000GenomesGlobalStudy-wide5008C=0.719A=0.281
1000GenomesSouth AsianSub978C=0.690A=0.310
The Avon Longitudinal Study of Parents and ChildrenPARENT AND CHILD COHORTStudy-wide3854C=0.700A=0.300
The Genome Aggregation DatabaseAfricanSub8716C=0.914A=0.086
The Genome Aggregation DatabaseAmericanSub836C=0.630A=0.370
The Genome Aggregation DatabaseEast AsianSub1616C=0.533A=0.467
The Genome Aggregation DatabaseEuropeSub18466C=0.707A=0.292
The Genome Aggregation DatabaseGlobalStudy-wide29934C=0.756A=0.244
The Genome Aggregation DatabaseOtherSub300C=0.690A=0.310
Trans-Omics for Precision MedicineGlobalStudy-wide29118C=0.794A=0.205
UK 10K study - TwinsTWIN COHORTStudy-wide3708C=0.714A=0.286
PMID Title Author Journal
19268276Genome-wide association study of smoking initiation and current smoking.Vink JMAm J Hum Genet

P-Value

SNP ID p-value Traits Study
rs9999867.32E-05nicotine smoking19268276

eQTL of rs999986 in Brain tissues (GTEx Analysis Release V7)

Position (v37) eGene GeneID Variant p-value TSS Tissue
There is no eQTL annotation for this SNP

meQTL of rs999986 in Fetal Brain

Probe ID Position Gene beta p-value
There is no meQTL annotation for this SNP

Genomic View

Chromatin Interaction

There is no significant Hi-C chromatin interaction data for this SNP.

Enhancer Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance ( -/+ : Up/Downstream )
chr149575398095754030E067-49826
chr149575406895754123E067-49733
chr149575477695754893E067-48963
chr149575528195755399E067-48457
chr149575556695755616E067-48240
chr149575614095756196E067-47660
chr149575642695756496E067-47360
chr149575664595756702E067-47154
chr149575684695756918E067-46938
chr149575694995757034E067-46822
chr149575704595757946E067-45910
chr149575801595758575E067-45281
chr149575858195758633E067-45223
chr149575893795759025E067-44831
chr149575905595759264E067-44592
chr149575931895759365E067-44491
chr149575950995759568E067-44288
chr149575987795759979E067-43877
chr149576012595760206E067-43650
chr149576023195760343E067-43513
chr149576063695760696E067-43160
chr149576076395760848E067-43008
chr149576088595760965E067-42891
chr149576103495761148E067-42708
chr149576132095761399E067-42457
chr149576158495761814E067-42042
chr149576289295763161E067-40695
chr149576331195763774E067-40082
chr149576397195764116E067-39740
chr149576420995764365E067-39491
chr149576437895764509E067-39347
chr149576497095765020E067-38836
chr149576505995765109E067-38747
chr149576588095765920E067-37936
chr149576653795766911E067-36945
chr149576736095767532E067-36324
chr149576764495767739E067-36117
chr149576798695768327E067-35529
chr149576927795769327E067-34529
chr149576937695769430E067-34426
chr149576949295769543E067-34313
chr149576969395769743E067-34113
chr149577000095770210E067-33646
chr149577062895770678E067-33178
chr149577084495770884E067-32972
chr149577135295771416E067-32440
chr149577145795771517E067-32339
chr149577162995771727E067-32129
chr149577194195772001E067-31855
chr149577310495773183E067-30673
chr149577334495773414E067-30442
chr149577372695774620E067-29236
chr149577469395774743E067-29113
chr149577491395774969E067-28887
chr149577535395775393E067-28463
chr149577541395775564E067-28292
chr149577568695775769E067-28087
chr149577580895775948E067-27908
chr149577598595776035E067-27821
chr149577618195776233E067-27623
chr149577634995776424E067-27432
chr149577660695776661E067-27195
chr149577670795776946E067-26910
chr149577712095777265E067-26591
chr149577734995777574E067-26282
chr149577775395777879E067-25977
chr149577797295778143E067-25713
chr149577819495778330E067-25526
chr149577876095778836E067-25020
chr149577886695778963E067-24893
chr149577914195779191E067-24665
chr149577961295780731E067-23125
chr149578085895780912E067-22944
chr149578094395781535E067-22321
chr149578160095781890E067-21966
chr149578197995782197E067-21659
chr149578255695782614E067-21242
chr149578271195782798E067-21058
chr149578280195782855E067-21001
chr149578285695783045E067-20811
chr149578312095783194E067-20662
chr149582586395825917E06722007
chr149582618995826302E06722333
chr149582633695827422E06722480
chr149582939695829510E06725540
chr149582951495829617E06725658
chr149585379095853840E06749934
chr149575398095754030E068-49826
chr149575406895754123E068-49733
chr149575642695756496E068-47360
chr149575664595756702E068-47154
chr149575684695756918E068-46938
chr149575694995757034E068-46822
chr149575704595757946E068-45910
chr149575801595758575E068-45281
chr149575858195758633E068-45223
chr149576132095761399E068-42457
chr149576158495761814E068-42042
chr149576289295763161E068-40695
chr149576331195763774E068-40082
chr149576397195764116E068-39740
chr149576420995764365E068-39491
chr149576437895764509E068-39347
chr149576497095765020E068-38836
chr149576505995765109E068-38747
chr149576588095765920E068-37936
chr149576736095767532E068-36324
chr149576764495767739E068-36117
chr149576798695768327E068-35529
chr149576927795769327E068-34529
chr149576937695769430E068-34426
chr149576949295769543E068-34313
chr149576969395769743E068-34113
chr149577000095770210E068-33646
chr149577062895770678E068-33178
chr149577084495770884E068-32972
chr149577135295771416E068-32440
chr149577145795771517E068-32339
chr149577162995771727E068-32129
chr149577194195772001E068-31855
chr149577334495773414E068-30442
chr149577372695774620E068-29236
chr149577469395774743E068-29113
chr149577491395774969E068-28887
chr149577535395775393E068-28463
chr149577541395775564E068-28292
chr149577568695775769E068-28087
chr149577580895775948E068-27908
chr149577598595776035E068-27821
chr149577618195776233E068-27623
chr149577634995776424E068-27432
chr149577660695776661E068-27195
chr149577670795776946E068-26910
chr149577712095777265E068-26591
chr149577734995777574E068-26282
chr149577775395777879E068-25977
chr149577797295778143E068-25713
chr149577819495778330E068-25526
chr149577876095778836E068-25020
chr149577886695778963E068-24893
chr149577914195779191E068-24665
chr149577961295780731E068-23125
chr149578085895780912E068-22944
chr149578094395781535E068-22321
chr149578160095781890E068-21966
chr149578197995782197E068-21659
chr149578255695782614E068-21242
chr149578271195782798E068-21058
chr149578280195782855E068-21001
chr149578285695783045E068-20811
chr149578312095783194E068-20662
chr149578707895787550E068-16306
chr149582633695827422E06822480
chr149582747695829371E06823620
chr149575398095754030E069-49826
chr149575406895754123E069-49733
chr149575477695754893E069-48963
chr149575528195755399E069-48457
chr149575556695755616E069-48240
chr149575614095756196E069-47660
chr149575642695756496E069-47360
chr149575664595756702E069-47154
chr149575684695756918E069-46938
chr149575694995757034E069-46822
chr149575704595757946E069-45910
chr149575801595758575E069-45281
chr149575858195758633E069-45223
chr149575893795759025E069-44831
chr149575905595759264E069-44592
chr149575931895759365E069-44491
chr149576012595760206E069-43650
chr149576023195760343E069-43513
chr149576063695760696E069-43160
chr149576076395760848E069-43008
chr149576088595760965E069-42891
chr149576103495761148E069-42708
chr149576132095761399E069-42457
chr149576158495761814E069-42042
chr149576289295763161E069-40695
chr149576331195763774E069-40082
chr149576397195764116E069-39740
chr149576420995764365E069-39491
chr149576437895764509E069-39347
chr149576497095765020E069-38836
chr149576505995765109E069-38747
chr149576736095767532E069-36324
chr149576764495767739E069-36117
chr149576798695768327E069-35529
chr149576927795769327E069-34529
chr149576937695769430E069-34426
chr149576949295769543E069-34313
chr149577000095770210E069-33646
chr149577084495770884E069-32972
chr149577135295771416E069-32440
chr149577145795771517E069-32339
chr149577162995771727E069-32129
chr149577194195772001E069-31855
chr149577310495773183E069-30673
chr149577334495773414E069-30442
chr149577372695774620E069-29236
chr149577469395774743E069-29113
chr149577491395774969E069-28887
chr149577535395775393E069-28463
chr149577541395775564E069-28292
chr149577568695775769E069-28087
chr149577580895775948E069-27908
chr149577598595776035E069-27821
chr149577618195776233E069-27623
chr149577634995776424E069-27432
chr149577660695776661E069-27195
chr149577670795776946E069-26910
chr149577712095777265E069-26591
chr149577734995777574E069-26282
chr149577775395777879E069-25977
chr149577797295778143E069-25713
chr149577819495778330E069-25526
chr149577876095778836E069-25020
chr149577886695778963E069-24893
chr149577914195779191E069-24665
chr149577961295780731E069-23125
chr149578085895780912E069-22944
chr149578094395781535E069-22321
chr149578160095781890E069-21966
chr149578197995782197E069-21659
chr149578255695782614E069-21242
chr149578271195782798E069-21058
chr149578285695783045E069-20811
chr149578312095783194E069-20662
chr149582618995826302E06922333
chr149582633695827422E06922480
chr149582747695829371E06923620
chr149585379095853840E06949934
chr149576969395769743E070-34113
chr149577000095770210E070-33646
chr149577062895770678E070-33178
chr149577084495770884E070-32972
chr149577135295771416E070-32440
chr149578285695783045E070-20811
chr149578312095783194E070-20662
chr149575398095754030E071-49826
chr149575406895754123E071-49733
chr149575477695754893E071-48963
chr149575528195755399E071-48457
chr149575614095756196E071-47660
chr149575642695756496E071-47360
chr149575664595756702E071-47154
chr149575684695756918E071-46938
chr149575694995757034E071-46822
chr149575704595757946E071-45910
chr149575801595758575E071-45281
chr149575858195758633E071-45223
chr149575893795759025E071-44831
chr149575905595759264E071-44592
chr149575931895759365E071-44491
chr149576063695760696E071-43160
chr149576076395760848E071-43008
chr149576088595760965E071-42891
chr149576103495761148E071-42708
chr149576132095761399E071-42457
chr149576158495761814E071-42042
chr149576289295763161E071-40695
chr149576331195763774E071-40082
chr149576397195764116E071-39740
chr149576420995764365E071-39491
chr149576437895764509E071-39347
chr149576497095765020E071-38836
chr149576505995765109E071-38747
chr149576588095765920E071-37936
chr149576653795766911E071-36945
chr149576736095767532E071-36324
chr149576764495767739E071-36117
chr149576798695768327E071-35529
chr149576927795769327E071-34529
chr149576937695769430E071-34426
chr149576949295769543E071-34313
chr149576969395769743E071-34113
chr149577000095770210E071-33646
chr149577062895770678E071-33178
chr149577084495770884E071-32972
chr149577135295771416E071-32440
chr149577145795771517E071-32339
chr149577162995771727E071-32129
chr149577194195772001E071-31855
chr149577310495773183E071-30673
chr149577469395774743E071-29113
chr149577491395774969E071-28887
chr149577535395775393E071-28463
chr149577541395775564E071-28292
chr149577568695775769E071-28087
chr149577580895775948E071-27908
chr149577598595776035E071-27821
chr149577618195776233E071-27623
chr149577634995776424E071-27432
chr149577660695776661E071-27195
chr149577670795776946E071-26910
chr149577712095777265E071-26591
chr149577734995777574E071-26282
chr149577775395777879E071-25977
chr149577797295778143E071-25713
chr149577819495778330E071-25526
chr149577876095778836E071-25020
chr149577886695778963E071-24893
chr149577914195779191E071-24665
chr149577961295780731E071-23125
chr149578085895780912E071-22944
chr149578094395781535E071-22321
chr149578160095781890E071-21966
chr149578197995782197E071-21659
chr149578312095783194E071-20662
chr149578323195783539E071-20317
chr149578707895787550E071-16306
chr149578762795788059E071-15797
chr149579450195794817E071-9039
chr149579489895795138E071-8718
chr149579530395795580E071-8276
chr149582618995826302E07122333
chr149582633695827422E07122480
chr149582747695829371E07123620
chr149585379095853840E07149934
chr149575398095754030E072-49826
chr149575406895754123E072-49733
chr149575477695754893E072-48963
chr149575528195755399E072-48457
chr149575556695755616E072-48240
chr149575614095756196E072-47660
chr149575642695756496E072-47360
chr149575664595756702E072-47154
chr149575684695756918E072-46938
chr149575694995757034E072-46822
chr149575704595757946E072-45910
chr149575801595758575E072-45281
chr149575858195758633E072-45223
chr149575893795759025E072-44831
chr149575905595759264E072-44592
chr149575931895759365E072-44491
chr149576063695760696E072-43160
chr149576076395760848E072-43008
chr149576088595760965E072-42891
chr149576103495761148E072-42708
chr149576132095761399E072-42457
chr149576158495761814E072-42042
chr149576289295763161E072-40695
chr149576331195763774E072-40082
chr149576397195764116E072-39740
chr149576420995764365E072-39491
chr149576437895764509E072-39347
chr149576497095765020E072-38836
chr149576505995765109E072-38747
chr149576588095765920E072-37936
chr149576653795766911E072-36945
chr149576736095767532E072-36324
chr149576764495767739E072-36117
chr149576798695768327E072-35529
chr149576927795769327E072-34529
chr149576937695769430E072-34426
chr149576949295769543E072-34313
chr149576969395769743E072-34113
chr149577000095770210E072-33646
chr149577062895770678E072-33178
chr149577135295771416E072-32440
chr149577145795771517E072-32339
chr149577162995771727E072-32129
chr149577194195772001E072-31855
chr149577310495773183E072-30673
chr149577372695774620E072-29236
chr149577469395774743E072-29113
chr149577491395774969E072-28887
chr149577535395775393E072-28463
chr149577541395775564E072-28292
chr149577568695775769E072-28087
chr149577580895775948E072-27908
chr149577598595776035E072-27821
chr149577618195776233E072-27623
chr149577634995776424E072-27432
chr149577660695776661E072-27195
chr149577670795776946E072-26910
chr149577712095777265E072-26591
chr149577734995777574E072-26282
chr149577775395777879E072-25977
chr149577797295778143E072-25713
chr149577819495778330E072-25526
chr149577876095778836E072-25020
chr149577886695778963E072-24893
chr149577914195779191E072-24665
chr149577961295780731E072-23125
chr149578085895780912E072-22944
chr149578094395781535E072-22321
chr149578160095781890E072-21966
chr149578197995782197E072-21659
chr149578255695782614E072-21242
chr149578271195782798E072-21058
chr149578285695783045E072-20811
chr149578312095783194E072-20662
chr149578707895787550E072-16306
chr149582618995826302E07222333
chr149582633695827422E07222480
chr149585379095853840E07249934
chr149575398095754030E073-49826
chr149575406895754123E073-49733
chr149575642695756496E073-47360
chr149575664595756702E073-47154
chr149575684695756918E073-46938
chr149575694995757034E073-46822
chr149575704595757946E073-45910
chr149575801595758575E073-45281
chr149575858195758633E073-45223
chr149575893795759025E073-44831
chr149575905595759264E073-44592
chr149575931895759365E073-44491
chr149575950995759568E073-44288
chr149576012595760206E073-43650
chr149576023195760343E073-43513
chr149576158495761814E073-42042
chr149576397195764116E073-39740
chr149576420995764365E073-39491
chr149576437895764509E073-39347
chr149576497095765020E073-38836
chr149576505995765109E073-38747
chr149576588095765920E073-37936
chr149576653795766911E073-36945
chr149576736095767532E073-36324
chr149576764495767739E073-36117
chr149576798695768327E073-35529
chr149576927795769327E073-34529
chr149576937695769430E073-34426
chr149576949295769543E073-34313
chr149576969395769743E073-34113
chr149577062895770678E073-33178
chr149577084495770884E073-32972
chr149577135295771416E073-32440
chr149577145795771517E073-32339
chr149577162995771727E073-32129
chr149577194195772001E073-31855
chr149577310495773183E073-30673
chr149577334495773414E073-30442
chr149577372695774620E073-29236
chr149577469395774743E073-29113
chr149577491395774969E073-28887
chr149577535395775393E073-28463
chr149577541395775564E073-28292
chr149577568695775769E073-28087
chr149577580895775948E073-27908
chr149577598595776035E073-27821
chr149577618195776233E073-27623
chr149577634995776424E073-27432
chr149577660695776661E073-27195
chr149577670795776946E073-26910
chr149577712095777265E073-26591
chr149577734995777574E073-26282
chr149577876095778836E073-25020
chr149577886695778963E073-24893
chr149577914195779191E073-24665
chr149577961295780731E073-23125
chr149578085895780912E073-22944
chr149578094395781535E073-22321
chr149578197995782197E073-21659
chr149578255695782614E073-21242
chr149578271195782798E073-21058
chr149578707895787550E073-16306
chr149579747695797861E073-5995
chr149579789195797931E073-5925
chr149582618995826302E07322333
chr149582633695827422E07322480
chr149585379095853840E07349934
chr149575398095754030E074-49826
chr149575406895754123E074-49733
chr149575642695756496E074-47360
chr149575664595756702E074-47154
chr149575684695756918E074-46938
chr149575694995757034E074-46822
chr149575704595757946E074-45910
chr149575801595758575E074-45281
chr149575858195758633E074-45223
chr149575893795759025E074-44831
chr149575905595759264E074-44592
chr149576012595760206E074-43650
chr149576023195760343E074-43513
chr149576063695760696E074-43160
chr149576076395760848E074-43008
chr149576088595760965E074-42891
chr149576103495761148E074-42708
chr149576132095761399E074-42457
chr149576158495761814E074-42042
chr149576289295763161E074-40695
chr149576331195763774E074-40082
chr149576397195764116E074-39740
chr149576420995764365E074-39491
chr149576437895764509E074-39347
chr149576497095765020E074-38836
chr149576505995765109E074-38747
chr149576588095765920E074-37936
chr149576653795766911E074-36945
chr149576736095767532E074-36324
chr149576764495767739E074-36117
chr149576798695768327E074-35529
chr149576927795769327E074-34529
chr149576937695769430E074-34426
chr149576949295769543E074-34313
chr149576969395769743E074-34113
chr149577000095770210E074-33646
chr149577062895770678E074-33178
chr149577084495770884E074-32972
chr149577135295771416E074-32440
chr149577145795771517E074-32339
chr149577162995771727E074-32129
chr149577194195772001E074-31855
chr149577310495773183E074-30673
chr149577334495773414E074-30442
chr149577372695774620E074-29236
chr149577469395774743E074-29113
chr149577491395774969E074-28887
chr149577535395775393E074-28463
chr149577541395775564E074-28292
chr149577568695775769E074-28087
chr149577580895775948E074-27908
chr149577598595776035E074-27821
chr149577618195776233E074-27623
chr149577634995776424E074-27432
chr149577660695776661E074-27195
chr149577670795776946E074-26910
chr149577712095777265E074-26591
chr149577734995777574E074-26282
chr149577775395777879E074-25977
chr149577797295778143E074-25713
chr149577819495778330E074-25526
chr149577876095778836E074-25020
chr149577886695778963E074-24893
chr149577914195779191E074-24665
chr149577961295780731E074-23125
chr149578085895780912E074-22944
chr149578094395781535E074-22321
chr149578160095781890E074-21966
chr149578197995782197E074-21659
chr149578255695782614E074-21242
chr149578271195782798E074-21058
chr149578280195782855E074-21001
chr149578285695783045E074-20811
chr149578312095783194E074-20662
chr149578707895787550E074-16306
chr149582558295825632E07421726
chr149582586395825917E07422007
chr149582618995826302E07422333
chr149582633695827422E07422480
chr149582747695829371E07423620
chr149582951495829617E07425658
chr149583000295830262E07426146
chr149585344995853569E07449593
chr149585379095853840E07449934
chr149575893795759025E081-44831
chr149575905595759264E081-44592
chr149575931895759365E081-44491
chr149579489895795138E082-8718
chr149579530395795580E082-8276
chr149579561595795978E082-7878










Promoter Annotation (GRCh37.p13)

Chromosome Start End Region Distance(-/+:Up/Downstream)
chr149578403395784124E067-19732
chr149578426095784300E067-19556
chr149578434995784440E067-19416
chr149578444495787036E067-16820
chr149578403395784124E068-19732
chr149578426095784300E068-19556
chr149578434995784440E068-19416
chr149578444495787036E068-16820
chr149578403395784124E069-19732
chr149578426095784300E069-19556
chr149578434995784440E069-19416
chr149578444495787036E069-16820
chr149578444495787036E070-16820
chr149578403395784124E071-19732
chr149578426095784300E071-19556
chr149578434995784440E071-19416
chr149578444495787036E071-16820
chr149578403395784124E072-19732
chr149578426095784300E072-19556
chr149578434995784440E072-19416
chr149578444495787036E072-16820
chr149578426095784300E073-19556
chr149578434995784440E073-19416
chr149578444495787036E073-16820
chr149578403395784124E074-19732
chr149578426095784300E074-19556
chr149578434995784440E074-19416
chr149578444495787036E074-16820
chr149578444495787036E082-16820