DegronMD: protein-targeted degradation, mutation and drug response to degrons
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BSML
CPH
CGC
Degron:
TRESLAAIE
Uniprot ID:
Q14524
Source protein:
Sodium channel protein type 5 subunit alpha
Source gene:
SCN5A
Class:
DEG_APCC_DBOX_1
Location:
17:25
E3 ligase:
APC,CDC20,FZR1
DEGRON score:
0.9505
ASA_SCORE:
74.9778
COIL:
0.2054
CONS_SCORE:
0.2951
DSS_SCORE:
0.4444
HELIX:
0.7933
FCONS_SCORE:
1.0944
RIG_SCORE:
0.7896
Degron related mutations and impact score
Mutation
Sample
Cancer
Dataset
Degron
Degron class
Impact score
p.E30K
TCGA-13-2060
OV
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.E30K
DO30170
OV
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R15S
TCGA-22-1016
LUSC
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R15S
DO26971
LUSC
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.E19Q
TCGA-98-A53I
LUSC
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.5633
p.E19Q
DO219182
LUSC
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.5633
p.R27H
TCGA-AJ-A5DW
UCEC
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R27H
TCGA-D7-A6EY
STAD
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R27H
DO225398
BRCA
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R27H
DO50118
STAD
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R27H
DO50075
UCEC
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R34H
TCGA-AX-A2HA
UCEC
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34H
DO42504
UCEC
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R14C
TCGA-DF-A2KU
UCEC
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.25
p.R14C
DO223286
UCEC
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.25
p.R14C
SIDM01086
B-Lymphoblastic Leukemia
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.25
p.R14C
ACH-000874
Leukemia
CCLE
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.25
p.R14C
RS4-11
haematopoietic_and_lymphoid_tissue
COSMIC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.25
p.R8W
TCGA-EE-A2MS
SKCM
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R8W
DO37567
SKCM
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R27C
TCGA-HT-A5RC
LGG
TCGA
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R27C
DO48525
LGG
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.E25K
DO222835
COCA
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.591
p.A29V
DO233113
GACA
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2222
p.M28I
DO233613
GACA
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.25
p.A29T
DO233867
GACA
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2222
p.T10N
DO231972
LICA
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.1389
p.G9V
DO23374
LINC
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.1111
p.K31Q
DO230554
LUSC
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R18W
DO228869
MALY
ICGC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.8634
p.R34C
SIDM00969
Ovarian Carcinoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM00087
Plasma Cell Myeloma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM00746
Non-Small Cell Lung Carcinoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM00650
Small Cell Lung Carcinoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM00498
Colorectal Carcinoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM00048
Non-Small Cell Lung Carcinoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM00539
Esophageal Carcinoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM00793
Burkitt's Lymphoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM01681
Non-Cancerous
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.R34C
SIDM01689
B-Lymphoblastic Leukemia
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.S11I
SIDM00293
Small Cell Lung Carcinoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.6111
p.S11I
ACH-002052
Lung Cancer
CCLE
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.6111
p.S11I
LU-139
lung
COSMIC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.6111
p.G35S
SIDM00063
Melanoma
GDSC
TRESLAAIE
DEG_APCC_DBOX_1
0.0556
Drug responses associated with SCN5A mutations
Sample
Cancer
Mutation (In Degron?)
Dataset
Drug
IC50
All proteins holding degron of TRESLAAIE
Uniprot ID
Source protein
Degron class
Location
Hit
E3 ligase
Degron score
Detail
Q14524
Sodium channel protein type 5 subunit alpha
DEG_APCC_DBOX_1
17:25
TRESLAAIE
APC,CDC20,FZR1
0.9505
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