DegronMD: protein-targeted degradation, mutation and drug response to degrons
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BSML
CPH
CGC
Degron:
TTPSQNEVPEV
Uniprot ID:
P49418
Source protein:
Amphiphysin
Source gene:
AMPH
Class:
DEG_COP1_1
Location:
335:345
E3 ligase:
COP1
DEGRON score:
0.9151
ASA_SCORE:
90.5455
COIL:
0.8749
CONS_SCORE:
0.3429
DSS_SCORE:
0.529
HELIX:
0.0795
FCONS_SCORE:
1.0882
RIG_SCORE:
0.7209
Degron related mutations and impact score
Mutation
Sample
Cancer
Dataset
Degron
Degron class
Impact score
p.Q339L
TCGA-44-5644
LUAD
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.6654
p.Q339L
DO25153
LUAD
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.6654
p.D355Y
TCGA-77-8133
LUSC
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.0556
p.D355Y
DO27039
LUSC
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.0556
p.P337H
TCGA-78-7148
LUAD
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.6583
p.P337H
DO26112
LUAD
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.6583
p.L354M
TCGA-A5-A2K5
UCEC
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.0833
p.L354M
DO41379
UCEC
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.0833
p.K346N
TCGA-AX-A2HC
UCEC
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.3056
p.K346N
DO41572
UCEC
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.3056
p.K347N
TCGA-BR-8059
STAD
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.2778
p.K347N
DO38443
STAD
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.2778
p.P343H
TCGA-EE-A2GN
SKCM
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7694
p.P343H
DO37896
SKCM
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7694
p.E344K
TCGA-GV-A3QK
BLCA
TCGA
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7022
p.E344K
DO563
BLCA
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7022
p.E344K
DO50388
ESAD
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7022
p.E349D
DO233758
GACA
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.2222
p.T335K
DO229045
LICA
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7306
p.V342F
DO45233
LIRI
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7068
p.D355N
DO220891
MELA
ICGC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.0556
p.E344G
SIDM02021
Esophageal Carcinoma
GDSC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.7199
p.S333N
SIDM00845
Burkitt's Lymphoma
GDSC
TTPSQNEVPEV
DEG_COP1_1
0.2778
Drug responses associated with AMPH mutations
Sample
Cancer
Mutation (In Degron?)
Dataset
Drug
IC50
All proteins holding degron of TTPSQNEVPEV
Uniprot ID
Source protein
Degron class
Location
Hit
E3 ligase
Degron score
Detail
P49418
Amphiphysin
DEG_COP1_1
335:345
TTPSQNEVPEV
COP1
0.9151
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