DegronMD: protein-targeted degradation, mutation and drug response to degrons
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BSML
CPH
CGC
Degron:
TTPSVPSL
Uniprot ID:
Q969W3
Source protein:
Protein FAM104A
Source gene:
FAM104A
Class:
DEG_COP1_1
Location:
46:53
E3 ligase:
COP1
DEGRON score:
0.9956
ASA_SCORE:
68.4375
COIL:
0.8419
CONS_SCORE:
0.417
DSS_SCORE:
0.7756
HELIX:
0.068
FCONS_SCORE:
1.0046
RIG_SCORE:
0.6103
Degron related mutations and impact score
Mutation
Sample
Cancer
Dataset
Degron
Degron class
Impact score
p.L53F
TCGA-BA-5152
HNSC
TCGA
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.587
p.L53F
DO14393
HNSC
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.587
p.P51S
TCGA-EB-A3XC
SKCM
TCGA
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.6752
p.P51S
DO37579
SKCM
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.6752
p.S52C
TCGA-EK-A2RM
CESC
TCGA
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.7541
p.S52C
DO49956
CESC
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.7541
p.S52F
TCGA-GS-A9TZ
DLBC
TCGA
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.7982
p.S52F
DO219918
DLBC
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.7982
p.G53R
DO222765
COCA
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.7568
p.E44Q
DO16678
KIRC
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.2778
p.P63H
DO228976
LICA
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.0556
p.N57K
DO228971
LICA
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.2222
p.A56E
DO229025
LICA
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.25
p.S55R
DO229035
LICA
ICGC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.2778
p.P48R
SIDM01141
Ovarian Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.6401
p.G41V
SIDM00617
Hepatocellular Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM00075
Non-Cancerous
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM00348
Esophageal Squamous Cell Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM00552
Rhabdomyosarcoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM01653
Non-Cancerous
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM00271
Gastric Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM00306
Non-Small Cell Lung Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM01372
Pancreatic Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM01608
Endometrial Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM01617
Endometrial Carcinoma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.G41V
SIDM01473
Plasma Cell Myeloma
GDSC
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1944
p.R36P
ACH-000490
Cervical Cancer
CCLE
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.0556
p.T47A
ACH-000969
Colon/Colorectal Cancer
CCLE
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.825
p.S60G
ACH-002080
Neuroblastoma
CCLE
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.1389
p.P48L
ACH-002512
Skin Cancer
CCLE
TTPSVPSL
DEG_COP1_1
0.6471
Drug responses associated with FAM104A mutations
Sample
Cancer
Mutation (In Degron?)
Dataset
Drug
IC50
All proteins holding degron of TTPSVPSL
Uniprot ID
Source protein
Degron class
Location
Hit
E3 ligase
Degron score
Detail
Q969W3
Protein FAM104A
DEG_COP1_1
46:53
TTPSVPSL
COP1
0.9956
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