DegronMD: protein-targeted degradation, mutation and drug response to degrons
Home
(current)
Browse
Proteins/Degrons
Mutations
Drug response
Network-rewiring
Drug resistance
Search
Tutorial
Download
Contact
Links
BSML
CPH
CGC
Degron:
VRPPLGDLS
Uniprot ID:
Q5VST9
Source protein:
Obscurin
Source gene:
OBSCN
Class:
DEG_APCC_DBOX_1
Location:
4855:4863
E3 ligase:
APC,CDC20,FZR1
DEGRON score:
0.9754
ASA_SCORE:
58.1111
COIL:
0.6757
CONS_SCORE:
0.2833
DSS_SCORE:
0.6376
HELIX:
0.0371
FCONS_SCORE:
0.8326
RIG_SCORE:
0.6821
Degron related mutations and impact score
Mutation
Sample
Cancer
Dataset
Degron
Degron class
Impact score
p.R4850L
TCGA-37-4135
LUSC
TCGA
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R4850L
DO26806
LUSC
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.L4853Q
TCGA-A6-6653
COAD
TCGA
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.L4853Q
DO10373
COAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.R4850Q
TCGA-D3-A51N
SKCM
TCGA
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R4850Q
DO47274
SKCM
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.A4858V
TCGA-G4-6297
COAD
TCGA
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6936
p.A4858V
DO9418
COAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6936
p.A4858V
DO228618
GACA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6936
p.A4858V
SIDM02041
Colorectal Carcinoma
GDSC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6936
p.A4858V
SIDM00217
Colorectal Carcinoma
GDSC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6936
p.A4858V
ACH-000999
Colon/Colorectal Cancer
CCLE
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6936
p.A4858V
SNU-1040
large_intestine
COSMIC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6936
p.E4872K
TCGA-HQ-A5NE
BLCA
TCGA
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.E4872K
DO51900
BLCA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.Q4867K
TCGA-HU-8238
STAD
TCGA
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.2222
p.Q4867K
DO47944
STAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.2222
p.T4865P
TCGA-VP-AA1N
PRAD
TCGA
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.T4865P
DO51393
PRAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.2778
p.S4871L
DO4810
BRCA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.5556
p.R4856H
DO8842
COAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.8244
p.S4854L
DO233869
GACA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.3056
p.E4850D
DO229027
LICA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.S4863I
DO229038
LICA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.623
p.M4872I
DO45314
LUAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.M4872K
DO45314
LUAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.M4872V
DO23976
LUAD
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.0833
p.P4845S
DO220882
MELA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.0556
p.E4856D
DO232832
NACA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6758
p.Q4859R
DO233297
NACA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.7329
p.A4854S
DO27921
ORCA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.3056
p.Q4848H
DO31510
OV
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1389
p.P4870S
DO229453
SKCA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1389
p.P4870S
DO41235
UCEC
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1389
p.Q4847R
DO229268
THCA
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1111
p.G4868C
DO42336
UCEC
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R4856C
DO43186
UCEC
ICGC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.8301
p.Q4854H
SIDM00963
Breast Carcinoma
GDSC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.3056
p.Q4854H
BT-474
breast
COSMIC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.3056
p.R4850W
SIDM00585
Hepatocellular Carcinoma
GDSC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R4850W
SIDM00217
Colorectal Carcinoma
GDSC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R4850W
SIDM01619
Endometrial Carcinoma
GDSC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R4850W
SNU-1040
large_intestine
COSMIC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.R4850W
HuH-7
liver
COSMIC
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.1944
p.D4866H
ACH-000071
Non-Cancerous
CCLE
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.25
p.S4862Y
ACH-001369
Ovarian Cancer
CCLE
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.712
p.E4860D
ACH-001796
Liposarcoma
CCLE
VRPPLGDLS
DEG_APCC_DBOX_1
0.6758
Drug responses associated with OBSCN mutations
Sample
Cancer
Mutation (In Degron?)
Dataset
Drug
IC50
All proteins holding degron of VRPPLGDLS
Uniprot ID
Source protein
Degron class
Location
Hit
E3 ligase
Degron score
Detail
Q5VST9
Obscurin
DEG_APCC_DBOX_1
4855:4863
VRPPLGDLS
APC,CDC20,FZR1
0.9754
More...